| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,962,562 | T→C | 16.0% | N68S (AAC→AGC) ‡ | ppdC ← | putative prepilin peptidase‑dependent protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,962,562 | 0 | T | C | 16.0% | 267.2 / 41.1 | 120 | N68S (AAC→AGC) | ppdC | putative prepilin peptidase‑dependent protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/52); new base C (8/11); total (56/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GGCGGGTCATCTCGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGTT > NC_000913/2962464‑2962660 | ggCGGGTCATCTCGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGtt > 1:501509/1‑100 (MQ=255) gggTCATCTCGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGc < 2:1765837/100‑1 (MQ=255) ggTCATCTCGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAATCTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCa < 1:1536138/100‑1 (MQ=255) ggTCATCTCGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGCCACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCa > 1:1555459/1‑100 (MQ=255) tCATCTCGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCTAGTTGGCAgg > 1:1695360/1‑100 (MQ=255) cATCTCGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAgg > 1:2393506/1‑99 (MQ=255) aTCTCGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTg < 2:2047712/100‑1 (MQ=255) aTCTCGCCTTCCCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCAGTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTg < 2:1580080/100‑1 (MQ=255) tctcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTgg < 2:618757/100‑1 (MQ=255) tctcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTgg < 1:837787/100‑1 (MQ=255) ctcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGc > 1:639750/1‑100 (MQ=255) ctcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGc < 1:1718620/100‑1 (MQ=255) ctcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGc > 2:2512089/1‑100 (MQ=255) ctcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAACTGGCAGGtcaa < 1:900785/100‑4 (MQ=255) tcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCg > 2:2004117/1‑100 (MQ=255) tcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAACTGGCAGGtcaac < 1:1140100/100‑5 (MQ=255) tcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAACTGGCAGGtcaac < 2:570243/100‑5 (MQ=255) tcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAACTGGCAGGtcaac < 1:2213389/100‑5 (MQ=255) tcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTCACCTGCCAGTTGGCAGGTgg < 1:1577044/98‑1 (MQ=255) tcGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGCTGACCTGCCAACTGGCAGGtcaac < 2:1693088/100‑5 (MQ=255) tctcTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAACTGGCAGGtcaacc < 2:1177930/97‑6 (MQ=255) cGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGACACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTTACCTGCCAACTGGCAGGtcaacc < 1:1772883/100‑6 (MQ=255) cGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGgaga > 1:2425753/1‑100 (MQ=255) cGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGa < 1:646016/100‑1 (MQ=255) cGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAACTGGCAGGtcaac < 2:1445255/99‑5 (MQ=255) cGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAACTGGCAGGtcaac < 2:1110510/99‑5 (MQ=255) gCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTATCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGaa > 1:1158994/1‑100 (MQ=255) gCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGaa > 2:359039/1‑100 (MQ=255) gCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGaa < 1:1443112/100‑1 (MQ=255) cTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAAt < 2:305836/100‑1 (MQ=255) cTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAAt > 2:2412863/1‑100 (MQ=255) cTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAACTGGCAGGtcaaccaga > 1:1177926/1‑92 (MQ=255) ttCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATc > 2:1521249/1‑100 (MQ=255) ttCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAACTGGCAGGtcaaccgaat < 1:1154881/100‑10 (MQ=38) ctGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATcgcgc < 1:1252519/100‑1 (MQ=255) gcccCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGCTGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATcgcgcg > 1:487732‑M2/5‑99 (MQ=255) cccCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCa > 1:525582‑M2/4‑100 (MQ=255) cccCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCa > 2:2394858‑M2/4‑100 (MQ=255) ccCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAg > 1:1641878‑M2/3‑100 (MQ=255) ggTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCg > 2:907894/1‑100 (MQ=255) tGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGtt < 1:1873396/100‑1 (MQ=255) gcagcTAGCGTAACCCTGATGCTTACACATCCCGCGTGCCATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGttt < 1:1280722/96‑1 (MQ=255) aaaCTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGNAATNGCGCGCAGTTGCGTTtg > 1:1531011/1‑100 (MQ=255) aaaCTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTtg > 2:2228254/1‑100 (MQ=255) cTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTtgctg < 2:2225774/100‑1 (MQ=255) cTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTtgctg < 2:1249480/100‑1 (MQ=255) aGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTgcc < 2:783650/100‑1 (MQ=255) cGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTgccag > 1:1372676/1‑100 (MQ=255) cGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTgccag < 1:2282729/100‑1 (MQ=255) gTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTgccagc > 2:294643/1‑100 (MQ=255) gCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATg > 1:1947725/1‑99 (MQ=255) gATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccgc < 2:844295/100‑1 (MQ=255) aTGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccgcc < 2:501987/100‑1 (MQ=255) aTGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccgcc < 2:931827/100‑1 (MQ=255) aTGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGATGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccgcc < 2:1629521/100‑1 (MQ=255) tGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCa > 1:1962891/1‑100 (MQ=255) tGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCa < 1:1472145/100‑1 (MQ=255) gCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCag > 2:372291/1‑100 (MQ=255) cTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCAGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCaga > 2:1257588/1‑100 (MQ=255) cTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCAGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCaga > 2:1257608/1‑100 (MQ=255) tGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCagag > 2:1160541/1‑100 (MQ=255) tGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCagag > 1:1644431/1‑100 (MQ=255) tGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTCGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCaga > 1:1033668/1‑99 (MQ=255) gACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGc < 2:1589225/100‑1 (MQ=255) acacATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCt > 1:1086362/1‑100 (MQ=255) cacaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCCGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCag > 1:630719/1‑95 (MQ=255) cacaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTg > 1:2325572/1‑100 (MQ=255) caTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTGTGCTGCCAGCCATGCGGCCAGAGCTGt > 1:155487/1‑99 (MQ=255) caTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGATGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGtt > 2:1298127/1‑100 (MQ=255) aTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGTCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGTGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTg < 1:1933923/100‑1 (MQ=255) aTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTg < 2:2441634/100‑1 (MQ=255) tCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTgg > 1:71171/1‑100 (MQ=255) cTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTgg < 2:2325586/100‑1 (MQ=255) gCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGtt < 2:545032/100‑1 (MQ=255) gATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCCGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGttt > 1:197821/1‑99 (MQ=255) gATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTc < 2:525584/100‑1 (MQ=255) cTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTctgct > 1:230858/1‑99 (MQ=255) tGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTgg < 2:1279889/100‑1 (MQ=255) gCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGc < 2:1695369/100‑1 (MQ=255) tgcGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAg < 1:62359/98‑1 (MQ=255) atttcgccaCCTGCCAACTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAg > 2:2217990/9‑100 (MQ=38) ttcgccaCCTGCCAACTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTCGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGAc > 2:2531142/7‑100 (MQ=255) cGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGAc < 2:1213804/100‑1 (MQ=255) ggTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACt < 1:2348408/100‑1 (MQ=255) cgccaCCTGCCAACTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTg > 2:1499309/5‑100 (MQ=255) cgccaCCTGCCAACTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTACCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTg > 1:176075/5‑100 (MQ=255) ttGACCTGCCAGTTGGCAGGTAGAGAAATCGAGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGt > 1:182120/1‑100 (MQ=255) gccaCCTGCCAACTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGt > 2:1708726/4‑100 (MQ=255) ccaCCTGCCAACTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGtt > 1:404499/3‑100 (MQ=255) gACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTc < 2:1995015/100‑1 (MQ=255) aCCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCa < 1:1257604/100‑1 (MQ=255) aCCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCa < 1:1257584/100‑1 (MQ=255) aCCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCa > 1:386712/1‑100 (MQ=255) ccTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTCGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCAt > 1:949272/1‑100 (MQ=255) cTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCAtt < 1:1863142/100‑1 (MQ=255) cTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCAtt < 1:2508124/100‑1 (MQ=255) cTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCAtt < 2:162907/100‑1 (MQ=255) tGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTGGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTCCTGGTTTCTGCTGGCAAGACCGTTCATTa > 1:1552994/1‑100 (MQ=255) aGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGt < 1:2587508/100‑1 (MQ=255) gTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCGGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGtt < 1:880826/100‑1 (MQ=255) | GGCGGGTCATCTCGCCTTCTCTGCCCCCGGGTGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTACTGGTTTCTGCTGGCAAGACTGTTCATTAATGTT > NC_000913/2962464‑2962660 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |