| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,652,855:1 | (G)6→7 | 100% | coding (362/846 nt) | sseA → | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,652,849 | 1 | . | G | 95.7% | 405.3 / 11.1 | 115 | coding (356/846 nt) | sseA | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/1); new base G (51/59); total (55/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAT > NC_000913/2652750‑2652943 | aGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑Ct > 1:1082716/1‑100 (MQ=255) tAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑‑gg‑gg < 2:2349878/100‑1 (MQ=255) aGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑‑gg‑gggg > 2:1574803/1‑100 (MQ=255) gCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCACACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑‑gg‑ggggg < 2:271568/100‑2 (MQ=255) ccTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑‑gg‑gggggtgg < 1:2956305/100‑5 (MQ=255) ccTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑‑gg‑gggggtgg > 2:319875/1‑96 (MQ=255) cTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑‑gg‑gggggtgga > 2:748585/1‑95 (MQ=255) tGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGAc > 2:213927/1‑100 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACt < 2:800216/100‑1 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACt > 2:2199306/1‑100 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGCAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑‑gg‑gggggtggatt < 2:2062614/100‑8 (MQ=255) gATTGTATATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACt < 2:1409822/100‑1 (MQ=255) aTTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGAcct > 1:1854519/1‑98 (MQ=255) ttGTCTACGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTg > 2:1606768/1‑100 (MQ=255) gTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATTCTGCGCAGCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGc < 1:676120/99‑1 (MQ=255) gTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGc < 2:2513171/99‑1 (MQ=255) tCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGATCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGc > 1:2358151/1‑98 (MQ=255) tCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAg < 1:2972418/100‑1 (MQ=255) tCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAg < 1:2784214/100‑1 (MQ=255) cTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTCGAGCAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAgg > 1:936167/1‑100 (MQ=255) tATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGc < 2:1115483/100‑1 (MQ=255) tATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGACCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCt > 1:2003650/1‑100 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTg < 1:2199293/100‑1 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTg < 2:1376617/100‑1 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTg < 1:610614/100‑1 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTgg < 2:1502523/100‑1 (MQ=255) aCGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGc < 1:821458/100‑1 (MQ=255) cGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGGG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGc < 1:94684/100‑1 (MQ=255) cGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCa > 2:2476203/1‑100 (MQ=255) cGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCa > 2:144320/1‑100 (MQ=255) tAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCga > 2:1072784/1‑100 (MQ=255) tAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCga > 2:1727608/1‑100 (MQ=255) tCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatga < 2:1082722/100‑1 (MQ=255) cTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGCGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatga > 1:472747/1‑99 (MQ=255) ttttCTCAGCGCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTTGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGATGGCAGCGCGATGATc < 1:2846622/100‑1 (MQ=255) ttttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATc > 1:2696271/1‑100 (MQ=255) ttttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATc > 2:3027957/1‑100 (MQ=255) ttttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATc > 2:783914/1‑100 (MQ=255) ttttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATc < 1:1796609/100‑1 (MQ=255) ttttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATc < 1:1991125/100‑1 (MQ=255) ttttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATc < 1:2021397/100‑1 (MQ=255) tttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGGGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATct > 2:1302631/1‑100 (MQ=255) ttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctg > 1:43521/1‑100 (MQ=255) tctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgc < 2:1396647/100‑1 (MQ=255) tctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgc < 2:159605/100‑1 (MQ=255) ctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgct > 2:2712771/1‑100 (MQ=255) tcAGCCCCACGGGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgctg < 2:496013/100‑1 (MQ=255) tcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgctg > 1:148236/1‑100 (MQ=255) tcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgctg < 1:2264605/100‑1 (MQ=255) cAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCGCCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgctg < 1:1004903/99‑1 (MQ=255) aGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGtt > 2:125357/1‑100 (MQ=255) aGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGtt < 1:2944641/100‑1 (MQ=255) aGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGtt < 2:1549819/100‑1 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCGTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 1:2654064/100‑1 (MQ=255) ccccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTag < 2:1007764/100‑1 (MQ=255) ccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaa < 2:1854530/100‑1 (MQ=255) aCGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaaga < 1:1399209/100‑1 (MQ=255) cGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAgaagaa < 1:1431327/100‑1 (MQ=255) cGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAgaagaa > 1:1746342/1‑100 (MQ=255) gAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 2:1990167/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg > 1:703127/1‑100 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 2:2823788/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 2:1408835/100‑1 (MQ=255) aTGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGc < 1:463912/100‑1 (MQ=255) ggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAg < 2:1587939/100‑1 (MQ=255) ggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAg < 1:1075616/100‑1 (MQ=255) ggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAg < 2:471739/100‑1 (MQ=255) gtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGt < 2:2884906/100‑1 (MQ=255) gtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGt < 2:2883635/100‑1 (MQ=255) tggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTa < 2:426530/100‑1 (MQ=255) gATGCTGCGCACCGTTGGTGTAGAGAAAGTGACGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATGTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTaga > 1:1520814/1‑100 (MQ=255) tgctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGc > 2:3060345/1‑100 (MQ=255) tgctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGc > 2:3060261/1‑100 (MQ=255) tgctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGc < 2:43522/100‑1 (MQ=255) tgctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGc > 2:1942825/1‑100 (MQ=255) tgctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGc < 2:1454686/100‑1 (MQ=255) gctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCt > 2:2750043/1‑100 (MQ=255) ctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTg < 2:2936928/100‑1 (MQ=255) gcgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGcc < 1:367248/100‑1 (MQ=255) gcgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACGTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGcc < 2:1237644/100‑1 (MQ=255) aCCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGa < 1:597661/99‑1 (MQ=255) cTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAgg < 1:2298804/100‑1 (MQ=255) tttGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGGG‑GGGGTGTACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAgg < 2:1855935/100‑1 (MQ=255) tgtAGAGAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGtt > 1:1177560/1‑100 (MQ=255) ccgatctaGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTa < 1:558254/93‑1 (MQ=255) agagAAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTaa > 1:62709/1‑100 (MQ=255) agaAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcg > 2:149543/1‑100 (MQ=255) gaAAGTGTCGATTCCG‑‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgc > 1:2472716/1‑100 (MQ=255) gaAAGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgc > 1:1660151/1‑100 (MQ=255) aaaGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgcc < 2:936172/100‑1 (MQ=255) aaGTGTCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgccg > 2:2716636/1‑100 (MQ=255) gagtCGATT‑CT‑‑GGAGGGGTGGACTTGCAGGCAGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCcgcg > 2:2057578/3‑100 (MQ=255) gtCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGtt > 2:3025604/1‑100 (MQ=255) gtCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGtt > 1:746839/1‑100 (MQ=255) gtCGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGtt < 1:1003339/100‑1 (MQ=255) cGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGttt > 1:1053945/1‑99 (MQ=255) cGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTa > 1:734393/1‑100 (MQ=255) cGATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTa > 1:1603378/1‑100 (MQ=255) gATT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTaa > 1:581002/1‑100 (MQ=255) aTT‑CTG‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAt > 2:1852101/1‑100 (MQ=255) | AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑‑GG‑GGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAT > NC_000913/2652750‑2652943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |