| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,589,100 | (A)6→5 | coding (1506/3114 nt) | acrD → | aminoglycoside/multidrug efflux system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,589,095 | 0 | A | . | 98.9% | 407.9 / ‑2.9 | 93 | coding (1501/3114 nt) | acrD | aminoglycoside/multidrug efflux system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base . (50/42); total (51/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CGCCAGTTCTCTATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGTGGCGAAA > NC_000913/2588996‑2589190 | cGCCAGTTCTCTATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGa < 2:2138645/100‑1 (MQ=255) gCCAGTTCTCTATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGaa > 1:705073/1‑100 (MQ=255) gCCAGTTCTCTATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGCAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGaa > 2:1279778/1‑100 (MQ=255) ccAGTTCTCTATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGaaa > 2:2810618/1‑100 (MQ=255) cAGTTCTCTATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGaaaa > 2:2088433/1‑100 (MQ=255) aGTTCTCTATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGaaaaa < 2:533738/100‑1 (MQ=255) nttCTCTATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCACACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGaaaaag > 2:1845289/2‑99 (MQ=255) tctcTATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGaaaaaggt > 2:1627319/1‑97 (MQ=255) tttATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGa < 2:2452144/98‑1 (MQ=255) tctATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGaaaaaggtg > 2:46803/1‑95 (MQ=255) tctATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGa < 2:1920738/100‑1 (MQ=255) ctATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAg > 1:139575/1‑100 (MQ=255) ctATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAg > 2:1718675/1‑100 (MQ=255) tATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGc > 2:2629392/1‑100 (MQ=255) aTTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCAATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGca < 1:1327340/100‑1 (MQ=255) aCCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGcatca < 2:1865198/100‑1 (MQ=255) ccATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGcatcat < 2:415921/100‑1 (MQ=255) ccATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑‑AAAAGGTGAGCATCATg > 1:2710985/1‑100 (MQ=255) ccATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACGACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGcatcat < 2:415985/100‑1 (MQ=255) cATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATg < 2:1664130/100‑1 (MQ=255) cATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATg > 2:947116/1‑100 (MQ=255) tgttgCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGc < 2:2219665/100‑1 (MQ=255) gttgCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCa > 2:2527373/1‑100 (MQ=255) gttgCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCa > 1:1484936/1‑100 (MQ=255) gcggcgATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCaaaa > 1:45610/1‑100 (MQ=255) cggcgATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCaaaaa > 2:1247430/1‑100 (MQ=255) ggcgATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAg < 2:1679999/100‑1 (MQ=255) cgATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGc < 2:1996957/100‑1 (MQ=255) cgATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGc < 1:340785/100‑1 (MQ=255) cgATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGc > 1:286458/1‑100 (MQ=255) tGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCttt > 1:34760/1‑100 (MQ=255) tGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCttt < 1:100079/100‑1 (MQ=255) ggTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCtttt > 1:1584619/1‑100 (MQ=255) gTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCttttt < 2:2442198/100‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTg < 2:795567/100‑1 (MQ=255) gCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTg < 1:1389768/100‑1 (MQ=255) tGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGcc > 2:2160977/1‑100 (MQ=255) tGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAAGCCTTTTTGcc < 2:1228886/100‑1 (MQ=255) tGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAAGCCTTTTTGcc < 1:2511429/100‑1 (MQ=255) gTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAAGCCTTTTTGccc < 1:550294/100‑2 (MQ=255) gTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAAGCCTTTTTGccc < 2:1031176/100‑2 (MQ=255) tCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAAGCCTTTTTGccca < 2:491359/100‑3 (MQ=255) tCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAAGCCTTTTTGccca < 1:1399139/100‑3 (MQ=255) cAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTgg > 1:543944/1‑100 (MQ=255) aGTACTGTTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGt < 2:1960721/100‑1 (MQ=255) aGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGt > 2:98807/1‑100 (MQ=255) aGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGt < 2:2792111/100‑1 (MQ=255) gTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGtt < 1:590800/100‑1 (MQ=255) gTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGtt > 1:341844/1‑100 (MQ=255) aCTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTa < 2:1200049/100‑1 (MQ=255) aCTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTa < 1:407855/100‑1 (MQ=255) tGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCAACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTaa > 1:2756818/1‑99 (MQ=255) gTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCa > 2:326368/1‑100 (MQ=255) gTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCa < 1:551526/100‑1 (MQ=255) gTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCa > 1:534955/1‑100 (MQ=255) gTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCa > 2:595365/1‑100 (MQ=255) gTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCa > 2:787121/1‑100 (MQ=255) tAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAg < 2:2332206/100‑1 (MQ=255) ctgCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAg < 2:1537468/98‑1 (MQ=255) gCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGag > 1:1537477/1‑99 (MQ=255) cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATg > 1:1772466/1‑100 (MQ=255) cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATg < 1:2369232/100‑1 (MQ=255) cGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATg < 1:1485936/100‑1 (MQ=255) atgatCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATAATGAGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGtt < 2:1716837/100‑1 (MQ=255) atCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTaa > 1:150447/1‑100 (MQ=255) tCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAAc > 1:1682590/1‑100 (MQ=255) cTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCg > 2:2001358/1‑100 (MQ=255) tCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGc < 2:1921964/100‑1 (MQ=255) ccGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGc > 1:1272695/1‑100 (MQ=255) cGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGcc > 1:1332251/1‑100 (MQ=255) cGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGcc > 1:2088923/1‑100 (MQ=255) ggCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCg > 2:287457/1‑100 (MQ=255) gCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGa > 2:2088364/1‑100 (MQ=255) tctGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGATTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAAc > 2:1850071/1‑100 (MQ=255) ctGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACg < 1:1279783/100‑1 (MQ=255) tgtgtgCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTCTAACCGCAACGCCGAAc < 2:648585/98‑1 (MQ=255) gtgtgCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCt > 2:2186374/1‑100 (MQ=255) gtgtgCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCt > 2:1085084/1‑100 (MQ=255) tgtgCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTa < 2:1616879/100‑1 (MQ=255) tgtgCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTa < 1:1756022/100‑1 (MQ=255) gtgCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTTACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTAc > 1:1720362/1‑100 (MQ=255) gtgCCACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTAc > 1:2011296/1‑100 (MQ=255) ccACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGaa > 2:2379774/1‑100 (MQ=255) ccACACTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGaa < 1:2088377/100‑1 (MQ=255) cacaCTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGaaa > 1:470245/1‑100 (MQ=255) cacaCTACTTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGaaa > 2:111942/1‑100 (MQ=255) ctactTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAgg > 2:2568208/1‑100 (MQ=255) tactTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAggg > 2:1155856/1‑100 (MQ=255) ctTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGt < 2:858124/100‑1 (MQ=255) ctTAAGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGt < 1:1136048/100‑1 (MQ=255) aaGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGTGGc < 2:34760/100‑1 (MQ=255) aaGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGTGGc > 1:1559382/1‑100 (MQ=255) aaGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGTGGc > 2:1603205/1‑100 (MQ=255) aGCCACTGAAAAAACGTGAGCAGCATGAGCAAAAAGGCTTCATAGCCTGATTTAGAAAGTTGTTTAACCGAAACCCCAAACGCGACGACAAAgggatcgc > 2:2234079/1‑95 (MQ=255) aGCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGTGGCg > 2:2874111/1‑100 (MQ=255) gCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGTGGCGa > 2:1968204/1‑100 (MQ=255) gCCACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGTGGCGa > 1:1238257/1‑100 (MQ=255) cACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGTGGCGaaa > 2:2634832/1‑100 (MQ=255) cACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGTGGCGaaa > 1:494408/1‑100 (MQ=255) cACTG‑AAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGTGGCGaaa > 1:1105566/1‑100 (MQ=255) | CGCCAGTTCTCTATTACCATTGTTGCGGCGATGGTGCTGTCAGTACTGGTAGCGATGATCCTCACTCCGGCTCTGTGTGCCACACTACTTAAGCCACTGAAAAAAGGTGAGCATCATGGGCAAAAAGGCTTTTTTGCCTGGTTTAACCAGATGTTTAACCGCAACGCCGAACGCTACGAAAAAGGGGTGGCGAAA > NC_000913/2588996‑2589190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |