| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,202,693 | C→G | 22.4% | P268R (CCG→CGG) | cca → | fused tRNA nucleotidyl transferase/2'3'‑cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase and phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,202,693 | 0 | C | G | 22.4% | 245.8 / 72.0 | 116 | P268R (CCG→CGG) | cca | fused tRNA nucleotidyl transferase/2'3'‑cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase and phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/42); new base G (12/14); total (59/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGGT > NC_000913/3202594‑3202792 | cGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGcc > 2:2241487/1‑100 (MQ=255) ctctCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTggcggc < 2:784570/100‑1 (MQ=255) ctctCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCcgc > 2:2956/1‑100 (MQ=255) tcAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtc < 2:2522334/100‑1 (MQ=38) cAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtca < 2:334061/100‑1 (MQ=38) cAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGtca < 2:1655530/100‑1 (MQ=255) aTGGCGGCGATGTTGCGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 2:1738054/100‑3 (MQ=37) aTGGCGGCGATGTTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 1:13584/100‑3 (MQ=37) aTGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 2:1223158/100‑3 (MQ=38) aTGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACGTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 1:1977533/100‑3 (MQ=37) tGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGtcatca > 2:1898860/1‑100 (MQ=255) ggcgtggATGCTGCGCCCGCAGGGCGATTTCCGTCTCGAAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGgcagccc < 1:1877898/94‑5 (MQ=16) ggcggcGATGCTGAGTCCGCAGGTCTATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 1:1084185/98‑3 (MQ=37) ggcggcGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTcatcat > 2:575501/1‑100 (MQ=255) ggcggcGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTcatcat > 2:582507/1‑100 (MQ=255) ggcggcGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGCCCGTTTCGACACTGTATGCCACGGTCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 1:436538/98‑3 (MQ=25) ggcggcGATGCGGAGTCCGCAGGGCGATGGCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagc < 1:1347682/98‑3 (MQ=25) gcggcgATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGtcagccct < 2:2158312/100‑6 (MQ=37) cggcgATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatgg > 2:1325245/1‑100 (MQ=255) cggcgACGCTGAGTCCGCAGGTGGATGTCCGGGTCGCAACTTGATGCCTCGATCGCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatgg < 1:2496892/100‑1 (MQ=255) cgATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtca < 2:769052/100‑1 (MQ=255) gaggCTGAGTCCACAGGTCGATGTTAGTTTCACAACTTTAGCCCACGATCTCGCTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggt < 1:603220/94‑1 (MQ=255) aTGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAtcatggtcatg > 1:577512/1‑100 (MQ=255) gCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGc > 2:1135843/1‑100 (MQ=255) cTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGcc < 1:41946/100‑1 (MQ=255) cTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGcc < 1:388396/100‑1 (MQ=255) cTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGcc < 2:1185817/100‑1 (MQ=255) cTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGcc > 2:2251008/1‑100 (MQ=255) cTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGcc > 2:2498935/1‑100 (MQ=255) tGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGccc > 2:1366461/1‑100 (MQ=255) tGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGcc < 2:893263/99‑1 (MQ=255) gAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGccag > 1:1185813/1‑98 (MQ=255) gAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCcg < 2:921547/100‑1 (MQ=255) ggTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgtg < 1:1256820/98‑1 (MQ=255) gTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTa < 2:1616634/100‑1 (MQ=255) gTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTa < 1:1553480/100‑1 (MQ=255) gTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTa < 2:1793016/100‑1 (MQ=255) gTCGATGTCCGTTTCGCAACTTGATGCCCCGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGgtg < 1:900865/97‑1 (MQ=255) cGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTaa < 2:2491078/99‑1 (MQ=255) gATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGt > 1:584508/1‑100 (MQ=255) gTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAg > 1:1063849/1‑100 (MQ=255) ttCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaac > 1:1382065/1‑100 (MQ=255) cGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaacaa > 2:1910552/1‑100 (MQ=255) gCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCTGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaacaac < 2:790973/100‑1 (MQ=255) gCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaacaac < 2:2081170/100‑1 (MQ=255) gCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaacaac > 1:1938432/1‑100 (MQ=255) gCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCAGCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGaacaac < 2:1943725/100‑1 (MQ=255) cTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATg > 1:1167744/1‑100 (MQ=255) cTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATg > 1:1011922/1‑100 (MQ=255) tttATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGc < 2:2305014/100‑1 (MQ=255) ttATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGcc > 1:2552981/1‑100 (MQ=255) ttATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTATGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGTGTGTTAAGTTAGTGGAACCACTATgac > 1:1776156/1‑98 (MQ=255) tGCCACGATCTGGGGCGAGGGCTGAGACAGCAAGAGCTCAGGCCGCGCAACCATGTTCTTTTCTTGTTGCGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCTAGc > 1:2240427/1‑100 (MQ=255) gCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCg > 1:449478/1‑100 (MQ=255) gCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCg < 1:590391/100‑1 (MQ=255) gCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACGCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCg > 2:1829828/1‑100 (MQ=255) tctcGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGGCTgcgc > 2:2118255/1‑100 (MQ=255) ctcGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGcgcg > 2:2268881/1‑100 (MQ=255) gTAAAGGGCTTACGCCGCCAGAACTGTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGcc < 1:1694372/100‑1 (MQ=255) gTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGcc > 2:1181540/1‑100 (MQ=255) tAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCa > 2:2330966/1‑100 (MQ=255) aaaGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGAAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCaa > 1:1423376/1‑100 (MQ=255) aaGGGCTGACGCGGCCAGAACGCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGGTAAAGTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCan < 1:72479/99‑2 (MQ=255) aGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAAt < 2:2054508/100‑1 (MQ=255) gggCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATg > 2:1459679/1‑100 (MQ=255) atgatGACGCGGCCAGAGTTCTGGCGGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTTAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATg > 1:1232279/5‑100 (MQ=37) 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cgccgcCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg < 1:1080916/100‑1 (MQ=255) cgccgcCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg > 1:736113/1‑100 (MQ=255) cgccgcCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcg > 1:122644/1‑100 (MQ=255) gccgccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcgc < 1:171725/100‑1 (MQ=255) ccgccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTcgcg < 1:2569930/100‑1 (MQ=255) gccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGAt < 2:2428634/100‑1 (MQ=255) gccAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGAt < 2:2207159/100‑1 (MQ=255) aCTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGTGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTa < 1:1169905/97‑1 (MQ=255) aCTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGcc > 1:839687/1‑100 (MQ=255) tctGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAg < 2:2217257/100‑1 (MQ=255) ctGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGa > 2:1622426/1‑100 (MQ=255) ctGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGGGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCCGa > 2:1737490/1‑100 (MQ=255) tGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAc < 2:1084870/100‑1 (MQ=255) tGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGAc > 2:1608799/1‑100 (MQ=255) ggCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACt < 1:1960303/100‑1 (MQ=255) ggCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACt > 2:1439467/1‑100 (MQ=255) ccGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACtgg < 1:1680615/100‑1 (MQ=255) cgcgTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACtggt < 2:2322174/100‑1 (MQ=255) cgcgTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACtggt > 1:1049977/1‑100 (MQ=255) | CGCTCTCAATGGCGGCGATGCTGAGTCCGCAGGTCGATGTCCGTTTCGCAACTTTATGCCACGATCTCGGTAAAGGGCTGACGCCGCCAGAACTCTGGCCGCGTCATCATGGTCATGGCCCGGCGGGTGTTAAGTTAGTGGAACAACTATGCCAGCGTCTGCGCGTGCCAAATGAAATTCGCGATTTAGCCAGACTGGT > NC_000913/3202594‑3202792 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |