| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,326,925 | (C)6→7 | coding (817/1185 nt) | atoB → | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,326,919 | 1 | . | C | 95.9% | 169.5 / 1.2 | 49 | coding (811/1185 nt) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/2); new base C (21/26); total (21/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACA > NC_000913/2326820‑2327013 | aaaGCAGGAACAGACACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑a > 1:1378255/1‑100 (MQ=255) aGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑‑cc > 1:500549/1‑100 (MQ=255) gCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑‑ccc > 2:2217612/1‑100 (MQ=255) ggAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑agatcgg > 1:2101085/1‑94 (MQ=255) ggAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑‑cccc‑cc > 1:1472577/1‑100 (MQ=255) gAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑‑cccc‑ccc < 2:2173455/100‑2 (MQ=255) gAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑‑cccc‑ccc < 1:487046/100‑2 (MQ=255) aCAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑‑cccc‑ccctg < 2:1476092/100‑4 (MQ=255) gTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑‑cccc‑ccctggc < 1:467600/99‑6 (MQ=255) ccGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCa > 2:288758/1‑100 (MQ=255) ccGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCa < 2:2150150/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCAt < 2:828999/100‑1 (MQ=255) ggAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTaaaa < 2:1827895/100‑1 (MQ=255) gAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAg > 1:1507392/1‑100 (MQ=255) aaCGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGt > 2:1095252/1‑100 (MQ=255) cgcgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTa < 1:116200/100‑1 (MQ=255) cgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATg < 2:1852529/100‑1 (MQ=255) cgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATg < 1:928874/100‑1 (MQ=255) tCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGcc < 1:840450/100‑1 (MQ=255) cTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCa > 2:760389/1‑100 (MQ=255) ggTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGc < 1:1175965/100‑1 (MQ=255) gTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCg < 2:1637123/100‑1 (MQ=255) tATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCgg < 2:703423/100‑1 (MQ=255) cgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcc > 2:2194343/1‑100 (MQ=255) cgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcc > 1:339386/1‑100 (MQ=255) tgctgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGccccc < 1:1302546/100‑1 (MQ=255) tgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGc > 1:162570/1‑100 (MQ=255) ccGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAt < 1:127849/100‑1 (MQ=255) cGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAtt < 2:1650461/100‑1 (MQ=255) ctctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGa > 2:762595/1‑100 (MQ=255) tGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATgg > 1:1745206/1‑100 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg < 1:100525/100‑1 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg > 1:1417005/1‑100 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg < 2:782802/100‑1 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑‑CCCCACCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg < 2:917547/100‑1 (MQ=255) gATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTAt > 1:1961604/1‑100 (MQ=255) gATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTAt > 2:898250/1‑100 (MQ=255) tATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATggg < 2:1378257/100‑1 (MQ=255) ggAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGcc < 2:1726932/100‑1 (MQ=255) ggAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGcc < 2:415622/100‑1 (MQ=255) gaagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCa > 1:1587621/1‑100 (MQ=255) gaagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCa > 1:1654434/1‑100 (MQ=255) aagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAg < 1:713575/100‑1 (MQ=255) agaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACCCCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTCTGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGAGGGGTATGGGGCCAg > 1:1887001/1‑100 (MQ=255) aTCTGTGGCGCTGGCAGCAGGCCTTGC‑‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTAcc < 2:2045723/100‑1 (MQ=255) cagcagGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg < 2:1100881/100‑1 (MQ=255) cagcagGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg > 1:1827389/1‑100 (MQ=255) gcagGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg > 2:1969648/1‑100 (MQ=255) gcagGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg > 2:702068/1‑100 (MQ=255) gcagGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg > 1:129930/1‑100 (MQ=255) cagGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGt < 2:1012773/100‑1 (MQ=255) cagGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGt < 2:801231/100‑1 (MQ=255) agGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt < 1:194404/100‑1 (MQ=255) agGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt < 1:1791585/100‑1 (MQ=255) agGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt < 1:2217598/100‑1 (MQ=255) agGCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGAAAAGCAAAAAGCGtt < 1:940365/100‑1 (MQ=255) ggCCTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTa > 2:1333402/1‑100 (MQ=255) ccTT‑AC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACa > 2:683543/1‑100 (MQ=255) | AAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACA > NC_000913/2326820‑2327013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |