New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3493758 = | NA (NA) | 13 (0.140) | 9/162 | NT | NA | noncoding (1/26 nt) | REP248 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP248 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
? | NC_000913 | 3493784 = | NA (NA) | intergenic (+35/‑227) | tsgA/nirB | putative transporter/nitrite reductase, large subunit, NAD(P)H‑binding |
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
AAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGCACAAAC > NC_000913/3493659‑3493856 | aaaCGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCGTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATg > 1:514937/1‑100 (MQ=255) aaCGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGc < 2:2888761/100‑1 (MQ=255) aaCGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGc > 1:1743405/1‑100 (MQ=255) acggaattgtctgatatttcatgtttgtgcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCgg > 2:929910‑M1/96‑100 (MQ=255) acggaattgtctgatatttcatgtttgtgcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCgg > 1:838495‑M1/96‑100 (MQ=255) acggaattgtctaatatttcatgtttttgcaaaaaatagacaaaatgagcggatttataaaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCg > 1:1436572‑M1/96‑99 (MQ=255) cggaattgtctgatatttcatgtttgtgcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCGGa > 1:1020892‑M1/95‑100 (MQ=255) ggaattgtctgatatttcatgtttgtgcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCGGAc > 2:2632736‑M1/94‑100 (MQ=255) gaattgtctgatatttcatgtttgtgcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCGGACg < 2:2617604‑M1/8‑1 (MQ=255) cTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCTTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACg < 1:1112260/100‑1 (MQ=255) cTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGTCCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACg < 1:209495/100‑1 (MQ=255) cTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGa < 2:2246393/98‑1 (MQ=255) gTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGc < 2:1984814/100‑1 (MQ=255) gTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGc > 1:1639348/1‑100 (MQ=255) tACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCa < 2:1759143/100‑1 (MQ=255) tACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCa < 1:576698/100‑1 (MQ=255) tACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCa > 2:1631414/1‑100 (MQ=255) tACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCa < 2:1639352/100‑1 (MQ=255) cGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACACTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACt > 1:465171/1‑100 (MQ=255) cTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTAt > 2:458840/1‑100 (MQ=255) cTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTAt > 2:2833093/1‑100 (MQ=255) cgtcTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGACACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTAtcgt < 1:1070152/99‑1 (MQ=255) tcTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCTTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACCCCCTGACCTCTCCTTATTTGCTCATGCCGGACTGCACTAtcgtcg > 1:39558/1‑99 (MQ=255) ttcatgtttgtgcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCGGACGGCACTATCgtcgtc < 1:2008347‑M1/22‑1 (MQ=255) tgtgATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCgg > 1:512329/1‑100 (MQ=255) tgtgATGTGCGTCCAGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCgg > 1:374350/1‑100 (MQ=255) atgtttgtgcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCgg > 2:892015‑M1/76‑100 (MQ=255) tgtttgtgcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGc > 2:2706285‑M1/75‑100 (MQ=255) tgtttgtacaaaaaatagaaaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagggaggaaaagGCTAGACGGCACTATCGTCGTCCGGc > 1:251328‑M1/75‑100 (MQ=255) gtttgtgcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGcc > 1:1806658‑M1/74‑100 (MQ=255) gtttgtgcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGcc > 2:2008354‑M1/74‑100 (MQ=255) tttgtgcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCt > 2:2316708‑M1/73‑100 (MQ=255) tgtgCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCttt < 2:1226844/100‑1 (MQ=255) tgcaaaaaatagaccaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagtggcggaacagaggaagagGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTGTTc > 1:925866‑M1/69‑100 (MQ=255) tgCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCtttt > 1:2357159/1‑99 (MQ=255) gcaaaaaatagacaaaatgagcgggtttatagaaatagatgcacgtagcgggggaagagaggaaaagGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTcc > 2:328771‑M1/68‑100 (MQ=255) gCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACTCCCCGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTcc < 2:427497/100‑1 (MQ=255) gCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTcc < 2:2711294/100‑1 (MQ=255) gCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTcc < 1:1874796/100‑1 (MQ=255) cTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCct < 1:2771842/100‑1 (MQ=255) cTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCct > 1:2195463/1‑100 (MQ=255) ttCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCctc < 2:2689453/100‑1 (MQ=255) ttCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCctc < 1:662733/100‑1 (MQ=255) ttCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCctc < 2:406210/100‑1 (MQ=255) gtCCTGTTAGGTTCCGACAGCCGACACCGTCAGCATAACACCCTGACGTATAATTACTATCTCATGCCGGACGTCACTATCGTCGACCg > 1:2589484/2‑89 (MQ=255) aaaatagacaaaatgagcgagtttaaagaaatagatgcgcttagcgggggaagagaggaaaagGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCctctc > 1:2144841‑M1/64‑100 (MQ=255) cTGTTAGGTCTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCctctct > 1:462539/1‑100 (MQ=255) gTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTc > 1:230072/1‑100 (MQ=255) tAGGTTTCGTCAGCCGTCACCTTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTACCGTCGTCCGTCCTTTTCCCCTCTTccc > 1:2315026/1‑100 (MQ=255) aGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTcccc > 1:221089/1‑100 (MQ=255) tttCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCGCTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGc > 2:110737/1‑100 (MQ=255) gTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACg < 2:2677810/100‑1 (MQ=255) gTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACg > 1:1528670/1‑100 (MQ=255) cAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTg < 2:2461968/100‑1 (MQ=255) ctgtcaccgtcaGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGTTCATGCCGGGCGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTACCCTGCTACGTGCAt > 2:1462668/3‑100 (MQ=255) cgtcaccgtcaGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATc > 1:371239/1‑100 (MQ=255) ccgtcaGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTAttt > 1:47112/1‑100 (MQ=255) cgtcaGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTc < 2:2293951/100‑1 (MQ=255) cgtcaGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTc < 1:2833083/100‑1 (MQ=255) cgtcaGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTc < 2:400398/100‑1 (MQ=255) tcaGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCta < 1:99053/100‑1 (MQ=255) tcaGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCta < 1:46190/100‑1 (MQ=255) caGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCtat > 2:531717/1‑100 (MQ=255) caGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCtat < 2:905712/100‑1 (MQ=255) aGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCtata > 1:1172873/1‑100 (MQ=255) aGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCtata < 1:1137545/100‑1 (MQ=255) gCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATaa > 1:830754/1‑100 (MQ=255) gCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATaa > 1:237456/1‑100 (MQ=255) gCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATaa > 2:1178342/1‑100 (MQ=255) gCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATaa > 1:2804785/1‑100 (MQ=255) gCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATaa > 1:650757/1‑100 (MQ=255) tAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAAc > 1:726317/1‑99 (MQ=255) tAACACCCTGACCTCCCATTAATTACTAATGCCGGCCGGCCGTACCGTCATCCGACCTTTTCCCCCCTCCCCCCGCTACGTGCCTCTACTTCTATaaa > 1:1757477/1‑98 (MQ=255) aatgcccTGTCCTCTCATTAATTGTTCATTCCTGATGGCACAATCGTCGTCCTGTCTTTTCCTCTCTACCCCCGATACGTGCATCTATTTCTATAAAcc < 1:2749503/95‑1 (MQ=255) acacCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCg > 2:1113296/1‑100 (MQ=255) gACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCAttt < 2:1080267/100‑1 (MQ=255) aCCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCAtttt < 2:1232389/100‑1 (MQ=255) ccTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTg > 1:1125284/1‑100 (MQ=255) ccTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTg < 1:2242629/100‑1 (MQ=255) ccTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTg < 2:726319/100‑1 (MQ=255) tctcATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTc < 2:813181/100‑1 (MQ=255) ctcATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTTTTCTTTTTTCCCGCGACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCt > 1:1956344/1‑100 (MQ=255) ctcATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCt > 1:379094/1‑100 (MQ=255) tcATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTa < 1:425222/100‑1 (MQ=255) aTTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTAtt > 1:871480/1‑100 (MQ=255) aTTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTAtt > 1:871551/1‑100 (MQ=255) aTTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTAtttttt < 2:2538220/100‑1 (MQ=255) ttGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTAtttttt > 1:2431207/1‑99 (MQ=255) ttGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTg < 2:1218730/100‑1 (MQ=255) ttGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTg < 2:1440460/100‑1 (MQ=255) tGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGc > 2:832472/1‑100 (MQ=255) tGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGc < 2:2093245/100‑1 (MQ=255) gCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGca < 1:403658/100‑1 (MQ=255) gCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGca > 1:974017/1‑100 (MQ=255) gCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCCCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGca > 1:2576080/1‑100 (MQ=255) tCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGcaca > 2:2856423/1‑100 (MQ=255) cATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGCACaa > 2:1406631/1‑100 (MQ=255) tGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGCACAAAc > 2:452559/1‑100 (MQ=255) tGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGCACAAAc < 1:2272320/100‑1 (MQ=255) tGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGCACAAAc > 1:1035434/1‑100 (MQ=255) | AAACGGTCTGTACGCTGTCGTCTTTGTGATGTGCTTCCTGTTAGGTTTCGTCAGCCGTCACCGTCAGCATAACACCCTGACCTCTCATTAATTGCTCATGCCGGACGGCACTATCGTCGTCCGGCCTTTTCCTCTCTTCCCCCGCTACGTGCATCTATTTCTATAAACCCGCTCATTTTGTCTATTTTTTGCACAAAC > NC_000913/3493659‑3493856 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |