| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,977,227 | T→A | 15.1% | intergenic (‑88/+39) | motA ← / ← flhC | proton conductor component of flagella motor/flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,977,227 | 0 | T | A | 15.1% | 248.1 / 35.4 | 100 | intergenic (‑88/+39) | motA/flhC | proton conductor component of flagella motor/flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/43); new base A (8/7); total (50/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
AAGATAAGCACGACATCATCCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGG > NC_000913/1977129‑1977326 | aagataagCACGACATCATCCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑cgtc > 1:2400809/1‑100 (MQ=255) agataagCACGACATCATCCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑cgtcg > 1:1126535/1‑100 (MQ=255) taagCACGACATCATCCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑GGTCGTTa < 2:1354330/100‑1 (MQ=255) aagCACGACATCATCCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTAc > 1:958694/1‑100 (MQ=255) gCACGACATCATCCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCg > 2:658000/1‑100 (MQ=255) aagACATCACACTTCAACTGAGGACCATGAAAGGATATGCAATCGTAAGGAGTTAACGCGCGATTAGAGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑cgtcgt < 1:767425/91‑1 (MQ=255) aCATCATCCTTCCACTGTTGACCATGACATGATGTTCAGGCGTCAGGCGTTAACGCGCGAGTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTAA‑CGACG‑TACCgctgct < 1:1558827/100‑1 (MQ=37) aCATCATCCTTCCACTGTCTACCATGAAAGGATGTTTAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCgctg < 1:2371316/98‑1 (MQ=255) catcatCCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTAA‑CGACG‑TACCgctgctt < 2:2347856/100‑2 (MQ=38) catcatCCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGctgctg > 1:2402711/1‑100 (MQ=255) atcatcCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTAA‑CGACG‑TACCgctgct < 1:801137/98‑1 (MQ=38) catcCTTCTACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTAA‑CGACG‑TACCgctgcttttt < 2:1100017/100‑5 (MQ=37) catcCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGaa > 2:95721/1‑100 (MQ=255) catcCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGaa > 2:55105/1‑100 (MQ=255) atcCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAAt < 1:1345791/100‑1 (MQ=255) tcCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTAA‑CGACG‑TACCgctgcttttttt < 2:227329/100‑7 (MQ=37) ccTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGTAA‑CGACG‑TACCgctgctttttttt < 1:1893808/100‑8 (MQ=37) ccTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGt > 2:986762/1‑100 (MQ=255) cTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGtt > 2:2260300/1‑100 (MQ=255) ttCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTCCCGCTGCTGGAATGTTg < 2:1598123/100‑1 (MQ=255) ttCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTg < 1:1939739/100‑1 (MQ=255) tCCACTGTTGAACATGACAGGATGTTCAGTCGTTAGGCCTTAACGCGCGATTGGGGGCAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGGCGTTACCGGTGCTGGAATGTTg > 1:834592/1‑99 (MQ=255) ccACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTgcg > 1:1838895/1‑100 (MQ=255) ccACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTgcg > 2:865566/1‑100 (MQ=255) cACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTgcgc > 1:1490016/1‑100 (MQ=255) aCTGTTGACCATTACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATCGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGcc < 1:2298871/100‑1 (MQ=255) aCTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGTAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGcc < 1:265415/100‑1 (MQ=255) aCTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGcc < 2:1357552/100‑1 (MQ=255) cTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGcc < 1:1117643/99‑1 (MQ=255) aCCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGt < 1:233171/100‑1 (MQ=255) ccATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTa < 2:1510102/100‑1 (MQ=255) aTGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATc < 2:1666216/100‑1 (MQ=255) aTGAAAGGATGTTCAGTCGTTAGGTGTTAACGCGAGATTGAGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCg < 1:327227/96‑1 (MQ=255) gACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACGGTATc < 1:433703/98‑1 (MQ=255) gACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAg < 2:457456/100‑1 (MQ=255) aCAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGt > 2:2110357/1‑100 (MQ=255) cAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGtt > 1:2150561/1‑100 (MQ=255) cAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGtt < 1:2110343/100‑1 (MQ=255) ggATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTaa > 2:2087284/1‑100 (MQ=255) ggATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTaa > 2:551350/1‑100 (MQ=255) ggATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATAAGTTa > 1:1541843/1‑99 (MQ=255) aTGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAAc < 2:1524857/100‑1 (MQ=255) ttCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTACTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGc > 2:1151531/1‑100 (MQ=255) tCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGcc < 2:1428361/100‑1 (MQ=255) tCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGcc < 1:1349618/100‑1 (MQ=255) tCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGcc < 2:905224/100‑1 (MQ=255) cAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCt < 2:2080711/100‑1 (MQ=255) cAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCt > 1:811069/1‑100 (MQ=255) aGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCATTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTg > 1:900636/1‑100 (MQ=255) gtcTGGAGTTCATGCGCGATCGGATCATAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTAGTTACCGCTGTTGGAATGTTGCGCATAACCGTAACAGTTAAACAGACTGTAc > 1:1533610/1‑99 (MQ=255) gtcAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTAct > 1:1992079/1‑100 (MQ=255) tcAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTActc < 2:1126539/100‑1 (MQ=255) tcAGGCGTTAACGCGCGATGGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTActc < 2:2191122/100‑1 (MQ=255) cAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGAAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTACACAGCCTGTAct > 1:2222907/1‑98 (MQ=255) aGGCGTTAACGCGCGATAGGGACAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTActctc < 1:1739353/100‑1 (MQ=255) ggCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTActctct < 2:2311288/100‑1 (MQ=255) gCGTTCAGGCGCGATTGTTTAAAAAAAAACTAGCGGT‑A‑CGTCGCTAGCGCTGTTGGAATGTGGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTActct < 1:485805/97‑1 (MQ=255) cGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGt < 1:511556/100‑1 (MQ=255) cGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGt > 2:1539027/1‑100 (MQ=255) cGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGt > 1:1084360/1‑100 (MQ=255) gTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGtt > 1:1489138/1‑100 (MQ=255) gTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGtt > 1:177566/1‑100 (MQ=255) gTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGtt < 1:657997/100‑1 (MQ=255) gTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGtt < 2:2331558/100‑1 (MQ=255) ttAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCGGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGGTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGtt < 1:985537/99‑1 (MQ=255) ttAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTc < 2:793453/100‑1 (MQ=255) aaCTCGCGATTTTGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCTTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGtt < 1:527782/97‑1 (MQ=255) cgcgcgATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATcc < 1:1152720/100‑1 (MQ=255) gcgcgATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCca > 2:2404285/1‑100 (MQ=255) gcgcgATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCca > 1:601276/1‑100 (MQ=255) gcgcgATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCca < 2:177567/100‑1 (MQ=255) gcgcgATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCca < 2:393521/100‑1 (MQ=255) gcgATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCcagc < 1:1259530/100‑1 (MQ=255) ttGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGtt < 2:792148/100‑1 (MQ=255) tGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTtg > 2:1590335/1‑100 (MQ=255) gggCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTtgtg > 2:1369089/1‑100 (MQ=255) ggCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTgg > 2:2144550/1‑100 (MQ=255) gCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTggg > 1:4111/1‑100 (MQ=255) cAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGa < 1:526362/100‑1 (MQ=255) cAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGa < 1:1451006/100‑1 (MQ=255) aaaaaaaGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACGGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGa > 1:150318/1‑98 (MQ=255) aaaaaaaGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGata > 1:1092742/1‑100 (MQ=255) aaaaaaaGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGata > 2:672112/1‑100 (MQ=255) aaaaaaGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGataa > 2:1048150/1‑100 (MQ=255) cagcagcGGTAA‑CGACG‑TACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATc > 2:1210875/2‑100 (MQ=38) cagcagcGGTAA‑CGACG‑TACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATc > 2:132226/2‑100 (MQ=38) aaGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATc > 2:2387582/1‑100 (MQ=255) agcagcGGTAA‑CGACG‑TACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCg > 1:2155845/1‑100 (MQ=38) agcagcGGTAA‑CGACG‑TACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCg > 1:732022/1‑100 (MQ=38) gcagcGGTAA‑CGACG‑TACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCgg > 1:1026352/1‑100 (MQ=255) gcagcGGTAA‑CGACG‑TACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCgg > 2:219053/1‑100 (MQ=255) gcagcGGTAA‑CGACG‑TACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCgg > 2:8811/1‑100 (MQ=255) gcagcGGT‑ATCGACG‑TACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCgg > 1:1528557/1‑100 (MQ=255) gcagcGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCgg > 2:413642/1‑100 (MQ=255) cGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAgg < 2:815399/100‑1 (MQ=255) cGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAgg < 1:2560906/100‑1 (MQ=255) ggT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGa > 1:760389/1‑100 (MQ=255) t‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGAtt > 2:1391081/1‑100 (MQ=255) tcgtTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCCGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTgg > 2:389971/1‑100 (MQ=255) tcgtTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTgg < 1:2387567/100‑1 (MQ=255) | AAGATAAGCACGACATCATCCTTCCACTGTTGACCATGACAGGATGTTCAGTCGTCAGGCGTTAACGCGCGATTGGGGCAAAAAAAAGCAGCGGT‑A‑CGTCGTTACCGCTGCTGGAATGTTGCGCCTCACCGTATCAGTTAAACAGCCTGTACTCTCTGTTCATCCAGCAGTTGTGGGATAATATCGGCAGGATTCTGG > NC_000913/1977129‑1977326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |