| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 308,054 | (C)7→6 | 100% | coding (1279/2526 nt) | ecpC ← | ECP production outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 308,048 | 0 | C | . | 94.4% | 522.6 / 20.8 | 124 | coding (1285/2526 nt) | ecpC | ECP production outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/3); new base . (59/58); total (62/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGG > NC_000913/307950‑308143 | aGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccc < 2:697999/100‑1 (MQ=255) gCGAACTAAAGCCTCCCGGTCGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACGGGCCAGCATATTCTGCAGGTTAACGTTGATCGccc > 1:616676/1‑99 (MQ=255) gCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGcccc > 2:2425628/1‑100 (MQ=255) cGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGATGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccc > 1:445195/1‑100 (MQ=255) tAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccaagc < 2:2698001/100‑5 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTCGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg > 1:1801704/1‑100 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg > 2:2569908/1‑100 (MQ=255) aaaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCg > 2:2231049/1‑100 (MQ=255) aaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGccccccaagcn < 2:1316286/99‑6 (MQ=255) aaGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCgg < 2:1095017/100‑1 (MQ=255) aaGACTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGGTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATGTTGCCGGTTAACGTTGAGCG‑GCCCCCAAGCgt < 1:2425275/100‑2 (MQ=255) ccTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAg > 1:2768722/1‑100 (MQ=255) cTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTTCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCATCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCa > 1:239936/1‑98 (MQ=255) cTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGc < 2:324841/100‑1 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCg > 2:1591572/1‑100 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCg > 2:156059/1‑100 (MQ=255) tCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCg < 1:1718230/100‑1 (MQ=255) ccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTc > 2:1722997/1‑100 (MQ=255) ccGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTc > 1:2432362/1‑100 (MQ=255) cGGTAGAGTTGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTc < 1:1826449/99‑1 (MQ=255) cGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCa > 2:232175/1‑100 (MQ=255) cGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATC‑ACCCCCCAAGCGGCAGCg < 1:2686359/97‑1 (MQ=255) gTAGAGTGGCTCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAg < 2:1695571/99‑1 (MQ=255) gTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGa < 1:776267/100‑1 (MQ=255) agagTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACg < 2:283837/100‑1 (MQ=255) tccgatcttGATGCTGCCGATGCTGCTCCTTGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACATTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACggg < 1:1743454/92‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCACAAGCGGCAGCGTCAGACggat < 1:1417691/100‑3 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGtt < 1:1021733/100‑1 (MQ=255) tGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGtt < 1:1242841/100‑1 (MQ=255) gttGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcac > 2:1652941/3‑100 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacc < 1:2082328/100‑1 (MQ=255) cTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacc < 2:2778862/100‑1 (MQ=255) tGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACgggagatcgga > 2:1743460/1‑92 (MQ=255) tGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcaccc < 2:2462459/100‑1 (MQ=255) ccgatctcGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccac < 2:1169712/93‑1 (MQ=255) tgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc > 2:433056/1‑100 (MQ=255) tgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc > 1:1724280/1‑100 (MQ=255) tgcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGcc > 2:2869439/1‑100 (MQ=255) gcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCt > 1:1877833/1‑100 (MQ=255) gcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCt < 2:1501669/100‑1 (MQ=255) gcCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCt > 1:2524493/1‑100 (MQ=255) ccGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTg < 1:1616798/100‑1 (MQ=255) cGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTcacccacagatcgg > 1:1169710/1‑93 (MQ=255) cGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGa < 2:2014864/100‑1 (MQ=255) cGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGa < 1:788633/100‑1 (MQ=255) gATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGAt > 2:549187/1‑100 (MQ=255) tgctgcTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTa < 1:2869428/100‑1 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTa > 1:1402476/1‑98 (MQ=255) ctgctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATc > 1:2639929/1‑100 (MQ=255) ctCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTa < 1:1771503/100‑1 (MQ=255) ccATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATc > 1:1931255/1‑100 (MQ=255) ccATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATc < 2:1109514/100‑1 (MQ=255) cctGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATcc < 2:1080473/98‑1 (MQ=255) cATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATc > 1:18077/1‑99 (MQ=255) aTGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCa < 1:69200/100‑1 (MQ=255) aTGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCa > 1:2482304/1‑100 (MQ=255) gCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGCTCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATc < 2:225227/100‑1 (MQ=255) gTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCg > 2:206086/1‑100 (MQ=255) tCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTACCGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCCTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGt < 1:1619524/100‑1 (MQ=255) tCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGt < 2:18078/100‑1 (MQ=255) aCTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTg < 1:2305206/100‑1 (MQ=255) aCTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTg < 1:2397094/100‑1 (MQ=255) aCTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTg < 1:18011/100‑1 (MQ=255) aCTGGCCAGCATATTTCGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGtt < 1:1702528/100‑1 (MQ=255) aCTGGCCAGAATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTg < 2:467972/100‑1 (MQ=255) cTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgc > 2:355018/1‑100 (MQ=255) tGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgcc < 1:901291/100‑1 (MQ=255) ggCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg < 2:1875972/100‑1 (MQ=255) ggCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccg > 1:452810/1‑100 (MQ=255) ccAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgcc > 2:635195/1‑100 (MQ=255) ccAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgcc > 2:489053/1‑100 (MQ=255) cAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGccc < 1:2328797/100‑1 (MQ=255) cAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGccc > 1:1404147/1‑100 (MQ=255) aGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTgccgccaa > 2:1259202/1‑98 (MQ=255) aGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCa > 1:941330/1‑100 (MQ=255) gCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAg > 1:1753690/1‑100 (MQ=255) cATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGc < 1:152429/100‑1 (MQ=255) tatTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATCTCCCGTTGCCGCCCAGc > 2:1017505/1‑98 (MQ=255) tatTTTGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTa > 1:391298/1‑100 (MQ=255) ttttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAg < 2:195219/100‑1 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCg > 2:19395/1‑100 (MQ=255) ttGCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCg < 2:2906143/100‑1 (MQ=255) ggCAGGTTAACGTGGATCG‑CGCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATCATCGGAGCAATATCCCGTTGCCGCCCAGCTTAGCGt > 1:1004796/2‑100 (MQ=255) gCAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTa > 2:2278045/1‑100 (MQ=255) cAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTAc > 1:1446316/1‑100 (MQ=255) cAGGTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATAATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTAc > 1:1580772/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc > 1:2523969/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc > 1:1496852/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc > 2:451147/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc > 1:2374015/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc > 1:1057345/1‑100 (MQ=255) gTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGGAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCa < 1:398802/100‑1 (MQ=255) gTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCATCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc < 1:1416764/99‑1 (MQ=255) gTTAACGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCAAGCTAAGCGTACTCa < 1:1259200/100‑1 (MQ=255) aCGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGa > 1:2315157/1‑100 (MQ=255) cGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGTTTTCACCCACCGCCTGATTATCGGATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTc < 1:2617122/94‑1 (MQ=255) cGTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAg < 1:882209/100‑1 (MQ=255) gTTGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGc > 2:1221221/1‑100 (MQ=255) ttGATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGcc < 2:2842696/100‑1 (MQ=255) gATCG‑CCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCgg > 2:2659895/1‑100 (MQ=255) | CAGCGAACTAAAGCCTCCCGGTAGAGTGGCGCTGATGCTGCCGATGCTGCTCCATGAGCTGTCACTGGCCAGCATATTTTGCAGGTTAACGTTGATCGCCCCCCCAAGCGGCAGCGTCAGACGGGTTTCACCCACCGCCTGATTATCGTATCCATATCCCGTTGCCGCCCAGCTAAGCGTACTCAATGAGCCGG > NC_000913/307950‑308143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |