| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,115,214 | C→T | 19.3% | K122K (AAG→AAA) | glpX ← | fructose 1,6‑bisphosphatase II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,115,214 | 0 | C | T | 19.3% | 280.9 / 52.4 | 129 | K122K (AAG→AAA) | glpX | fructose 1,6‑bisphosphatase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (57/47); new base T (15/10); total (72/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTG > NC_000913/4115115‑4115313 | gCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGc < 2:374411/100‑1 (MQ=255) cTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCt > 2:176624/1‑100 (MQ=255) cTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCt < 1:1348071/100‑1 (MQ=255) cAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTtc > 1:855173/1‑100 (MQ=255) cAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTtc < 2:1434487/100‑1 (MQ=255) aCGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTtctc < 2:450065/100‑1 (MQ=255) 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1:1350838/1‑100 (MQ=255) cGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACat < 1:958630/100‑1 (MQ=255) cGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACat > 2:1938400/1‑100 (MQ=255) gAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACata < 1:778718/100‑1 (MQ=255) gAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCACCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACata > 2:1750448/1‑100 (MQ=255) cgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCa > 2:85660/1‑100 (MQ=255) cgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCa < 2:868746/100‑1 (MQ=255) gcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCAt > 2:889465/1‑100 (MQ=255) 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1:2383607/1‑100 (MQ=255) gTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCt > 2:784535/1‑100 (MQ=255) ttATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCtt > 1:1121315/1‑100 (MQ=255) ttATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCtt < 2:47803/100‑1 (MQ=255) ttATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCtt < 1:1961452/100‑1 (MQ=255) aTCCGCCAGCGGCACGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTa < 1:1764844/100‑1 (MQ=255) tCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTAt > 1:1178208/1‑100 (MQ=255) tCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTAt < 2:2483169/100‑1 (MQ=255) ccGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTAt > 1:395358/1‑99 (MQ=255) ccGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATc > 1:1068728/1‑100 (MQ=255) cGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCTCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCg < 1:587876/100‑1 (MQ=255) cGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCg > 2:718059/1‑100 (MQ=255) cGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCg > 1:2421037/1‑100 (MQ=255) gCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGc > 2:2416735/1‑100 (MQ=255) gCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGc > 2:1038628/1‑100 (MQ=255) ccAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGcc < 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tCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCAc > 1:1867072/1‑100 (MQ=255) cAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCAcc > 1:1427563/1‑100 (MQ=255) aGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCg > 2:363864/1‑100 (MQ=255) gATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCGCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGc > 2:1573800/1‑100 (MQ=255) gATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGc > 2:1001619/1‑100 (MQ=255) gATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGc > 1:1333202/1‑100 (MQ=255) gATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATGGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGc > 2:763821/1‑100 (MQ=255) tCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCa < 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tGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGtt > 2:2271457/1‑100 (MQ=255) tGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGtt < 1:1461132/100‑1 (MQ=255) tttGGCTCCCGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAgag > 1:776716/1‑98 (MQ=255) tttGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGcc < 1:1850949/100‑1 (MQ=255) tttGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGcc < 1:176623/100‑1 (MQ=255) ttGGCTCCCGGCACGATAATCAGCTTCGCCATATACATAGTCGGCGCATTGAGGAAGCAGTTTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAg < 1:2327668/97‑1 (MQ=255) ggCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTgg > 1:673858/1‑100 (MQ=255) ggCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTgg < 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cccGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCa < 1:1001616/100‑1 (MQ=255) cccGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCa > 2:112147/1‑100 (MQ=255) cccGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCa > 2:628557/1‑100 (MQ=255) cccGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCa > 2:1690566/1‑100 (MQ=255) cGGCCCGACAATCAGTTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATc > 2:2343715/1‑100 (MQ=255) cGGCCCGACAATCAGCTTCCCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGCAGCAGACTTTCTCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGGGCTTTAGCCTGGCCCATc < 1:2342682/100‑1 (MQ=255) ggCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCg > 2:1302292/1‑100 (MQ=255) ggCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCg < 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aTCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATgc < 2:77455/100‑1 (MQ=255) aGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGcgcg > 2:595791/1‑100 (MQ=255) gCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGACTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGTCCATCGCCGTCATGcgcg < 1:196476/99‑1 (MQ=255) cTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTg < 1:146027/100‑1 (MQ=255) | GCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTG > NC_000913/4115115‑4115313 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |