| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4132351 = | NA (NA) | 7 (0.070) | 3/162 | NT | NA | noncoding (5/34 nt) | REP306 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP306 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 4132381 = | NA (NA) | intergenic (+114/‑235) | metL/metF | Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2/5,10‑methylenetetrahydrofolate reductase | |||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
GCACAGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGATTTTCTTTTT > NC_000913/4132253‑4132450 | gCACAGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGc > 1:2791857/1‑100 (MQ=255)gCACAGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGc < 2:2594686/100‑1 (MQ=255) cacaGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGcc < 2:1941878/100‑1 (MQ=255) aagatgaaaaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGcc > 1:223237‑M1/98‑100 (MQ=255) aagaagaaaaaacttcaagatagtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaacgaaccatgtacttattgcttcttGcc > 1:2324546‑M1/98‑100 (MQ=255) agatgaaaaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCg < 2:821896‑M1/4‑1 (MQ=255) caGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCgg < 2:1033619/100‑1 (MQ=255) tgaaaagacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGAt < 2:2141910‑M1/7‑1 (MQ=255) tgaaaaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGAt < 1:2696442‑M1/7‑1 (MQ=255) tgaaaaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGAt < 1:427171‑M1/7‑1 (MQ=255) tgaaaaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGAt > 1:2683077‑M1/94‑100 (MQ=255) gttgttGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGAt > 1:529653/1‑100 (MQ=255) ttgttgTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGAtt < 1:2743117/100‑1 (MQ=255) gaaaaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGAtt < 1:2756173‑M1/8‑1 (MQ=255) aaaaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGAtt < 1:2118669‑M1/8‑1 (MQ=255) gttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTaa > 2:854715/1‑100 (MQ=255) gttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTaa > 2:2551229/1‑100 (MQ=255) gttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTaa > 2:1110171/1‑100 (MQ=255) gttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTaa > 2:1557301/1‑100 (MQ=255) ttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAg > 1:75890/1‑100 (MQ=255) ttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAg < 2:755906/100‑1 (MQ=255) ttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAg < 2:2885739/100‑1 (MQ=255) aaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGATTAAg > 1:2398411‑M1/90‑100 (MQ=255) tgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGc < 1:1446508/100‑1 (MQ=255) gtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCg > 2:1408353/1‑100 (MQ=255) tAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTagatcg > 1:1168514/1‑95 (MQ=255) aTTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGttt < 2:2284326/100‑1 (MQ=255) aTTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGttt < 2:529654/100‑1 (MQ=255) ttCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTac > 1:1333920/1‑100 (MQ=255) ttCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTac > 2:2610869/1‑100 (MQ=255) cAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacga > 2:2655748/1‑100 (MQ=255) cAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacga < 2:1185652/100‑1 (MQ=255) aGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacgac < 2:230668/100‑1 (MQ=255) aGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacgac < 2:272489/100‑1 (MQ=255) gAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacgacg < 1:2350952/100‑1 (MQ=255) gAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacgacg > 2:1717001/1‑100 (MQ=255) gAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacgacg < 2:2687356/100‑1 (MQ=255) ttAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATcc > 1:382874/1‑100 (MQ=255) ttAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATcc < 2:1201148/100‑1 (MQ=255) taataaTGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTCATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCg > 1:1588397/1‑100 (MQ=255) ataatGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGc < 1:775771/100‑1 (MQ=255) aaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGc > 1:176467‑M1/71‑100 (MQ=255) taatGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCa < 2:1164325/100‑1 (MQ=255) atGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCa < 1:1733476/98‑1 (MQ=255) aagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCaag > 1:111192‑M1/68‑100 (MQ=255) aagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCaag > 1:370848‑M1/68‑100 (MQ=255) tGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCaaga < 1:115548/100‑1 (MQ=255) ccGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGc < 2:1340896/100‑1 (MQ=255) ccGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGc < 1:1031269/100‑1 (MQ=255) ccGGTACTCATGTTTTCGGGTTCATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATACGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGc > 1:1858473/1‑100 (MQ=255) gTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCAGCAAGAAACAAt > 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1:840825/1‑100 (MQ=255) ggCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttctttt > 2:1912764/1‑100 (MQ=255) GCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttcttttt < 2:1293395‑M1/100‑1 (MQ=255) GCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttcttttt < 2:2196525‑M1/100‑1 (MQ=255) GCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttcttttt < 2:1169716‑M1/100‑1 (MQ=255) | GCACAGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGATTTTCTTTTT > NC_000913/4132253‑4132450 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |