Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,499,708 | (C)5→4 | intergenic (+93/‑202) | yhfL → / → frlA | small lipoprotein/putative fructoselysine transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,499,704 | 0 | C | . | 96.5% | 481.2 / 8.7 | 113 | intergenic (+89/‑206) | yhfL/frlA | small lipoprotein/putative fructoselysine transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base . (45/64); total (47/66) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTC > NC_000913/3499605‑3499799 | cTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGc > 2:2413706/1‑100 (MQ=255) tGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGcc > 1:705415/1‑100 (MQ=255) tGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGcc < 2:13650/100‑1 (MQ=255) gCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGccc > 2:673872/1‑100 (MQ=255) acaGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGccccg < 2:2110536/100‑2 (MQ=255) acaGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGccccg < 1:2508199/100‑2 (MQ=255) gTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGccccgccc < 1:830022/100‑5 (MQ=255) aGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTa > 2:2456992/1‑100 (MQ=255) aGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTa > 2:2222046/1‑100 (MQ=255) gTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaa > 1:295896/1‑100 (MQ=255) gTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaa < 1:469656/100‑1 (MQ=255) ctctGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAACTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaaa > 2:388732/1‑100 (MQ=255) tctGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaaaa < 2:206745/100‑1 (MQ=255) tctGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaaaa < 1:741498/100‑1 (MQ=255) tctGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTaaaaa > 1:849156/1‑100 (MQ=255) gACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAatat > 2:1609491/1‑100 (MQ=255) cAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATAttt > 1:1556131/1‑100 (MQ=255) cAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATAttt > 1:1461605/1‑100 (MQ=255) gAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTc > 1:579070/1‑100 (MQ=255) gAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTc > 1:26165/1‑100 (MQ=255) gAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTc > 1:613364/1‑100 (MQ=255) gAAATCGACTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTc < 1:2231596/100‑1 (MQ=255) aaaTCGGCTACCACCGGTTTAATTGCCCGGCGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTT‑CCCCCGCCCGTAAAAATATTTTc < 2:1685775/99‑1 (MQ=255) aaTCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCAc < 2:2695123/100‑1 (MQ=255) aaTCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCAc < 1:1324311/100‑1 (MQ=255) aaTCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCAc < 1:939364/100‑1 (MQ=255) aaTCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCAc < 2:1230415/100‑1 (MQ=255) aTCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACt < 1:2473054/100‑1 (MQ=255) ggCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTa < 1:710004/100‑1 (MQ=255) ggCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTa < 2:1405552/100‑1 (MQ=255) cTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTaaa < 2:2170810/100‑1 (MQ=255) cTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTaaa > 1:928952/1‑100 (MQ=255) tAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAAt < 2:1914423/100‑1 (MQ=255) tAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAAt < 1:2567491/100‑1 (MQ=255) aaCACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACttagatc > 1:1919637/1‑95 (MQ=255) cacCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCa > 1:1642317/1‑100 (MQ=255) acCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCaa > 1:11000/1‑100 (MQ=255) ccGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAAt < 2:187416/100‑1 (MQ=255) cGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAAtt > 2:2234483/1‑100 (MQ=255) gTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTg < 2:2808117/100‑1 (MQ=255) gTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTg < 2:1795986/100‑1 (MQ=255) gTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTg < 1:1974014/100‑1 (MQ=255) tttAATTGCCCGACGCCCTCTTGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGa < 2:2576232/100‑1 (MQ=255) ttAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGAt < 1:274919/100‑1 (MQ=255) tAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATa < 1:1609501/100‑1 (MQ=255) aTTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATaan < 2:1472831/100‑2 (MQ=255) aTTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAAc > 1:2879156/1‑100 (MQ=255) ttttccGACCCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTATTTCTATGTCATTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACt < 2:1428082/96‑1 (MQ=255) ttGCCCGACGTCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTTTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACt < 2:2300535/100‑1 (MQ=255) ttGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACt < 2:341810/100‑1 (MQ=255) ttGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACt < 1:2828997/100‑1 (MQ=255) tGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTa < 2:1637593/100‑1 (MQ=255) gCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTAc < 1:27955/100‑1 (MQ=255) nccGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTAGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATATTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACa > 2:1738622/2‑100 (MQ=255) cccGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTAc > 1:759495/1‑100 (MQ=255) cccGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACa > 2:1906320/1‑100 (MQ=255) cGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATc > 1:1056650/1‑100 (MQ=255) cccTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTa < 1:2298880/100‑1 (MQ=255) ccTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAg < 1:1674338/100‑1 (MQ=255) ctctGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATGACTACATCCATTAGc > 1:2847083/1‑100 (MQ=255) ctctGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGc < 1:2359918/100‑1 (MQ=255) tctGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTCCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGcc > 2:1249995/1‑100 (MQ=255) ctGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGcc < 2:1355708/99‑1 (MQ=255) ttttCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAgcg > 1:1412401/1‑100 (MQ=255) ttttCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑ACCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAgcg > 1:2033663/1‑100 (MQ=255) ccGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGAt < 2:352852/100‑1 (MQ=255) cGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATc > 1:2132196/1‑100 (MQ=255) gAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATcc < 2:634640/100‑1 (MQ=255) ggCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCtgt < 2:2476552/100‑1 (MQ=255) gCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTGCATCCATTAGCCACAGCGCGATCCtgtg < 2:1623173/100‑1 (MQ=255) gCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATcc < 2:1232588/96‑1 (MQ=255) gCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACAGCCATTAGCCACAGCGCGATCCtgt < 1:1315825/99‑1 (MQ=255) cGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGc < 2:613362/100‑1 (MQ=255) tATTTGTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCg > 1:1127829/1‑99 (MQ=255) gTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAAttt > 1:1857182/1‑100 (MQ=255) gTTTCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAAttt > 1:1107295/1‑100 (MQ=255) ttCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtg < 1:2707090/100‑1 (MQ=255) ttCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATCTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtg < 2:1532328/100‑1 (MQ=255) tCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtgt > 1:136155/1‑100 (MQ=255) tCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtgt < 1:551387/100‑1 (MQ=255) tCTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtgt < 1:2527743/100‑1 (MQ=255) cTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtgtg < 2:1461598/100‑1 (MQ=255) cTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtgt > 2:2236351/1‑99 (MQ=255) cTATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACACCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTtgtg < 2:1545580/100‑1 (MQ=255) tATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGa < 1:1130484/100‑1 (MQ=255) tATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGa < 1:318770/100‑1 (MQ=255) tATGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGa < 1:571132/100‑1 (MQ=255) tGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATc > 2:2110761/1‑100 (MQ=255) tGTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATc < 2:1191005/100‑1 (MQ=255) gTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCt > 1:69377/1‑100 (MQ=255) gTCCTTCTTG‑CCCCGCCCGAAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAACAACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCt > 2:138552/1‑100 (MQ=255) tCCTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCtt > 1:2504369/1‑100 (MQ=255) ccTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTtc > 2:1560132/1‑100 (MQ=255) ccTTCTTG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTtc > 1:1578644/1‑100 (MQ=255) cttcttG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTtcc < 1:909040/100‑1 (MQ=255) tcttG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCACTTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTtcctc < 2:2033649/100‑1 (MQ=255) tcttG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCGTTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTtcctc > 2:1855520/1‑100 (MQ=255) tcttG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTtcctc > 2:543330/1‑100 (MQ=255) tcttG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTtcctc > 1:2765813/1‑100 (MQ=255) tcttG‑CCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTtcctc > 2:898905/1‑100 (MQ=255) | CTGCACAGTAAGTCTCTGACAGAAATCGGCTAACACCGGTTTAATTGCCCGACGCCCTCTGGATTTTCCGAGGGCGTATTTGTTTCTATGTCCTTCTTGCCCCCGCCCGTAAAAATATTTTCACTTTAAATTCAATTTGATAACTACATCCATTAGCCACAGCGCGATCCTGTGCGAAATTTTGTGATCTTCCTC > NC_000913/3499605‑3499799 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |