Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,800,268 | (T)8→7 | coding (698/699 nt) | waaY ← | lipopolysaccharide core biosynthesis protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,800,261 | 0 | T | . | 98.2% | 487.4 / 2.1 | 108 | intergenic (‑65/+6) | waaZ/waaY | lipopolysaccharide KdoIII transferase; lipopolysaccharide core biosynthesis protein/lipopolysaccharide core biosynthesis protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base . (54/52); total (55/53) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
ACATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGATTTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTC > NC_000913/3800162‑3800356 | ncATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAt > 1:937218/2‑100 (MQ=255) aCATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAt > 1:2686488/1‑100 (MQ=255) cATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAtt < 2:487197/100‑1 (MQ=255) cATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAtt > 1:1498200/1‑100 (MQ=255) aTCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttt > 1:2448843/1‑100 (MQ=255) tCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAtttt > 1:1424176/1‑100 (MQ=255) tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt < 1:1353408/100‑1 (MQ=255) tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt < 1:1986958/100‑1 (MQ=255) tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt > 1:384993/1‑100 (MQ=255) tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt > 1:125158/1‑100 (MQ=255) tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt < 2:2265777/100‑1 (MQ=255) tttttGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAttttttt > 2:2446945/1‑100 (MQ=255) tGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGAtttttttagcg < 1:2743134/100‑5 (MQ=255) tCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAgcgcg < 1:602101/100‑1 (MQ=255) cAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAgcgcgc > 1:2734072/1‑100 (MQ=255) aaTGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCt < 1:1127154/100‑1 (MQ=255) aaTGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCt > 2:851949/1‑100 (MQ=255) tATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGtt > 2:113669/1‑100 (MQ=255) aTCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGttt > 1:1946441/1‑100 (MQ=255) aTCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGttt < 1:1147586/100‑1 (MQ=255) aTCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGttt > 1:1131406/1‑100 (MQ=255) aTCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCACGCTGGttt < 2:345110/100‑1 (MQ=255) tCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTACGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTc > 2:2087917/1‑100 (MQ=255) cTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAAATGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTcc > 1:589519/1‑100 (MQ=255) cTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTGAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTcc < 2:2531006/100‑1 (MQ=255) tAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTccc > 2:176496/1‑100 (MQ=255) tAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTccc > 1:2921905/1‑100 (MQ=255) aaTATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt > 2:2336472/1‑100 (MQ=255) aaTATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt < 2:1675848/100‑1 (MQ=255) aaTATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt > 2:1203514/1‑100 (MQ=255) aaTATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt > 2:628319/1‑100 (MQ=255) aaTATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt > 1:337873/1‑100 (MQ=255) atatTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCtt > 1:565235/1‑100 (MQ=255) tatTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCt > 1:2882418/1‑98 (MQ=255) tatTCTTCAGGATAAACCTTGGAAATAAAGAACTCCGCTTAAATCTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGTGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCttt < 2:575630/100‑1 (MQ=255) atTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTc > 2:334114/1‑100 (MQ=255) atTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTc < 1:1102137/100‑1 (MQ=255) ttcATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAAc < 1:184522/100‑1 (MQ=255) aTGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAAcgcc < 1:1956447/100‑1 (MQ=255) aTGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAAcgcc > 1:2972965/1‑100 (MQ=255) aTGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAAcgcc < 1:1152011/100‑1 (MQ=255) aTGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTGTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCATAcgc > 1:1183711/1‑99 (MQ=255) gATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAAcgccgc > 1:1773971/1‑100 (MQ=255) aTAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCa < 1:2409101/100‑1 (MQ=255) aaCCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATaa < 2:1183705/100‑1 (MQ=255) cTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAAt > 1:1755081/1‑100 (MQ=255) cTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAAt < 1:232913/100‑1 (MQ=255) gtgAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTg < 2:245677/100‑1 (MQ=255) tgAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTgc < 1:2955766/100‑1 (MQ=255) tgAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTgc > 2:300494/1‑100 (MQ=255) gAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTgtg > 2:1068328/1‑98 (MQ=255) gAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTgcg < 1:2199218/100‑1 (MQ=255) gAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTgcg < 1:234603/100‑1 (MQ=255) aataaataACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCa < 1:2867274/100‑1 (MQ=255) ataaataaCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCAt > 1:1930253/1‑100 (MQ=255) taaataaCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGTATAAAATTGCGCAtt > 1:2934319/1‑100 (MQ=255) aaataaCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCAttt > 2:2796569/1‑100 (MQ=255) aataaCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCAtttt < 1:1168071/100‑1 (MQ=255) aataaCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCAtttt > 1:2629057/1‑100 (MQ=255) aCTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTa < 1:2073018/100‑1 (MQ=255) cTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCAtttttttn < 2:589516/99‑2 (MQ=255) cTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTAc > 1:20494/1‑100 (MQ=255) cTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTAc < 1:376793/100‑1 (MQ=255) tCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGATTTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTAc < 1:836116/100‑1 (MQ=255) tCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACg > 2:1697708/1‑100 (MQ=255) tCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACg < 2:1083779/100‑1 (MQ=255) ccGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGa > 2:2596679/1‑100 (MQ=255) gCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGata < 2:766576/100‑1 (MQ=255) gCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGata < 2:2972949/100‑1 (MQ=255) tAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATAc < 2:2180626/100‑1 (MQ=255) tAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATAc < 1:628322/100‑1 (MQ=255) aaaaCTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACt < 1:2724490/100‑1 (MQ=255) aaCTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTaa < 2:709626/100‑1 (MQ=255) aCTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGATTTTTTTT‑TTGTGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACAatatcttgaa > 2:1934487/1‑94 (MQ=255) gTCCTGGTGAAGAAATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGa > 2:1848430/1‑100 (MQ=255) tCCTTGTGAAGACATGTAATTGTGTGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGTTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGat < 2:1989126/100‑1 (MQ=255) tCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGat < 1:300496/100‑1 (MQ=255) ccTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGata < 1:176498/100‑1 (MQ=255) cTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataa > 1:1476612/1‑100 (MQ=255) cTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCATTCAAACGACGCATAAAACTGAGCATTTTTTTACGATataataca > 2:2367031/1‑92 (MQ=255) ggTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataata > 2:2569448/1‑100 (MQ=255) ggTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataata > 1:2984127/1‑100 (MQ=255) ggTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataata > 2:1425295/1‑100 (MQ=255) gagAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataat > 1:2014736/3‑98 (MQ=255) gTGAAGACATGTAATTGTTGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGTCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAg < 2:1440143/100‑1 (MQ=255) gTGAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAg < 1:2087929/100‑1 (MQ=255) gAAGACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCTTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGataata > 2:302513/1‑97 (MQ=255) gACATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAg > 2:673067/1‑100 (MQ=255) aCATGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGa < 2:235759/100‑1 (MQ=255) aTGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGAtc > 2:2104981/1‑100 (MQ=255) tGTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGAtct > 2:364375/1‑100 (MQ=255) gTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGAtctc > 1:2722136/1‑100 (MQ=255) gTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGAtctc < 2:2984583/100‑1 (MQ=255) gTAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGAtctc < 1:663888/100‑1 (MQ=255) tAATTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATctct < 1:2446960/100‑1 (MQ=255) aaTTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTa > 1:1600649/1‑100 (MQ=255) aaTTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTa < 1:505403/100‑1 (MQ=255) aTTGTGGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTaa < 1:2358821/100‑1 (MQ=255) tgtgGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAAtc > 2:1196910/1‑100 (MQ=255) tgGGA‑TTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAAtctc > 2:33253/1‑100 (MQ=255) | ACATCTTTTTTGTCAATGTATCTAATATTCTTCATGATAAACCTGTGAAATAAATAACTCCGCTTAAAACTGTCCTGGTGAAGACATGTAATTGTGGGATTTTTTTTAGCGCGCTGGTTTCCCTTTCAAACGCCGCATAAAATTGCGCATTTTTTTACGATATACTAAAAGATAATAGCCTAGATCTCTAATCTC > NC_000913/3800162‑3800356 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |