| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 50326 | NA (NA) | 3 (0.040) | 3/164 | NT | NA | intergenic (+24/+54) | folA/apaH | dihydrofolate reductase/diadenosine tetraphosphatase |
| ? | NC_000913 | = 50359 | NA (NA) | noncoding (33/37 nt) | REP5 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP5 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GAACTCTCACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTCGACGGCTGGACAAAATACTGTTTATCTTCCCAGCGCAGG > NC_000913/50260‑50458 | gAACTCTCACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGC < 2:634738‑M2/100‑1 (MQ=255)gAACTCTCACAGCCATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCAGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGC < 2:1455886‑M2/100‑1 (MQ=255) ctctCACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCtt > 1:191197/1‑100 (MQ=255) ctctCACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCtt > 1:1421338/1‑100 (MQ=255) tctcACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTc < 1:1281228/100‑1 (MQ=255) ctcACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCTGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTcc < 1:1510321/100‑1 (MQ=255) ctcACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTcc > 2:2084440/1‑100 (MQ=255) ctcACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTcc > 2:1297167/1‑100 (MQ=255) tcACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCt < 2:927914/100‑1 (MQ=255) tcACAGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCt < 2:1341633/100‑1 (MQ=255) cacaGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCta > 1:1345157/1‑100 (MQ=255) cacaGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTGACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCta > 1:105489/1‑100 (MQ=255) acaGCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCtat < 1:1901394/100‑1 (MQ=255) gCTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATc > 1:19771/1‑100 (MQ=255) cTATTGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCa < 2:1345150/100‑1 (MQ=255) ttGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGc > 2:2120299/1‑100 (MQ=255) ttGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGc < 1:39558/100‑1 (MQ=255) ttGCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGc < 2:1558937/100‑1 (MQ=255) gCTTTGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCtg < 1:161947/100‑1 (MQ=255) tttGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCtgtg < 1:1525107/100‑1 (MQ=255) tttGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATGTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCtgtg < 2:484046/100‑1 (MQ=255) ttGAGATTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTgtgt > 1:1645219/1‑100 (MQ=255) ttGAGATTCTGGAGCGGCGATAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTgtgt > 2:1844551/1‑100 (MQ=255) gagaTTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGttt < 2:19771/100‑1 (MQ=255) gagaTTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGttt < 1:1196359/100‑1 (MQ=255) gagaTTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGttt > 1:1504134/1‑100 (MQ=255) agaTTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTa < 1:1405569/100‑1 (MQ=255) agaTTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTa < 1:1743751/100‑1 (MQ=255) agaTTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTa < 2:439071/100‑1 (MQ=255) gaTTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTaa < 1:611985/100‑1 (MQ=255) aTTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATATAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAg < 2:1865046/100‑1 (MQ=255) aTTCTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAg < 1:3746/100‑1 (MQ=255) cTGGGGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGAc < 2:2072617/99‑1 (MQ=255) cTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGAcg > 2:161234/1‑100 (MQ=255) cTGGAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGAcg > 1:1236824/1‑100 (MQ=255) ggAGCGGCGGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGAcgcc > 2:2328746/1‑100 (MQ=255) gcggcgGTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGAcgccgcc < 2:1575014/100‑1 (MQ=255) cggcggTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGAcgccgccg < 1:168295/100‑1 (MQ=255) ggcggTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCTGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGAcgccgccgc > 1:971257/1‑100 (MQ=255) ggcggTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGAcgccgccgc > 2:2274340/1‑100 (MQ=255) gcggTAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCt > 2:1399884/1‑100 (MQ=255) tAATTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGc < 1:1168477/100‑1 (MQ=255) aaTTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGcc < 2:896729/100‑1 (MQ=255) aaTTTTGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGc > 2:1275619/1‑99 (MQ=255) ttttGTATAGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCa < 1:626676/100‑1 (MQ=255) tataGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATcc > 1:1158135/1‑100 (MQ=255) tataGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATcc > 2:912222/1‑100 (MQ=255) aGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTa > 1:1206015/1‑100 (MQ=255) aGAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTa < 1:733652/100‑1 (MQ=255) gAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCgctagccgtaaattctatacaaaattaccgccgctccagaatctcaaagcaa < 1:222317‑M2/100‑53 (MQ=255) gAATTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTCTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAACTCCTTAt > 2:134875/1‑100 (MQ=255) aaTTTACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATg < 1:939613/100‑1 (MQ=255) tttACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGcc < 1:1825203/100‑1 (MQ=255) tttACGGCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGcc < 1:1364859/100‑1 (MQ=255) ggCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTc < 1:555017/100‑1 (MQ=255) ggCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTc > 2:24867/1‑100 (MQ=255) gCTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTCg < 1:2292179/100‑1 (MQ=255) cTAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTCGa > 1:2011856/1‑100 (MQ=255) tAGCGCCGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTCGAc < 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ccGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTCGACGGCTg < 2:606756/100‑1 (MQ=255) ccGGATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTCGACGGCTg < 1:1091553/100‑1 (MQ=255) cGGATGCGGCGGCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGGGTTTATGACGCAGCCGCTTCGCTCAAATCCTTATGCCGGTTCGACGGCTg < 2:134356/99‑1 (MQ=255) ggATGCGACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTCGACGGCTGGa > 2:1496159/1‑100 (MQ=255) gACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTCGACGGCTGGACAAAAt < 1:1571958/100‑1 (MQ=255) gACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTCGACGGCTGGACAAAAt < 1:158565/100‑1 (MQ=255) gACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTCGACGGCTGGACAAAAt > 1:1967516/1‑100 (MQ=255) gACGCCGGTCGCGTCTTATCCGGCCTTCCTATATCAGGCTGTGTTTAAGACGCCGCCGCTTCGCCCAAATCCTTATGCCGGTTCGACGGCTGGACAAAAt < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |