| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,767,507:1 | (C)7→8 | 100% | intergenic (+152/‑203) | rnlB → / → yfjP | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein/CP4‑57 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,767,500 | 1 | . | C | 89.6% | 295.0 / 28.0 | 96 | intergenic (+145/‑210) | rnlB/yfjP | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein/CP4‑57 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/4); new base C (35/49); total (43/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑C‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCTGCAA > NC_000913/2767403‑2767598 | gATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTACCCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑c‑c < 1:2633826/100‑1 (MQ=255)gATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑c‑c < 1:1927565/100‑1 (MQ=255) atatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑c‑c‑c < 2:429770/100‑1 (MQ=255) atatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑c‑c‑c < 2:1450165/100‑1 (MQ=255) atatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑c‑c‑c < 1:1756397/100‑1 (MQ=255) tatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCTTCACAACGTCCTGCAGAGGCAACAAGTTTTCCCCACTGCACCCGCGACTCAAt‑ttatc > 1:1165460/1‑96 (MQ=255) atTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAAACACCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAAAAAGATATACTCTGTGAACCCACGACTAAAT‑AT‑c‑a‑c‑c‑c > 1:2561111/1‑100 (MQ=255) ttAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑c‑c‑c‑c‑cc < 2:1612785/100‑1 (MQ=255) aaCTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTACCCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑c‑c‑c‑c‑cccc < 1:2384497/100‑2 (MQ=255) ttGTCCAATATGGTCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑C‑C‑C‑C‑CCCcttt < 2:1311008/100‑2 (MQ=255) tgcccAATATGATCAAATAGCATTCACCCCCCCTCACAACGTCCGGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑c‑c‑c‑c‑cccc < 1:550059/93‑2 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAAc < 2:314881/100‑1 (MQ=255) atatGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACATCCCGCATAGGGAACACGTCTTCCCCTGTGCACCCACGCCTAAAT‑TTAC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACt > 1:2373881/1‑98 (MQ=255) tatGATCAAATAGCATTAACGCCCTCTCACAACGTAATGCATGAGGAACACGGTATCCCCAGTGCACGCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCGGTAAACTtct > 1:1440841/1‑100 (MQ=255) tatGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTtct < 1:107018/100‑1 (MQ=255) atGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTtctc < 2:638849/100‑1 (MQ=255) tGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCa < 2:356936/100‑1 (MQ=255) tGAGCAAATAGCAGTAGCCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACCCGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTtctc < 1:1409288/99‑1 (MQ=255) aTCAAATAGCATTAACCCTCCTTCCCGGCTTTCTGCATCCGAAACACGATTACCCCGGAACCCCCAAGCCTAAAT‑TC‑C‑C‑CAC‑CCCTTCAATCTTCTTaat > 1:1232461/1‑100 (MQ=255) aTCAAATAGCATTAACCCACCCTCACAGCGTCCTGCATAGGGAACAAATTATCCCCTGTGAACCCACGACTAAAT‑TTAG‑C‑C‑T‑CCATTTAAACTgctg > 1:2741594/1‑96 (MQ=255) aaaTAGCATTAACCCCCCATCACAACGTCCTGCGTAGGGAACACCTTTTCCCCAGTACAACCACGACTAAAT‑TT‑CAC‑C‑C‑CCCTTTAAACTCCTCaaaaat > 1:1922879/1‑100 (MQ=255) aaTAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCaataat < 1:172858/99‑1 (MQ=255) aaTAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATg < 2:1798952/100‑1 (MQ=255) aTAGCATTAACCCCCCCTCAAAACGCCCTGCATCAGGAACAAGTCCTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTTTCaataat > 1:1986688/1‑98 (MQ=255) tAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTc < 2:747616/100‑1 (MQ=255) gCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCCCCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATACTGTCAc > 1:2843630/1‑100 (MQ=255) aTTAACCCCCCCTCACAACGTACTGCATAGGGAAAACGTTTTCCCCTGTGCACCAACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATCATGTccc > 1:1393637/1‑96 (MQ=255) ttAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAC‑TT‑C‑CAC‑C‑CCCTTTACACTTCTAAAAAATCTCAccca > 1:2152124/1‑98 (MQ=255) aCCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAAttt < 2:2007628/100‑1 (MQ=255) ccccccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTc < 1:2207350/100‑1 (MQ=255) cctccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACCCGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCt < 1:1385155/97‑1 (MQ=255) ccccccCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCt < 1:1642875/100‑1 (MQ=255) cccccTCCCACCGTCCTGCATACGTAACCCCTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAACT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAACCTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCt < 1:1541809/100‑1 (MQ=255) cccccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCt > 1:1052534/1‑100 (MQ=255) cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg < 2:590703/100‑1 (MQ=255) cccTCACAACGCCCTGCATAGGCAACACGTCTTCCCCTGTGCACCCACGAATAACTCAC‑C‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg < 1:2453800/99‑1 (MQ=255) ccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGa < 2:815033/100‑1 (MQ=255) cTCACGACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCGGTGCGCCCACGACTAAAT‑GTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAATTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGaa > 1:1152165/1‑100 (MQ=255) tCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGaaa > 2:1111822/1‑100 (MQ=255) cacaACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTATAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCCTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAAt > 1:1290281/1‑100 (MQ=255) cacaACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAAt < 2:751225/100‑1 (MQ=255) caACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATcc > 2:1560352/1‑100 (MQ=255) atcGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCCATGCACCCACGACTAAAT‑TT‑C‑C‑C‑CTCCCTTTATCCTTCTCCATAATGTTACCAATTTTCTGGaaagc < 1:2652907/96‑3 (MQ=255) aCGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa < 2:2274057/100‑1 (MQ=255) cGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTat < 2:843050/100‑1 (MQ=255) gTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatg < 2:1503487/100‑1 (MQ=255) tCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatga < 1:1366931/100‑1 (MQ=255) tCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatga < 2:2806108/100‑1 (MQ=255) tCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatga > 1:2639653/1‑100 (MQ=255) ccTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAAGTTCTCAATAATGCCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgat > 1:1326627/1‑100 (MQ=255) ccTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgat > 2:2666426/1‑100 (MQ=255) cTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgatg > 1:2348852/1‑100 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGc < 2:69592/100‑1 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGc > 2:2292590/1‑100 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCAGGAAATCCTatgatg > 2:272252/1‑99 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTGTAAACTTCTCAAGAATGTCACCAATGTTCTGGAAATCCTATGATGc > 2:272260/1‑100 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑CAC‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGc < 1:78977/100‑1 (MQ=255) gCATGGGGAACACGTTTTCGCCTGTGCACTCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAGTTTTCTGGAAATCCTATGATGcc > 1:2767262/1‑100 (MQ=255) gCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGcc < 2:2736589/100‑1 (MQ=255) caggggAAAACGTGTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCtt > 1:25442/4‑100 (MQ=255) tAGGGAACACGTTTT‑CCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTc > 1:2649641/1‑100 (MQ=255) ggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTccc > 2:377042/1‑100 (MQ=255) gAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTccc < 1:372406/99‑1 (MQ=255) gAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCg > 2:1727356/1‑100 (MQ=255) gAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCg < 1:2283435/100‑1 (MQ=255) acacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGt < 2:1052536/100‑1 (MQ=255) acacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGt < 2:1048829/100‑1 (MQ=255) cacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTa < 2:43487/100‑1 (MQ=255) cacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTa < 1:2862131/100‑1 (MQ=255) cacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑C‑C‑CGT‑CGCTTTAGACTTCTCAAGAATGAAAACAAGATAAAGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTa > 1:2043845/1‑100 (MQ=255) cGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTaaa > 2:914573/1‑100 (MQ=255) cGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTCAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTaaa > 2:1392039/1‑100 (MQ=255) gTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAAt < 1:108617/100‑1 (MQ=255) tttCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATgg < 1:272250/100‑1 (MQ=255) tttCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATgg < 2:1032873/100‑1 (MQ=255) tttCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATgg < 2:1632424/100‑1 (MQ=255) tCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTg > 2:119766/1‑100 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATTATGCCTTTCCCGGTAAAt > 2:399154/1‑95 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTg > 1:1733797/1‑99 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc > 2:35715/1‑100 (MQ=255) cccTGTGCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc < 1:298162/99‑1 (MQ=255) tgtgCACCCACGACTAACT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCtgtg < 1:2712480/100‑1 (MQ=255) tgtgCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCtgtg < 2:2843640/100‑1 (MQ=255) tgCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAg < 2:1688988/100‑1 (MQ=255) gCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGt > 2:1923657/1‑100 (MQ=255) gCACCCACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGt > 1:234456/1‑100 (MQ=255) cACCCACGACTAAAT‑TT‑C‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTc > 2:2320058/1‑100 (MQ=255) aaccACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTc < 1:34497/98‑1 (MQ=255) cccACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCa < 2:1244496/100‑1 (MQ=255) cccACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCa > 2:1308249/1‑100 (MQ=255) cccACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCa < 1:296597/100‑1 (MQ=255) cccACGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCa < 2:1641025/100‑1 (MQ=255) cGAGTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAATCTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa < 1:949007/100‑1 (MQ=255) cGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa < 1:377040/100‑1 (MQ=255) cGACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa > 2:1496105/1‑100 (MQ=255) gACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAg < 2:1387155/100‑1 (MQ=255) gACTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAg > 2:687287/1‑100 (MQ=255) cTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGAt < 2:2117195/100‑1 (MQ=255) cTAAAT‑TTCC‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGAt > 2:1581892/1‑100 (MQ=255) tt‑C‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCTGCaa > 2:1624652/1‑100 (MQ=255) | GATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAAT‑TT‑C‑C‑C‑C‑CCCTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCTGCAA > NC_000913/2767403‑2767598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |