| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,652,855:1 | (G)6→7 | 100% | coding (362/846 nt) | sseA → | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,652,849 | 1 | . | G | 86.5% | 318.9 / 45.3 | 104 | coding (356/846 nt) | sseA | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (7/7); new base G (41/49); total (48/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAT > NC_000913/2652750‑2652943 | aGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCt > 1:1037864/1‑100 (MQ=255)aGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCt > 1:1307764/1‑100 (MQ=255) aaGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑ggg‑g‑g < 1:907223/100‑1 (MQ=255) aaGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑ggg‑g‑g > 2:1208850/1‑100 (MQ=255) gccccTGATTGTATATGACGAAGGTAATGTTTTCTCAGCCCAACGAGCATGGTTGATGCTGCGAATCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCtn < 1:808376/91‑2 (MQ=255) gaaCCTGATTGTCTATGACGCAGGTAATCTTTTCTCCGCCCCACGAAAATTGTGGATGCTGCGCATCTTTGGTGTAGAGAAAGTTTCGTTTCT‑‑TGG‑G‑GGt < 1:965505/98‑1 (MQ=255) gCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGGCCGACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑ggg‑g‑ggg < 1:2547479/100‑2 (MQ=255) gCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑ggg‑g‑ggg > 1:490655/1‑99 (MQ=255) cACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑ggg‑g‑gggt > 1:1130037/1‑98 (MQ=255) cACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑GGG‑G‑GGTg > 1:1803881/1‑100 (MQ=255) ccTGATTGGCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑ggg‑g‑gggtgg < 1:2153182/100‑5 (MQ=255) atcttGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGTTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGAc < 1:1616477/97‑1 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACt < 1:1407227/100‑1 (MQ=255) aTTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGTGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑GGG‑G‑GGTGGACTTg < 2:801109/100‑1 (MQ=255) aTTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑GGG‑G‑GGTGGACTTg < 2:482072/100‑1 (MQ=255) tGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGAcagat > 2:1616481/1‑96 (MQ=255) tGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGc < 1:2474862/100‑1 (MQ=255) gTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCa < 2:2673460/100‑1 (MQ=255) tCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAg > 1:100761/1‑100 (MQ=255) cTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAgg < 1:33052/100‑1 (MQ=255) cTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAg < 1:200800/99‑1 (MQ=255) cTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTAGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAgg > 2:453316/1‑100 (MQ=255) cTATAACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGATCACCTCTGGTGTAGAAAAAGTGTCGATTATG‑GGG‑G‑GGTTGCCTTGCAg > 1:659239/1‑99 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTg < 2:584141/100‑1 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACCTGCAGGCTg > 2:2446127/1‑100 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTgg < 2:1608469/100‑1 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTgg > 1:1347533/1‑100 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTgg > 2:1498355/1‑100 (MQ=255) cGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCa < 2:1945965/100‑1 (MQ=255) cGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCa < 2:490681/100‑1 (MQ=255) gAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGAGGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTGGATTCTGGGGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGc < 1:1136995/99‑1 (MQ=255) aaGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGCAAGTGTCGATCCG‑‑GGG‑GAGGGAGACTTGCAGGCTGGCAgc > 1:1859436/1‑100 (MQ=255) aGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGGGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGGCAAAGTGTCGAGTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTTCAGGCTGGCAgag < 2:1965130/100‑3 (MQ=255) aGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGATAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAggg < 2:1967854/100‑3 (MQ=255) aGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAgcg < 1:101011/100‑1 (MQ=255) ggTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAgcgc < 1:2766123/100‑1 (MQ=255) ggTAATCTGTTCTCAGCCCCACGGTCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTTTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGAAgcgc < 1:4171/100‑1 (MQ=255) gTAATCTTTGCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGcgcg < 1:2245733/100‑1 (MQ=255) tAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCga > 2:2463447/1‑100 (MQ=255) tCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatga > 1:799690/1‑100 (MQ=255) tCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACGTGCAGGCTGGCAGCGCgatga < 2:2017941/100‑1 (MQ=255) ttttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATc < 1:2813750/100‑1 (MQ=255) tttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTATAGAAAGGGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATct < 2:229152/100‑1 (MQ=255) tttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATct < 2:1130039/100‑1 (MQ=255) tctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgc > 2:2492301/1‑100 (MQ=255) cAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGGGGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgctg < 2:1684947/100‑1 (MQ=255) aGCCCCACTAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTGTGGTGTAGAGAAAGTGGCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgctg < 1:2106948/98‑1 (MQ=255) aGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGtt < 1:2594504/100‑1 (MQ=255) cccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTaga > 2:1664208/1‑100 (MQ=255) cccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTaga > 1:1443721/1‑100 (MQ=255) cccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTaga < 1:2631246/99‑1 (MQ=255) cACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaag > 1:628876/1‑100 (MQ=255) cACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaag > 2:728199/1‑100 (MQ=255) cACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTCTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGCGGACTTGCAGGCCGGCAGCGCGATGCCCCGCGGTTag > 1:2311803/1‑97 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 2:1920097/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 1:956855/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 2:1608179/100‑1 (MQ=255) gCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGt > 2:877256/1‑100 (MQ=255) gCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGt > 1:112112/1‑100 (MQ=255) gCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGt > 2:877090/1‑100 (MQ=255) aTGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTATAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagatcggaagag > 1:2843753/1‑91 (MQ=255) tggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCa > 1:2130087/1‑100 (MQ=255) tggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAg > 2:1159887/1‑100 (MQ=255) tggtggAGGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCa < 1:2099470/100‑1 (MQ=255) ggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTag > 2:352646/1‑100 (MQ=255) aTGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTagag < 2:1169950/100‑1 (MQ=255) ctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTg > 2:1406124/1‑100 (MQ=255) tgcGCACCTGTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATGCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTg > 1:1124123/1‑99 (MQ=255) gcgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGcc < 2:865055/100‑1 (MQ=255) cgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCg < 2:2785096/100‑1 (MQ=255) cACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGa < 2:1649435/100‑1 (MQ=255) cTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTGGGGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGACGGAAg > 1:1665605/1‑100 (MQ=255) cTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCTGGAAgg > 1:2391470/1‑100 (MQ=255) cTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAgg < 2:2786/100‑1 (MQ=255) cTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAgg < 2:1494273/100‑1 (MQ=255) ttGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGgag < 1:2301669/100‑1 (MQ=255) ggTGTAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCACTAGAGCTGCCGGAAGGagag < 1:1783737/100‑1 (MQ=255) gtgtAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGt < 2:2211069/100‑1 (MQ=255) gtgtAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGt > 2:2284045/1‑100 (MQ=255) tgtAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGtt > 2:2109224/1‑100 (MQ=255) tgtAGAGAAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGtt < 2:1105314/100‑1 (MQ=255) tggagagAAAGTGTCGATTCT‑‑GGGTG‑GGTGCACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCGGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGt < 1:2900002/96‑1 (MQ=255) tAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGttt > 1:1565559/1‑98 (MQ=255) gagaAAGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAc > 2:2819205/1‑100 (MQ=255) gagaAAGTGTCGATTCT‑‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcg > 1:89307/1‑100 (MQ=255) gagaAAGTGTCGATTCT‑‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcg < 2:1803887/100‑1 (MQ=255) aaGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgccg > 2:829553/1‑100 (MQ=255) aaGTGTCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgccg > 2:1469790/1‑100 (MQ=255) gtgtCGATTCT‑‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGt > 2:1559460/1‑100 (MQ=255) tgtCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGt > 2:822335/1‑100 (MQ=255) tgtCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTCAGAAGAAGGGGCAGTGGAGCTGCCAGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGt > 1:1963003/1‑100 (MQ=255) gtCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGtt < 2:2691238/100‑1 (MQ=255) gtCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGAAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGtt > 2:2754318/1‑100 (MQ=255) tCGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGttt < 2:664440/100‑1 (MQ=255) cGATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTa > 2:1483260/1‑100 (MQ=255) gATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTaa > 2:2670441/1‑100 (MQ=255) gATTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTACCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTa < 2:2542404/99‑1 (MQ=255) aTTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGGTGTTAGAGGAGGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGTGTTTAACGCCGCGTTTaa > 1:1734358/1‑99 (MQ=255) aTTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAt < 1:2492290/100‑1 (MQ=255) aTTCTG‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAt < 1:2591129/100‑1 (MQ=255) | AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCT‑‑GGG‑G‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAT > NC_000913/2652750‑2652943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |