| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,215,178 | Δ1 bp | 29.9% | coding (899/930 nt) | metA → | homoserine O‑transsuccinylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,215,178 | 0 | A | . | 29.9% | 239.1 / 109.0 | 97 | coding (899/930 nt) | metA | homoserine O‑transsuccinylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/26); new base . (18/11); total (59/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 | |||||||||||
GATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTA > NC_000913/4215081‑4215277 | gATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTCCCAGATCACGCCATACGATc > 1:1276138/1‑100 (MQ=255) ccGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTAc > 1:1405845/1‑100 (MQ=255) cGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACg < 2:487830/100‑1 (MQ=255) gCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACgg > 1:260683/1‑100 (MQ=255) gCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGc > 2:2030296/1‑100 (MQ=255) cAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGc < 1:368477/100‑1 (MQ=255) aaaaTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGcac < 2:1384961/100‑1 (MQ=255) aaaTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGcac < 2:2319383/100‑1 (MQ=255) aaaTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGcaca > 1:103/1‑100 (MQ=255) aaTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACAt < 2:822245/100‑1 (MQ=255) aTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATg > 1:2134173/1‑100 (MQ=255) tACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTAGTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGa > 2:1252576/1‑100 (MQ=255) tACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATg < 1:534333/100‑1 (MQ=255) tACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGa > 1:1307178/1‑100 (MQ=255) acacCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGa > 2:1185317/1‑100 (MQ=255) cacCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACAt > 1:266479/1‑97 (MQ=255) acCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAAt < 1:1276989/100‑1 (MQ=255) ccGCGATCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGCTTACCAACTGGCTCAATTATTACGTCTACCATATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATc < 2:531235/100‑1 (MQ=255) ccGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATc > 2:346869/1‑100 (MQ=255) ccGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATc > 1:1862830/1‑100 (MQ=255) cgcgAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATcc < 2:579803/100‑1 (MQ=255) gagcTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTgg > 1:769018/1‑100 (MQ=255) gagcTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACGGGCGCAACTATTACGTCTACCAGATCACACCATCCCATCTACGTCACATGAATCCa > 1:2043146/1‑94 (MQ=255) tGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGAtt < 2:867970/100‑1 (MQ=255) ggCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTa > 1:1004664/1‑100 (MQ=255) ggCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTa > 1:2091484/1‑100 (MQ=255) cGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAt > 1:2332315/1‑100 (MQ=255) cGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtc > 2:1678713/1‑100 (MQ=255) gTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtc < 2:341701/100‑1 (MQ=255) aGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtctt < 1:2349744/100‑1 (MQ=255) gTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtcttc > 2:858478/1‑100 (MQ=255) gTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtcttc < 2:1030734/100‑1 (MQ=255) tCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACAATCTACGGAACATGAATCCAACGCGGGATTAAttttc > 1:2340583/1‑99 (MQ=255) tCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCAAAACTATTACGTCTACCAGACCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACACTGGATTAAtcttc < 2:1430239/98‑1 (MQ=255) naCGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtg > 2:150723/2‑100 (MQ=255) cACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGCATCCAACGCTGGATTAAtcttct > 1:114663/1‑99 (MQ=255) cACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtcttct > 1:1390278/1‑99 (MQ=255) cACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtgn < 2:103/100‑2 (MQ=255) cACGGTAATTTACTCTTTACCAACTGGCTCAACTATTCCGGCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtg < 2:710120/100‑1 (MQ=255) agttattttACTTTTTCCCAATTTGGTCAACTATTAGTTCTACGATACAACGCCATACG‑TCTATGTCACATGAATCCAACGCTGGATTAATGTTAtg < 2:483364/91‑1 (MQ=255) gTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGAt < 2:1336568/100‑1 (MQ=255) gTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGAt < 1:1461789/100‑1 (MQ=255) gTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGAt > 1:2036258/1‑100 (MQ=255) gTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGAt < 1:250851/100‑1 (MQ=255) tAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGAt > 1:766654/1‑99 (MQ=255) tAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAg < 1:904168/100‑1 (MQ=255) aaTTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAg > 2:815193/1‑100 (MQ=255) aTTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGAAAATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGt > 1:1697778/1‑100 (MQ=255) tttACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGTTatt > 1:631959/1‑97 (MQ=255) ttACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCg > 1:2199694/1‑100 (MQ=255) ttACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCg < 2:2036243/100‑1 (MQ=255) ttACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGa > 1:1390922/1‑100 (MQ=255) cTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCg > 2:1642358/1‑100 (MQ=255) cTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCg > 2:2263691/1‑100 (MQ=255) cTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCg > 1:20495/1‑100 (MQ=255) gTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGCTAGTcttttgt > 1:1516391/1‑94 (MQ=255) gTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATc > 2:562019/1‑98 (MQ=255) gTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGt > 1:1890600/1‑100 (MQ=255) gTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGt < 2:487570/100‑1 (MQ=255) tttACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGtt > 2:2207622/1‑100 (MQ=255) ttACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTaa < 1:891654/100‑1 (MQ=255) tACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACTAGATTACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTTTGATAGTTGATCGTTaa > 2:1291407/1‑100 (MQ=255) tACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATCCGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTa < 1:1404071/99‑1 (MQ=255) tACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTaa < 2:1180478/100‑1 (MQ=255) naCCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTaa > 2:2178001/2‑100 (MQ=255) ccAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTaatc > 1:1360996/1‑98 (MQ=255) ccAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGc > 2:889276/1‑100 (MQ=255) ccAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGc < 1:2055492/100‑1 (MQ=255) cAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCg < 1:2000561/100‑1 (MQ=255) aCTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGAt < 1:2126469/100‑1 (MQ=255) cTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTc < 2:1737839/100‑1 (MQ=255) tGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCa > 1:933569/1‑100 (MQ=255) tGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCa > 1:2010362/1‑100 (MQ=255) tGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACACCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATGAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTc < 2:1415156/100‑1 (MQ=255) ggCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTACTCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCa > 2:339538/1‑100 (MQ=255) ggCTCAACTATTAAGTCTACCAGATCACGCCATACGATATACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCa > 2:1453106/1‑100 (MQ=255) cAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCCGGATTAATCTTCGGTGCTAGTCGATCGTTAAGCGCTTCAg > 2:815331/1‑97 (MQ=255) cAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTGAGCAcc > 2:1360946/1‑100 (MQ=255) aaCTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCAcc < 1:740292/100‑1 (MQ=255) cTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTa > 1:2084433/1‑100 (MQ=255) tATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTa > 1:1441095/1‑100 (MQ=255) aTTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCtt > 1:1522441/1‑98 (MQ=255) aCGTCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATAGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCa > 1:2132013/1‑100 (MQ=255) tCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGc > 1:318205/1‑100 (MQ=255) tCTACCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGc < 1:1740437/100‑1 (MQ=255) tACCAGATCACGCCATACGCTCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCa < 1:2028806/100‑1 (MQ=255) aCCAGATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCAcc > 1:909824/1‑100 (MQ=255) aCCACATCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGAGCGTTAAGCGATTCAGCACCTTCCCTCATGc < 2:420004/97‑1 (MQ=255) ccAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCAcc > 1:119567/1‑100 (MQ=255) gATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTc > 1:2096683/1‑100 (MQ=255) aTCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCg < 1:448553/100‑1 (MQ=255) tCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCgg > 1:27405/1‑100 (MQ=255) tCACGCCATACG‑TCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGAGAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCggg < 2:1307172/100‑1 (MQ=255) cGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTg > 2:1349323/1‑100 (MQ=255) cATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGGTTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTAgg > 2:1822449/1‑94 (MQ=255) cATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGcc < 2:1862817/99‑1 (MQ=255) cATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCt > 2:717939/1‑100 (MQ=255) aTCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTa < 1:645107/100‑1 (MQ=255) aTCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTa > 2:269490/1‑100 (MQ=255) | GATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTA > NC_000913/4215081‑4215277 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |