Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,343,821 | (T)7→6 | coding (453/1422 nt) | melB → | melibiose:sodium symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,343,815 | 0 | T | . | 96.4% | 341.0 / 5.1 | 83 | coding (447/1422 nt) | melB | melibiose:sodium symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/0); new base . (34/46); total (37/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.46e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GGCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGTTTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTCAGAT > NC_000913/4343717‑4343910 | ggCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtt > 2:1386886/1‑100 (MQ=255) ggCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtt > 1:81969/1‑100 (MQ=255) ggCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtt > 1:455034/1‑100 (MQ=255) ggCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtt > 1:1906652/1‑100 (MQ=255) ggCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtt < 1:1891123/100‑1 (MQ=255) ggCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtt < 2:2001737/100‑1 (MQ=255) gCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtt > 1:2359169/1‑99 (MQ=255) cATTACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtttt < 2:496956/100‑1 (MQ=255) tGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtttttt < 2:2738009/100‑1 (MQ=255) tGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtttttt < 2:627585/100‑1 (MQ=255) tGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtttttt > 2:2748468/1‑100 (MQ=255) gACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGttttttg < 1:2294138/100‑2 (MQ=255) gACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTAGCTGGTACCTACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGttttttg < 2:2026227/100‑2 (MQ=255) aCTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGttttttgc < 1:2236078/100‑3 (MQ=255) cTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGttttttgcc < 1:1630658/100‑4 (MQ=255) cTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGttttttgcc < 2:573911/100‑4 (MQ=255) cTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGttttttgcc < 1:67160/100‑4 (MQ=255) cTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGttttttgcc > 1:1380618/1‑97 (MQ=255) cTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGttttttgcc > 2:323223/1‑97 (MQ=255) tACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAg < 2:604644/100‑1 (MQ=255) tACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAg > 1:2439546/1‑100 (MQ=255) cacCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTc > 1:2383866/1‑100 (MQ=255) cacCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTc > 1:1682045/1‑100 (MQ=255) aTTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGtttttttttttttt > 2:1369936/1‑90 (MQ=255) aTTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGc < 2:2781928/100‑1 (MQ=255) tATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAg < 1:841913/100‑1 (MQ=255) tATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAg > 1:2546749/1‑100 (MQ=255) tGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGc > 2:116111/1‑100 (MQ=255) tGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGc > 2:1596658/1‑100 (MQ=255) gATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCtt > 2:364227/1‑100 (MQ=255) atatTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCttt < 2:1625412/100‑1 (MQ=255) tatTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTg < 2:2554361/100‑1 (MQ=255) atTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCGGGCTTTGt > 1:2596491/1‑100 (MQ=255) ttCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGtt < 1:2099491/100‑1 (MQ=255) cccTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTAc > 2:1617567/1‑100 (MQ=255) cccTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTAc > 1:1117579/1‑100 (MQ=255) ttCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGc < 1:1507898/100‑1 (MQ=255) cTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAg < 1:2010530/100‑1 (MQ=255) tGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAgg < 2:1641690/100‑1 (MQ=255) ggTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGgt > 1:1727173/1‑100 (MQ=255) gTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGgtg < 1:2510123/100‑1 (MQ=255) gTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGgtg < 1:992444/100‑1 (MQ=255) gTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGgtg < 2:1380613/100‑1 (MQ=255) cGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGtgtg > 1:2475123/1‑100 (MQ=255) cGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGtgtg > 1:163200/1‑100 (MQ=255) cGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGAGAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGtgtg < 1:989903/100‑1 (MQ=255) gCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGa < 1:139427/100‑1 (MQ=255) gCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGa < 1:137961/100‑1 (MQ=255) tGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACg < 2:103038/100‑1 (MQ=255) gTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCt > 1:1084695/1‑100 (MQ=255) ttCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTa > 1:1625434/1‑100 (MQ=255) tCCAACCATCACGCTCGATAAACGTTAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTAc < 2:119369/100‑1 (MQ=255) tCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTAc < 2:592010/100‑1 (MQ=255) tCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTAc > 1:719002/1‑100 (MQ=255) ccATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGTTTTTTT‑TTTTTCTTTCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCAttt > 2:2145622/1‑100 (MQ=255) cATCACGCTCGATAAGCGTGAGGGCGAACAACGTGTTCCTTAGCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCGTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTg < 1:2290452/100‑1 (MQ=255) cATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTg < 2:2439530/100‑1 (MQ=255) aTCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCAt > 1:2572488/1‑96 (MQ=255) aTCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGt < 2:2696877/100‑1 (MQ=255) aTCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGt > 1:1987656/1‑100 (MQ=255) cACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACGACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTa > 1:2665967/1‑100 (MQ=255) cACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTa < 2:1194350/100‑1 (MQ=255) cACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTa < 2:1196759/100‑1 (MQ=255) aCGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTaa > 1:2308025/1‑100 (MQ=255) aCGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTaa < 2:2398239/100‑1 (MQ=255) gCTCGATAAACGTGAGCGCGAACGACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAAtt < 2:2665948/100‑1 (MQ=255) gCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAAtt > 1:958150/1‑100 (MQ=255) cTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTa < 1:1461621/100‑1 (MQ=255) cGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATg < 1:2185790/100‑1 (MQ=255) gATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGt < 1:364228/100‑1 (MQ=255) tAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTcg > 1:2355605/1‑100 (MQ=255) tAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTcg > 1:2355647/1‑100 (MQ=255) cGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTcggcgg > 1:2193042/1‑100 (MQ=255) cGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTcggcgg < 2:1117575/100‑1 (MQ=255) gTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGt > 2:5332/1‑100 (MQ=255) tGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTg < 2:1932876/100‑1 (MQ=255) aGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGc < 1:592060/100‑1 (MQ=255) gcgcGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCg > 1:1480682/1‑100 (MQ=255) gcgcGAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCg > 2:7159/1‑100 (MQ=255) gcgAACAACTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGAt > 1:1732028/1‑100 (MQ=255) cgAACAACTGGTTCCTTATCCGCGTTTTTTTGCCAGTCTGACAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGAAGCTACCATTTGTTAATTATGTCCGCGGTGGCGa > 2:1397020/1‑99 (MQ=255) cgAACAACTGGTTCCATATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATc < 1:814788/100‑1 (MQ=255) aacaacTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCgg > 2:2022548/1‑100 (MQ=255) aacaacTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCgg < 1:1596668/100‑1 (MQ=255) acaacTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCggg < 1:789356/100‑1 (MQ=255) caacTGGTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCgggg < 1:641728/100‑1 (MQ=255) aacTTGTTCCTTATCCGCGTTTTTTT‑TTTTTTTTTCAGGCTTTGTTACGGCAAGTGTTATTCTTGTATTTTTTAATTATGTCGGCGGTGGCTATCg > 2:685968/1‑96 (MQ=255) gTTCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTgg > 1:2719102/1‑100 (MQ=255) tCCTTATGCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGGTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGc < 2:2572470/99‑1 (MQ=255) tCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCt > 2:2161347/1‑100 (MQ=255) tCCTTATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCt > 1:1418091/1‑100 (MQ=255) ccTTATCCGCG‑TTTTTGGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCtt < 2:258396/100‑1 (MQ=255) ttATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTTCCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTc < 1:106274/100‑1 (MQ=255) ttATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTc < 2:719000/100‑1 (MQ=255) tATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTCa < 2:2475107/100‑1 (MQ=255) tATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTCa < 1:17303/100‑1 (MQ=255) tATCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTCa < 1:1369941/100‑1 (MQ=255) tCCGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTCAg < 2:2174665/99‑1 (MQ=255) ccGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTCAGAt > 1:307718/1‑100 (MQ=255) ccGCG‑TTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTCAGAt > 1:1239135/1‑100 (MQ=255) | GGCATGACTTACACCATTATGGATATTCCCTTCTGGTCGCTGGTTCCAACCATCACGCTCGATAAACGTGAGCGCGAACAACTGGTTCCTTATCCGCGTTTTTTTGCCAGTCTGGCAGGCTTTGTTACGGCAGGTGTGACGCTACCATTTGTTAATTATGTCGGCGGTGGCGATCGGGGATTTGGCTTTCAGAT > NC_000913/4343717‑4343910 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |