| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 274347 = | NA (NA) | 20 (0.210) | 11/164 | NT | NA | noncoding (803/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 274410 = | NA (NA) | noncoding (740/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/274452‑274347‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgccccTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCT > NC_000913/274410‑274508 GCATGGAGAGGAGGAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGGGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG < 1:2891518/100‑1GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATGGCCGAG > 2:2283955/1‑100GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG > 1:1036769/1‑100GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG > 2:2556795/1‑100GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG > 2:2595041/1‑100GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG < 2:2699656/100‑1GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG < 2:1487929/100‑1GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG < 2:1460296/100‑1GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG < 2:1337586/100‑1GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG > 2:2778430/1‑100GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG < 1:619599/100‑1GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG > 1:2346869/1‑100GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG < 1:2294823/100‑1GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAG > 2:619600/1‑100 tccgatctGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGC < 1:2778006/92‑1 cgTGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGC > 2:1960701/3‑100 CATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGGGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGC < 1:888709/100‑1 CATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGC < 2:2518449/100‑1 CATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGC < 2:1399082/100‑1 CATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGC < 2:1418784/100‑1 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG > 2:2193564/1‑100 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG < 1:146721/100‑1 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG < 1:309544/100‑1 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG < 2:1500818/100‑1 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG > 1:174129/1‑100 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG > 1:2664878/1‑100 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG > 1:2583607/1‑100 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG < 1:2564596/100‑1 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG < 2:2485556/100‑1 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCAGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG < 2:2259770/100‑1 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCACGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG < 2:911227/100‑1 ATGGAGAGGAGCAAATTGCCTCAGCCGCTGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCG < 2:2469473/100‑1 TGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGC < 2:2834729/100‑1 TGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGC > 2:1317100/1‑100 TGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGC > 2:445955/1‑100 TGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGC > 2:2155205/1‑100 GGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCC < 1:243914/100‑1 GGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCC < 1:1376249/100‑1 GGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCC < 2:482151/100‑1 GGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCC > 2:787950/1‑100 GGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCC > 2:100640/1‑100 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCACGGGGAGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTCGACTGGCTGATCGCCGAG < 1:2426973/95‑1 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCCCAGCGCGAGGCGCTGGCCGAGGAGGATGGGGACTGGCTGATCGACGAGCGCCC > 1:1387950/1‑100 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCCC > 1:1508324/1‑100 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCCC < 2:1873808/100‑1 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCCC < 2:2809437/100‑1 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCCC > 1:1084509/1‑100 AGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCCCC < 2:479077/100‑1 AGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCAGAGCGACCC > 2:240691/1‑100 GAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCCCag > 1:569905/1‑98 GGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGatcggaaga > 1:1884008/1‑91 CCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTC > 1:750781/1‑100 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GCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCA < 1:2202460/100‑1 GCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCA < 1:2137680/100‑1 GCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCA > 1:2355801/1‑100 GCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCA < 2:1579459/100‑1 GCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCA < 1:1355486/100‑1 CCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAG > 1:205496/1‑100 CCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAG < 2:886446/100‑1 CCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAG < 1:111653/100‑1 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GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCCGAGCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/274452‑274347‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgccccTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCT > NC_000913/274410‑274508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |