| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,765,463 | (TATGGCAC)6→8 | intergenic (‑310/+50) | yfjL ← / ← yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2765412 = | 15 (0.130) | 68 (0.930) | 53/126 | 0.2 | 92.8% | intergenic (‑259/+101) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | = 2765427 | 1 (0.010) | intergenic (‑274/+86) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
ATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGC > NC_000913/2765314‑2765511 | aTTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgc > 2:2143372/1‑100 (MQ=255) actgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcacggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggca < 2:1708914‑M1/3‑1 (MQ=255) ctgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcac > 2:2789356‑M1/97‑100 (MQ=255) ctgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcac > 1:1970441‑M1/97‑100 (MQ=255) ggTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcacta < 1:1911346/100‑1 (MQ=255) ttATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatg > 1:226365/1‑100 (MQ=255) cccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatg > 1:729874‑M1/93‑100 (MQ=255) cccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatg > 1:1302060‑M1/93‑100 (MQ=255) cccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatg > 2:2639038‑M1/93‑100 (MQ=255) cccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatg < 2:2227030‑M1/8‑1 (MQ=255) ccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatgg > 1:2703213‑M1/92‑100 (MQ=255) caactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggc < 1:2892522‑M1/10‑1 (MQ=255) caactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggc < 2:1835828‑M1/10‑1 (MQ=255) aactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggca < 1:1643366‑M1/11‑1 (MQ=255) taACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcact > 2:556316/1‑100 (MQ=255) cATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcactatg < 1:200065/100‑1 (MQ=255) cgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatgg > 1:2683370‑M1/84‑100 (MQ=255) cgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatgg > 1:1287185‑M1/84‑100 (MQ=255) tACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcactatg > 2:1645929/1‑98 (MQ=255) tACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgc > 1:1929260‑M2/1‑98 (MQ=255) gtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggc > 2:2216233‑M1/83‑100 (MQ=255) aggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcact < 1:1905233‑M1/21‑1 (MQ=255) aggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcact > 2:1347900‑M1/80‑100 (MQ=255) ggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcacta < 1:1028660‑M1/22‑1 (MQ=255) gCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcacta < 1:1821271‑M2/100‑7 (MQ=255) gtaggcacagccttaatcaaggttttagttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactat > 2:291404‑M1/78‑100 (MQ=255) ccAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatgg < 2:774609‑M2/100‑10 (MQ=255) ggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc < 1:1776253‑M1/26‑1 (MQ=255) aaCTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcacta > 2:391573‑M2/1‑89 (MQ=255) cacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac > 2:1643353‑M1/73‑100 (MQ=255) cacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac < 2:1333341‑M1/28‑1 (MQ=255) cacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac < 2:255098‑M1/28‑1 (MQ=255) aCTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcac < 1:844651‑M2/100‑13 (MQ=255) aaCGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactat < 2:465672‑M2/100‑16 (MQ=255) aaCGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactat < 1:2635279‑M2/100‑16 (MQ=255) gccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg > 1:2695784‑M1/69‑100 (MQ=255) cGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatgg > 1:34415‑M2/1‑83 (MQ=255) gTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggc > 2:1220860‑M2/1‑82 (MQ=255) cttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc < 2:2785436‑M1/34‑1 (MQ=255) atcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcacta < 1:1712684‑M1/38‑1 (MQ=255) tAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatg > 1:1495304‑M2/1‑76 (MQ=255) aGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatgg > 2:1234104‑M2/1‑75 (MQ=255) ggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggca < 2:743030‑M1/43‑1 (MQ=255) ttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcact < 2:2241397‑M1/45‑1 (MQ=255) tttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgtcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcacta < 1:920850‑M1/46‑1 (MQ=255) gCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatg < 2:388609‑M2/100‑33 (MQ=255) ggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg < 2:773385‑M1/49‑1 (MQ=255) ccTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatgg < 1:1410824‑M2/100‑34 (MQ=255) gttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc > 1:756117‑M1/51‑100 (MQ=255) ttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagc > 1:1078012‑M1/50‑93 (MQ=255) tttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac < 2:1053937‑M1/52‑1 (MQ=255) tttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac < 1:515645‑M1/52‑1 (MQ=255) tAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcac < 2:902894‑M2/100‑37 (MQ=255) tAAACAAGGTATTGGGTTTCAAATAGTTCAGAGCTTAAACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatgg > 2:1395724‑M2/1‑64 (MQ=255) ttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCAcc < 1:2243478‑M1/53‑1 (MQ=255) tcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGTCACTATGGCACTATGGCACCg > 2:358073‑M1/47‑100 (MQ=255) aaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGcc < 1:769228‑M1/56‑1 (MQ=255) aatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGc < 2:1024181‑M1/55‑1 (MQ=255) aaGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg > 1:2729569‑M2/1‑59 (MQ=255) aaGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg > 1:1939304‑M2/1‑59 (MQ=255) tagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGc > 1:77356‑M1/42‑100 (MQ=255) gttttggttttTAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggca > 2:2098435‑M2/1‑56 (MQ=255) gttttggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac < 1:1270165‑M2/100‑45 (MQ=255) gttttggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac < 1:437795‑M2/100‑45 (MQ=255) gttttggttttCAAATAGTTCAGAGATGAGAACGCCAAACGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggca > 2:377511‑M2/1‑56 (MQ=255) tggttttTAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg > 2:2089174‑M2/1‑52 (MQ=255) agagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTAAGGCACTATGTCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGt < 2:2026736‑M1/65‑1 (MQ=255) gagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTa < 1:219272‑M1/66‑1 (MQ=255) ttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggca < 1:2496416‑M2/100‑52 (MQ=255) gctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAAt > 2:1821258‑M1/33‑100 (MQ=255) tttAAATGGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACAATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcacc > 2:2241401‑M2/1‑47 (MQ=255) tCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccg < 2:444171‑M2/100‑55 (MQ=255) gagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATcac > 2:1052520‑M1/30‑100 (MQ=255) cAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgc < 2:150360‑M2/100‑56 (MQ=255) gaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATcaca > 2:515643‑M1/28‑99 (MQ=255) ccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACtt > 1:255099‑M1/26‑100 (MQ=255) gTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcga < 1:2383228‑M2/100‑62 (MQ=255) cAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattg < 2:2173103‑M2/100‑65 (MQ=255) cAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattg > 1:1817858‑M2/1‑36 (MQ=255) aaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGatat > 1:1971482‑M1/21‑100 (MQ=255) accgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCAATATGGCACCTCCAGCGATTGTAATCAAACTTGatat < 2:161534‑M1/80‑1 (MQ=255) ccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACGATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatt < 2:1947478‑M1/81‑1 (MQ=255) agCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaa > 1:2489665‑M2/1‑33 (MQ=255) gcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGTGATAGTAATAAAACCtgatattctc < 2:564435‑M1/84‑4 (MQ=255) gcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATtata > 1:1360603‑M1/17‑100 (MQ=255) gcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCAAACTTGATATtata < 2:637456‑M1/84‑1 (MQ=255) cTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatc < 2:2393867‑M2/100‑70 (MQ=255) tGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcaatatggcactatggcactatagcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatca < 2:1579634‑M2/100‑71 (MQ=255) tatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAac > 1:1279371‑M1/13‑100 (MQ=255) gaCCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacac < 1:1454056‑M2/100‑74 (MQ=255) gcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAg > 1:1111937‑M1/9‑100 (MQ=255) cGCCAACCGGACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttg > 1:808411‑M2/1‑24 (MQ=255) cGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttg > 1:806743‑M2/1‑24 (MQ=255) gCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttga < 2:904105‑M2/100‑78 (MQ=255) ccAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgat > 1:1825992‑M2/1‑22 (MQ=255) ctatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTg > 1:585400‑M1/6‑100 (MQ=255) tatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGc < 1:1816731‑M1/96‑1 (MQ=255) tatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGc < 1:1562451‑M1/96‑1 (MQ=255) tgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCAc < 1:2763280‑M1/98‑1 (MQ=255) gGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACg < 1:245774‑M1/99‑1 (MQ=255) | ATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGC > NC_000913/2765314‑2765511 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |