| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3898636 | NA (NA) | 10 (0.100) | 6/162 | NT | NA | noncoding (6/26 nt) | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3898650 | NA (NA) | noncoding (20/26 nt) | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
TGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGC > NC_000913/3898537‑3898734 | cagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGa > 1:1003443‑M1/93‑100 (MQ=255)cagcttccgtgttgcagctgcatccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGa < 2:666709‑M1/8‑1 (MQ=255) gtCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGc > 2:146078/1‑100 (MQ=255) gtCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGc > 2:2099442/1‑100 (MQ=255) tCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCg > 2:1920625/1‑100 (MQ=255) ttGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtg > 1:751329‑M1/1‑94 (MQ=255) tCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTc < 1:2368501/100‑1 (MQ=255) cAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTTTTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTca > 1:3057584/1‑100 (MQ=255) aGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAATTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTcac < 1:1882941/100‑1 (MQ=255) gggTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTcaca > 1:34397/1‑100 (MQ=255) tATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCTTTTTTTTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtc < 1:2135521‑M2/100‑3 (MQ=255) tATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtc < 1:1615598‑M2/100‑3 (MQ=255) tctcTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccg < 2:1565895‑M2/100‑5 (MQ=255) tctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccggc < 1:1430325‑M2/100‑7 (MQ=255) catccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGc > 1:1315094‑M1/73‑100 (MQ=255) ctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcc < 2:1245466‑M1/100‑22 (MQ=255) ctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcc > 1:2617387‑M2/1‑93 (MQ=255) atccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGcc > 2:2904020‑M1/72‑100 (MQ=255) tccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCt > 1:848400‑M1/71‑100 (MQ=255) tccttcgctgatggtaatcgctgataaagcagctgccgcagaattagcactcgtttaaccttaagcaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGcc > 1:2233095‑M1/71‑99 (MQ=255) ccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCtt > 2:1488742‑M1/70‑100 (MQ=255) ccttcgctgatggtaatcgctgataaagccgctgccgcagaattagcactcggttaagcttaagaaataAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCtt > 2:1233250‑M1/70‑100 (MQ=255) gCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTAtt < 1:52380/100‑1 (MQ=255) cTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttct < 2:1174017‑M1/100‑28 (MQ=255) tGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTc < 2:980332/100‑1 (MQ=255) tctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCtt < 1:2547068/100‑1 (MQ=255) ctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCtaa < 2:2075536/100‑3 (MQ=255) ctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTa < 2:693293/100‑1 (MQ=255) ctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTa < 2:1614382/100‑1 (MQ=255) ctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTAAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTa < 1:2920010/100‑1 (MQ=255) tcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTaa < 2:1727959/100‑1 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg < 1:1808041/100‑1 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg > 1:2680188/1‑100 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg > 2:2498684/1‑100 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg < 1:332929/100‑1 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATCCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg > 2:1910987/1‑100 (MQ=255) tccTGCGGAAAGATAAGGCTAAGGGGTCATTTGTCGTAGTTTTTTAAATAATGAGGAAATGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCCCATCTCTTAAg < 1:1111056/97‑1 (MQ=255) cACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGc > 2:536015/1‑100 (MQ=255) aCTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCt < 1:2327749/100‑1 (MQ=255) aCTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCt < 2:2539458/100‑1 (MQ=255) tGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTa < 2:838574/100‑1 (MQ=255) gCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTTTTTTTTTTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTa > 1:965129/1‑99 (MQ=255) gCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTaa > 1:445943/1‑100 (MQ=255) gCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTa < 2:2704689/99‑1 (MQ=255) ggCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAAcc > 2:2303528/1‑100 (MQ=255) ggCAAGCTGAGACTGTGGGGCGATTTTTCATAGTTATTTATATGATGAGAACAGGCCGGCGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTT‑TTAAGCTTAACCg < 1:661302/100‑1 (MQ=255) aGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGt < 1:2580668/100‑1 (MQ=255) gCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTg < 1:1590735/100‑1 (MQ=255) cTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGc > 1:598560/1‑100 (MQ=255) tGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCt > 1:2033725/1‑100 (MQ=255) cTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTAACACATACGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTc > 1:1510543/1‑100 (MQ=255) gtgGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTg < 2:1284331/100‑1 (MQ=255) gtgggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGc > 2:2341110/3‑100 (MQ=255) ggggTGATTTTTAGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCg < 1:2733401/100‑1 (MQ=255) ggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACTCATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGc < 1:1699316/100‑1 (MQ=255) ggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGc > 1:1213540/1‑100 (MQ=255) ggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGc > 1:2834036/1‑100 (MQ=255) aTTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCg < 1:2508306/100‑1 (MQ=255) aTTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCg > 1:1531745/1‑100 (MQ=255) ttttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGc < 1:1447356/100‑1 (MQ=255) ttttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGc < 1:1830003/100‑1 (MQ=255) tttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCt < 1:1972228/100‑1 (MQ=255) tttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCt > 2:2587362/1‑100 (MQ=255) ttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCtt < 2:2245216/100‑1 (MQ=255) ttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCtt > 1:1421369/1‑100 (MQ=255) tCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCttt > 2:559824/1‑100 (MQ=255) cGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTa < 2:2200410/100‑1 (MQ=255) gTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAg > 2:1849539/1‑100 (MQ=255) gTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAg < 2:2048937/100‑1 (MQ=255) ttATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGc < 2:1047211/100‑1 (MQ=255) ttATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGc < 1:1675439/100‑1 (MQ=255) tttAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGAt > 2:466071/1‑100 (MQ=255) tttAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGAt > 1:565117/1‑100 (MQ=255) ttAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGAtt > 1:2110388/1‑100 (MQ=255) ataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCTGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCa < 1:924039/100‑1 (MQ=255) ataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCa > 1:467724/1‑100 (MQ=255) ataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCa < 2:283315/100‑1 (MQ=255) taatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCAt < 1:1849528/100‑1 (MQ=255) aatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggag < 1:973847‑M2/100‑70 (MQ=255) gagaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGc < 2:3057603/100‑1 (MQ=255) gagaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATAAGCGATTACCATCAGc > 2:2915712/1‑100 (MQ=255) agaACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCg < 2:2995916/100‑1 (MQ=255) aCAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcatattctcattatttaaataactacgagaaataaccccacagtctcagcttgacgcagtggagacagcgg < 1:2141915‑M2/100‑77 (MQ=255) aCAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGaa > 2:1385035/1‑99 (MQ=255) cAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcgga < 1:983483‑M2/100‑78 (MQ=255) cAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAgg > 2:519605/1‑100 (MQ=255) aGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaa < 2:410253‑M1/100‑93 (MQ=255) gtccggAGCGTAAGTCACACAtccggcctgttctcattatttcaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaag < 2:2070650‑M2/98‑80 (MQ=255) ggCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaag > 2:1696925‑M1/1‑7 (MQ=255) ggCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaag < 2:751334‑M2/100‑80 (MQ=255) ggCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaag < 1:754428‑M2/100‑80 (MQ=255) ggCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaag < 1:2001999‑M2/100‑80 (MQ=255) gCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaaga < 2:1141619‑M1/100‑95 (MQ=255) ccGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaagag < 2:2327762‑M1/100‑96 (MQ=255) ccGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaagag > 2:1902937‑M1/1‑5 (MQ=255) CCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGc > 1:2393982‑M1/1‑100 (MQ=255) cGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaagag < 2:822135‑M1/99‑96 (MQ=255) CGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCa < 1:2810268‑M1/100‑1 (MQ=255) GAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGc > 2:266486‑M1/1‑100 (MQ=255) GAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGc > 2:1531753‑M1/1‑100 (MQ=255) | TGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGC > NC_000913/3898537‑3898734 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |