| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 308,054 | (C)7→6 | 100% | coding (1279/2526 nt) | ecpC ← | ECP production outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 308,048 | 0 | C | . | 95.1% | 524.9 / 14.6 | 121 | coding (1285/2526 nt) | ecpC | ECP production outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/3); new base . (47/68); total (49/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
AGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGG > NC_000913/307951‑308143 | aGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccc < 2:1281062/100‑1 (MQ=255)aGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccc < 2:1532896/100‑1 (MQ=255) gCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccc > 2:1926290/1‑100 (MQ=255) gCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccc > 2:2128488/1‑100 (MQ=255) cTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccaag > 1:1056139/1‑97 (MQ=255) cTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccaag < 1:2990761/100‑4 (MQ=255) cTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccaag > 2:2993529/1‑97 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg < 1:349955/100‑1 (MQ=255) aaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCgg < 1:1445269/100‑1 (MQ=255) aaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCgg > 1:2473473/1‑100 (MQ=255) gCCTCCCTGTAGAGTGGCGCTGTGGCTGCTTATGCTGCTCCATGAGGTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGc < 1:2565197/99‑1 (MQ=255) gCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCa < 2:229343/100‑1 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTGGCTCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCg < 2:3012882/100‑1 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCg < 1:142960/100‑1 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCg < 1:942273/100‑1 (MQ=255) cccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGt > 1:369428/1‑100 (MQ=255) cccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGt > 1:737598/1‑100 (MQ=255) ccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTc < 2:2647547/100‑1 (MQ=255) ccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTc < 2:1434855/100‑1 (MQ=255) ccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTc > 1:1110787/1‑100 (MQ=255) cGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCa < 1:38672/100‑1 (MQ=255) tAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGAc < 2:1652109/100‑1 (MQ=255) agagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACg > 1:1741199/1‑100 (MQ=255) gTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGt > 2:2256294/1‑100 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGtt < 2:1223127/100‑1 (MQ=255) gcgcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTc < 1:1931611/100‑1 (MQ=255) gcgcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTc < 2:520586/100‑1 (MQ=255) cgcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTca < 2:2390358/100‑1 (MQ=255) gcTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcac < 1:1904810/100‑1 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGCGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcac < 2:2142134/99‑1 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacc < 2:289063/100‑1 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacc < 2:2285572/100‑1 (MQ=255) tGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcaccc < 2:1985052/100‑1 (MQ=255) tGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcaccc < 1:343997/100‑1 (MQ=255) aTGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccac < 2:1684226/100‑1 (MQ=255) tgctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccacc < 1:910681/100‑1 (MQ=255) tgctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccacc > 1:2344864/1‑100 (MQ=255) gctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCg > 1:1443587/1‑100 (MQ=255) gctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCg > 2:3049197/1‑100 (MQ=255) gctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCg > 2:2424593/1‑100 (MQ=255) gctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGACAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCg > 1:166029/1‑100 (MQ=255) ctgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGc < 2:1602188/100‑1 (MQ=255) gcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCt > 2:2561177/1‑100 (MQ=255) ccGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTg > 2:1186994/1‑100 (MQ=255) cGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGa > 2:534358/1‑100 (MQ=255) gATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAt > 1:2659345/1‑100 (MQ=255) aTGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAtt < 2:271555/100‑1 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATc > 2:2409594/1‑100 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATc < 2:2174059/100‑1 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATc < 2:737603/100‑1 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATc > 1:121203/1‑100 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg < 1:1683121/100‑1 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg < 1:2536063/100‑1 (MQ=255) tgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCACGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCg < 1:2889859/100‑1 (MQ=255) gctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGt > 2:1366438/1‑100 (MQ=255) aTGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCa < 2:892303/100‑1 (MQ=255) aTGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCa < 2:134567/100‑1 (MQ=255) gAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCata < 2:2298805/100‑1 (MQ=255) gAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCata < 2:2826732/100‑1 (MQ=255) gCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGACAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCatat < 2:426769/99‑1 (MQ=255) tGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATccc > 1:1914067/1‑100 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg > 1:1101748/1‑100 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑TCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg < 1:2061690/100‑1 (MQ=255) cACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGtt > 2:239168/1‑100 (MQ=255) cACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGtt > 1:2660659/1‑100 (MQ=255) aCTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTg < 1:2333704/100‑1 (MQ=255) aCTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTg < 1:2694887/100‑1 (MQ=255) ccAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgcc < 2:769721/100‑1 (MQ=255) ccAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgcc > 1:468744/1‑100 (MQ=255) gCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAg < 2:1964517/100‑1 (MQ=255) gCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATACCGTTGCCGCCCa > 1:1827293/1‑99 (MQ=255) cATATTTTTCAAGTTAACGTTGTTCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGTTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGGCGccc < 1:10288/97‑1 (MQ=255) cATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGc < 2:2608405/100‑1 (MQ=255) cgatcttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCt < 1:1208716/95‑1 (MQ=255) atatTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCt > 1:2574746/1‑100 (MQ=255) ttttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTaac < 1:2298235/100‑2 (MQ=255) tttGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAg < 1:1394124/100‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CACCCCAATCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCg < 1:441177/100‑1 (MQ=255) tGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTagatcg > 2:1208722/1‑95 (MQ=255) tGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGt > 2:2731132/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc < 1:3040544/100‑1 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc > 1:80681/1‑100 (MQ=255) gTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCa < 1:1366432/100‑1 (MQ=255) ttAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCaa < 2:1500955/100‑1 (MQ=255) ttAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCaa < 1:534354/100‑1 (MQ=255) tAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAAt < 1:2887786/100‑1 (MQ=255) tAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAAt < 2:409748/100‑1 (MQ=255) aaCGTTGATCG‑CCTCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATg < 2:1777172/100‑1 (MQ=255) aaCGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATg < 1:1778014/100‑1 (MQ=255) aCGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa > 1:1997349/1‑100 (MQ=255) aCGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa > 2:1050166/1‑100 (MQ=255) cGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATg > 1:23715/1‑99 (MQ=255) cGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCCCCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa < 2:1912491/99‑1 (MQ=255) cGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAg > 2:1121798/1‑100 (MQ=255) gTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGc < 1:730442/100‑1 (MQ=255) ttGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGcc < 1:571752/100‑1 (MQ=255) tGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGTCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCg > 1:2709582/1‑100 (MQ=255) tGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACCCAATGAGCCg > 1:2907589/1‑100 (MQ=255) gATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCgg < 2:1056145/100‑1 (MQ=255) gATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCgg > 1:326450/1‑100 (MQ=255) | AGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGG > NC_000913/307951‑308143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |