Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,680,113 | G→A | 25.7% | P878L (CCG→CTG) | yphG ← | DUF4380 domain‑containing TPR repeat protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,680,113 | 0 | G | A | 25.7% | 192.2 / 65.6 | 113 | P878L (CCG→CTG) | yphG | DUF4380 domain‑containing TPR repeat protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/39); new base A (18/11); total (63/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.17e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.07e-01 |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
CAGGCCTGCTGCGGCTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGTCATGTCGTCGCGTTTC > NC_000913/2680014‑2680211 | naGGCCTGCTGCGACTGTCTGGCATCAAGATGCTGGCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAGCTGACTGGTGACGTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACg > 1:1848198/2‑100 (MQ=255) ggCCTGCTGCGGCTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACagg > 2:1615365/1‑100 (MQ=255) ccTGCTGCGGCTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTg < 2:1782070/100‑1 (MQ=255) ccTGCTGCGGCTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTg > 1:421596/1‑100 (MQ=255) tgcGGCTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAAtt < 1:1033966/100‑1 (MQ=255) tgcGGCTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAAtt > 1:2360126/1‑100 (MQ=255) cGGCTGTCTGGCATCTAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTg < 2:2554033/100‑1 (MQ=255) cGGCTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTg < 1:322670/100‑1 (MQ=255) cGGCTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTg > 2:306228/1‑100 (MQ=255) cGGCTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTg < 2:1246726/100‑1 (MQ=255) ggCTGTCTGGCATCAAGCTGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGATCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTg < 1:2273809/99‑1 (MQ=255) ggCTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTgc < 2:535998/100‑1 (MQ=255) cTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTgcgc > 1:2057696/1‑100 (MQ=255) ncTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTg > 1:118386/2‑100 (MQ=255) cTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTgg > 1:160586/1‑100 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGc < 1:1218279/100‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGc < 1:2257262/100‑1 (MQ=255) tGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGc < 1:831554/100‑1 (MQ=255) ggCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCATTCCCCGCCTTCACACAGGTGGAATTTGCGCGTggag > 2:754542/1‑98 (MQ=255) gCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCga < 1:267480/100‑1 (MQ=255) tCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCgaga < 1:2204064/99‑1 (MQ=255) gcatcttgatgcCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGaa > 2:531689/10‑100 (MQ=255) cAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGaa > 1:1367185/1‑99 (MQ=255) cAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGCAt > 1:2210227/1‑100 (MQ=255) aTGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAGACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCATGGCGAGAATGTcc > 1:250536/1‑100 (MQ=255) tgctgcCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTccg < 1:2250784/100‑1 (MQ=255) tactgcCAGGCGCATAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTccg > 2:1748622/3‑100 (MQ=255) gctgcCCGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACCGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTACCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGCGAATGTcc > 1:148680/1‑98 (MQ=255) gctgcCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTccgc > 1:582251/1‑100 (MQ=255) ctgcCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTccgcc > 1:2130443/1‑100 (MQ=255) tgcCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTccgccg < 1:1113279/100‑1 (MQ=255) cAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCtt > 1:2459227/1‑100 (MQ=255) cAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCtt > 1:2512024/1‑100 (MQ=255) cAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCtt < 2:1732793/100‑1 (MQ=255) ggCGCGTAATAAATGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTg < 2:177852/100‑1 (MQ=255) gcgcGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGt > 1:709313/1‑100 (MQ=255) cgcgTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGt > 1:1161971/1‑99 (MQ=255) cgcgTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTc < 2:1123903/100‑1 (MQ=255) cgcgTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTc > 1:1575402/1‑100 (MQ=255) cgTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTg > 2:2114985/1‑100 (MQ=255) cgTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTg > 1:1334971/1‑100 (MQ=255) gTAATAACTTGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGc < 1:1843961/100‑1 (MQ=255) taataaCTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGcc > 2:1462782/1‑100 (MQ=255) taataaCTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGcc < 1:2393354/100‑1 (MQ=255) aataaCTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCt > 2:61703/1‑100 (MQ=255) aaCTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGAc > 1:52853/1‑100 (MQ=255) aCTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGAcc > 1:1522222/1‑100 (MQ=255) gaggTTGGGGATAACCTGACTGGTTACCTTCCCTTCCCCGGCTTCTCACGGGTGGAATTGGCGCGGGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCGGcgt > 1:214364/3‑93 (MQ=255) tGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCg < 2:226148/100‑1 (MQ=255) gTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCg > 1:543228/1‑98 (MQ=255) gTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTg < 2:2459244/100‑1 (MQ=255) gTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTg < 2:1339997/100‑1 (MQ=255) gTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTg < 2:1568243/100‑1 (MQ=255) gTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTg > 1:589336/1‑100 (MQ=255) tGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTgag > 1:1281436/1‑100 (MQ=255) tGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAAGTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTgag < 1:2546198/100‑1 (MQ=255) aGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGAt > 1:2285139/1‑100 (MQ=255) aGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGAt > 2:2106248/1‑100 (MQ=255) ggATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATg > 2:1233664/1‑100 (MQ=255) ggATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATg > 2:373976/1‑100 (MQ=255) aTAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGcc > 2:1369474/1‑100 (MQ=255) aTAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGcc < 1:102380/100‑1 (MQ=255) aTAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGcc < 2:158212/100‑1 (MQ=255) aaCTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCcaca < 1:131709/100‑1 (MQ=255) tgactgGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAAt < 1:320857/100‑1 (MQ=255) tgactgGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAAt < 2:2502260/100‑1 (MQ=255) actgGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTg < 1:2129268/100‑1 (MQ=255) ctgGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGa > 1:1519262/1‑100 (MQ=255) ctgGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGa > 2:1480008/1‑100 (MQ=255) ctgGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGa < 2:1522231/100‑1 (MQ=255) ggTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGc < 2:531066/100‑1 (MQ=255) ggTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGc > 1:1018573/1‑100 (MQ=255) ggTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCAGTGAGATGCCACAAATTGAGc < 1:236744/100‑1 (MQ=255) ggTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGc > 1:2507058/1‑100 (MQ=255) tGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAg > 1:1624363/1‑100 (MQ=255) gACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGt > 1:401297/1‑100 (MQ=255) ccttcccttcCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTc > 2:1034204/1‑100 (MQ=255) ccttcccttcCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTc > 2:1034059/1‑100 (MQ=255) ccttcccttcCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTc > 2:2150476/1‑100 (MQ=255) ccttcccttcCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTc > 1:1075717/1‑100 (MQ=255) cttcccttccCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCt > 2:212800/1‑100 (MQ=255) cttcccttccCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCt > 2:268579/1‑100 (MQ=255) tcccttcccCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGc < 1:1783154/100‑1 (MQ=255) tcccttcccCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGc < 1:1075586/100‑1 (MQ=255) cccttcccCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTgn < 1:1921358/99‑2 (MQ=255) cccttcccCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCg > 1:1049891/1‑100 (MQ=255) cccttcccCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCg > 2:111555/1‑100 (MQ=255) ccttcccCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTGTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCgg < 1:202568/100‑1 (MQ=255) cttcccCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGt > 2:2011954/1‑100 (MQ=255) cttcccCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGt > 1:1480368/1‑100 (MQ=255) cttcccCGCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGt > 1:1201749/1‑100 (MQ=255) cccGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGTCAtn < 2:118387/100‑2 (MQ=255) cccGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGTCATg > 1:402897/1‑100 (MQ=255) ccGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGTCATgt > 2:179088/1‑100 (MQ=255) gCCTTCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGTCATgtcg < 2:2507077/100‑1 (MQ=255) ttCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGTCATGtcgtcg < 1:1951823/100‑1 (MQ=255) ttCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGTCATGtcgtcg < 1:2476327/100‑1 (MQ=255) ttCCCACAGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGTCATGtcgtcg < 1:832173/100‑1 (MQ=255) tCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGTCATGTCGTcgc > 2:828251/1‑100 (MQ=255) cccACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGTCATGTCGTcgcg > 2:359277/1‑100 (MQ=255) | CAGGCCTGCTGCGGCTGTCTGGCATCAAGATGCTGCCAGGCGCGTAATAACTGGTTGAGGATAAACTGACTGGTGACCTTCCCTTCCCCGCCTTCCCACGGGTGGAATTTGCGCGTGGCGAGAATGTCCGCCGCTTTGTCTGCCTGACCCGTGAGATGCCACAAATTGAGCAGTTCTGCGGTCATGTCGTCGCGTTTC > NC_000913/2680014‑2680211 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |