| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4240156 | NA (NA) | 7 (0.070) | 5/164 | NT | NA | intergenic (‑101/‑169) | yjbT/psiE | putative periplasmic protein/phosphate starvation inducible protein |
| ? | NC_000913 | = 4240189 | NA (NA) | noncoding (33/37 nt) | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTT > NC_000913/4240090‑4240288 | ttGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGC > 2:1344978‑M2/1‑100 (MQ=255)ttGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGC < 2:1277722‑M2/100‑1 (MQ=255) gCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCt < 2:1208597/100‑1 (MQ=255) ggtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACg > 1:2950557/1‑100 (MQ=255) ggtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACg < 1:1481082/100‑1 (MQ=255) gtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACgg < 1:459496/100‑1 (MQ=255) gtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACgg > 2:1583813/1‑100 (MQ=255) gtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACgg < 2:1466783/100‑1 (MQ=255) ggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggt > 2:720449/1‑100 (MQ=255) cTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtag > 2:100992/1‑100 (MQ=255) tGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtagg < 1:268137/100‑1 (MQ=255) tGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtagg < 1:218766/100‑1 (MQ=255) tGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtagg < 2:1285501/100‑1 (MQ=255) gggAATTACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTGCAGGCCTTGGTGCGGCTTGTCTGGCCGTATGGGCCGCCAGGCGCGGATTAACCGGCCTACGggtaggt < 1:819916/100‑1 (MQ=255) ggAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtaggta < 1:461927/100‑1 (MQ=255) aCCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCg > 2:740127/1‑100 (MQ=255) aCCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCg > 2:2361412/1‑100 (MQ=255) cTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGc < 1:2366602/100‑1 (MQ=255) tGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGc > 1:1214686/1‑99 (MQ=255) tGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtgg < 2:2470295/100‑1 (MQ=255) ggTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg > 1:2497693/1‑100 (MQ=255) tGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGa < 2:2644124/100‑1 (MQ=255) tttttGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgc < 1:1013366/100‑1 (MQ=255) ttttGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTTGTGGa > 1:515360/1‑96 (MQ=255) ttttGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTCCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACTGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgc > 1:1836031/1‑99 (MQ=255) tttGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgcg < 2:2093142/99‑1 (MQ=255) gAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCt > 1:916255/1‑100 (MQ=255) aTTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTcc < 1:645328/100‑1 (MQ=255) ttACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCa < 2:583462/100‑1 (MQ=255) aCCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCCACGAGTGGGTCTATCCGGCTTTGGTGGacgag > 1:2220827/1‑87 (MQ=255) ccGGCTTTGGTTCGGTTTGGCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCGACGGGACGGTGTATCAGGCTTTGGTGGAGGAGCGCt > 1:1753011/1‑94 (MQ=255) ccGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt > 2:2473704/1‑100 (MQ=255) ccGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt > 2:315484/1‑100 (MQ=255) ccGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt > 1:2519033/1‑100 (MQ=255) gCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCa < 1:100991/100‑1 (MQ=255) cTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAg < 1:204811/100‑1 (MQ=255) cTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAg < 1:974680/100‑1 (MQ=255) tttGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAgg < 2:867741/100‑1 (MQ=255) ttGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGt < 2:2964525/100‑1 (MQ=255) tGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGtt < 2:159199/100‑1 (MQ=255) ggTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTg > 2:1215566/1‑100 (MQ=255) gTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGa > 1:1500944/1‑100 (MQ=255) gTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCCTTGGTGGAGGCGCGCTCTAAATCCAGGttaa < 2:2058164/100‑3 (MQ=255) ggTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACaa > 2:2200366/1‑100 (MQ=255) ttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAAc < 1:2400787/100‑1 (MQ=255) ttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAAc < 1:2361399/100‑1 (MQ=255) ttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAAc < 2:675343/100‑1 (MQ=255) ttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAAc < 2:1855517/100‑1 (MQ=255) ttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAAc < 2:464447/100‑1 (MQ=255) ttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAAc < 2:1906153/100‑1 (MQ=255) ttGTCCTGCCTGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTAGAGGCGCACTCCAAATCCACGTTGAACAAAAc < 1:499296/100‑1 (MQ=255) gTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccacc < 2:741111‑M2/100‑63 (MQ=255) gTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccacc < 2:124503‑M2/100‑63 (MQ=255) tCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATa < 1:2100227/100‑1 (MQ=255) cTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATac < 2:2111141/100‑1 (MQ=255) ttGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATac > 2:850366/1‑99 (MQ=255) tGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATacac > 2:2873039/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaa < 2:2927579‑M2/100‑68 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATAcaca > 2:2489045/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATAcaca > 2:2783882/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATAcaca > 1:77077/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGC‑‑‑‑‑ATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgc < 2:2602233‑M2/100‑73 (MQ=255) tGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAat < 2:2317296/100‑1 (MQ=255) tGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAat < 1:2520646/100‑1 (MQ=255) gcgcCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAata > 2:11361/1‑100 (MQ=255) gcgcCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAata < 1:610565/100‑1 (MQ=255) cgccgcCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatat > 2:1431786/1‑100 (MQ=255) cgccgcCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatat > 1:397850/1‑100 (MQ=255) gcctccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAAGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACAAAAAAAat < 1:1611582/97‑1 (MQ=255) gccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatatg > 2:1691593/1‑99 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAg < 1:2238918/100‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAg > 1:686083/1‑100 (MQ=255) cgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGa < 1:1029195/100‑1 (MQ=255) cgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGa < 2:2826584/100‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGAtc < 2:1557920/100‑1 (MQ=255) aGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGAtctc < 2:600965/100‑1 (MQ=255) aGGCGCAGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGAtctc > 1:2481227/1‑100 (MQ=255) ggCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTcc > 2:1091482/1‑100 (MQ=255) gcgcGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCg < 2:2398822/100‑1 (MQ=255) gcgcGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCg < 2:2409656/100‑1 (MQ=255) cgcgGTTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGt < 1:529517/100‑1 (MQ=255) gcgGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTc < 1:2873022/100‑1 (MQ=255) gcgGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTc > 1:2027949/1‑100 (MQ=255) cgGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTca > 1:2193016/1‑100 (MQ=255) ggCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTcac > 2:412357/1‑100 (MQ=255) ggCTTATCCGGCCTACGGGTAAGTATATCAGGATTTGGTGGAAGCGCGCTCCTAATCCAGGTTGAACAAGACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTcac < 1:1323911/100‑1 (MQ=255) aTCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACAtttt > 2:1668606/1‑100 (MQ=255) tCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctct > 1:2167053‑M2/1‑6 (MQ=255) ccGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctg < 1:1400320‑M2/100‑96 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTg < 1:263138/100‑1 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTg < 1:168447/100‑1 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTg > 2:266886/1‑100 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTg < 1:638759/100‑1 (MQ=255) cGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctgg > 2:529521‑M2/1‑4 (MQ=255) cGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGc > 2:3033929/1‑100 (MQ=255) ggCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctgga < 2:2750266‑M2/100‑98 (MQ=255) ggCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctgga < 1:1114280‑M2/100‑98 (MQ=255) ggCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttccagagga > 2:1013371‑M2/1‑3 (MQ=255) ccTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGtt > 2:208955/1‑100 (MQ=255) caagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctggaac > 2:1441755‑M2/1‑1 (MQ=255) | TTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTT > NC_000913/4240090‑4240288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |