| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,326,925:1 | (C)6→7 | 100% | coding (817/1185 nt) | atoB → | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,326,919 | 1 | . | C | 53.3% | 165.4 / 180.4 | 90 | coding (811/1185 nt) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (24/18); new base C (26/22); total (50/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAC > NC_000913/2326821‑2327012 | aaGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑c > 2:1689493/1‑100 (MQ=255) ngCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCAGCTCTGGTGATTATGGAATAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑cc > 2:2035549/2‑100 (MQ=255) aGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑cc > 1:2268331/1‑100 (MQ=255) cAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑cccc < 1:632289/100‑1 (MQ=255) ggAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑cccc‑c‑c > 2:884522/1‑100 (MQ=255) aaCAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTg < 2:913500/100‑1 (MQ=255) aGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTCCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCt < 2:331683/100‑1 (MQ=255) gTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTc > 2:1845267/1‑100 (MQ=255) tCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGTTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCg < 2:462696/100‑1 (MQ=255) cACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCg < 1:440897/100‑1 (MQ=255) aCCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGc < 2:1045731/100‑1 (MQ=255) ccGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCa > 1:961934/1‑100 (MQ=255) ccGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACCGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCa < 2:1412185/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCAt < 1:1229087/100‑1 (MQ=255) gCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCAtt > 1:1482177/1‑100 (MQ=255) gggAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTaaa > 1:994988/1‑100 (MQ=255) gAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAg > 1:348982/1‑100 (MQ=255) gAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAg > 1:575519/1‑100 (MQ=255) aaCGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGt < 1:1931096/100‑1 (MQ=255) aaCGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGtt > 1:171539/1‑100 (MQ=255) cgcgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTa > 1:634000/1‑100 (MQ=255) cgcgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTa < 2:1745521/100‑1 (MQ=255) gcgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTAt < 1:797752/100‑1 (MQ=255) gTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAGGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCCGC‑CTGGCTCGCATTAAACGTGATGc > 2:1831604/1‑100 (MQ=255) tCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGcc < 1:1821950/100‑1 (MQ=255) tCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGcc > 1:2164890/1‑100 (MQ=255) tGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAg > 2:112166/1‑99 (MQ=255) tGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGc < 2:2350224/100‑1 (MQ=255) tGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGc > 1:2305040/1‑100 (MQ=255) ggTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGc > 1:581293/1‑100 (MQ=255) ggTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGc > 1:254265/1‑100 (MQ=255) ggTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCg < 2:1630680/100‑1 (MQ=255) ggTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCg > 2:474169/1‑100 (MQ=255) ggTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCg > 1:1799547/1‑100 (MQ=255) tATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCgg > 1:1864665/1‑100 (MQ=255) aTTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGt < 2:1580935/100‑1 (MQ=255) ttAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTg > 1:1221457/1‑100 (MQ=255) tAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTgg > 2:2008799/1‑100 (MQ=255) aaCGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGc > 1:824158/1‑100 (MQ=255) cgacgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGt > 1:1290280/1‑100 (MQ=255) gacgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTg < 1:1341480/100‑1 (MQ=255) gacgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTg < 1:2217191/100‑1 (MQ=255) gacgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGc > 2:118140/1‑100 (MQ=255) cgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcc < 1:1378615/100‑1 (MQ=255) gctgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCg < 1:2276710/100‑1 (MQ=255) tgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCa > 1:1768831/1‑100 (MQ=255) gcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCa < 1:2056403/100‑1 (MQ=255) gcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCa > 1:2185114/1‑100 (MQ=255) gcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAt > 1:2187741/1‑100 (MQ=255) gcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAt < 2:768257/100‑1 (MQ=255) ccGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAtt < 1:615646/100‑1 (MQ=255) gCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTg < 2:325207/100‑1 (MQ=255) ctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATg < 1:229970/100‑1 (MQ=255) ctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATg > 1:1789823/1‑100 (MQ=255) tGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg < 2:585022/100‑1 (MQ=255) tGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg < 2:491758/100‑1 (MQ=255) tGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGACTCGCATTAAAAGATATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg > 2:402222/1‑100 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCGGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCGGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGt > 2:1419332/1‑100 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg > 1:1416434/1‑100 (MQ=255) tGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTCATggg > 2:1845973/1‑98 (MQ=255) tGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTAt > 1:2167513/1‑100 (MQ=255) gATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATg < 2:1416475/100‑1 (MQ=255) gATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATg > 2:1715390/1‑100 (MQ=255) aTTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATgg < 2:289434/100‑1 (MQ=255) aTTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATgg > 1:1190637/1‑100 (MQ=255) ttATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATggg > 1:1111800/1‑100 (MQ=255) tATGGAACAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTAGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATggg < 2:998094/100‑1 (MQ=255) aTGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATgggg > 2:859434/1‑100 (MQ=255) tGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGc > 1:412526/1‑100 (MQ=255) gaagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAg > 2:927198/1‑100 (MQ=255) gaagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAg > 1:1409224/1‑100 (MQ=255) agaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGt > 1:1213826/1‑100 (MQ=255) gaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTa < 1:576319/100‑1 (MQ=255) gaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTAc > 1:1681350/1‑100 (MQ=255) tCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCCCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTAcc < 2:1303591/100‑1 (MQ=255) tCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTg < 2:1501771/100‑1 (MQ=255) tCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTg < 1:1572514/100‑1 (MQ=255) cTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTg > 2:921483/1‑100 (MQ=255) tGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTCTGGGGCCAGTACCCGcc > 2:398390/1‑100 (MQ=255) tGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGcc > 1:319468/1‑100 (MQ=255) ggcgCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑CGCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGc < 2:1351411/97‑1 (MQ=255) ggcgCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACg < 2:1799534/100‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACg > 1:1533267/1‑100 (MQ=255) cgcTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGc > 1:1761221/1‑100 (MQ=255) ggCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaaaa > 1:493885/1‑100 (MQ=255) cagcagGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg < 1:2263835/100‑1 (MQ=255) cagcagGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGc > 2:162399/1‑100 (MQ=255) cagcagGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGc < 2:1338971/100‑1 (MQ=255) agcagGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg < 2:1768818/100‑1 (MQ=255) agcagGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg > 1:2054263/1‑100 (MQ=255) gcagGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg < 2:309761/100‑1 (MQ=255) cagGCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGt > 1:1826345/1‑100 (MQ=255) cagGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt > 2:427896/1‑100 (MQ=255) gCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAc < 1:1485400/100‑1 (MQ=255) gCCTTAC‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAc < 2:2339800/100‑1 (MQ=255) | AAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑C‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAC > NC_000913/2326821‑2327012 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |