| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3620116 | NA (NA) | 16 (0.170) | 8/166 | NT | 100% | coding (925/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3620152 | 0 (0.000) | coding (961/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
GGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > NC_000913/3620053‑3620251 | ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:566308‑M2/1‑100 (MQ=255)ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG < 1:2445937‑M2/100‑1 (MQ=255)ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCGGCCGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:910710‑M2/1‑100 (MQ=255) ggAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacg < 1:368765‑M2/100‑48 (MQ=255) aTTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcaga < 2:2849106‑M2/100‑53 (MQ=255) ccTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCC‑C‑‑‑‑CGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatg < 1:2147586‑M2/100‑63 (MQ=255) ntgCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacg < 2:26962‑M2/99‑59 (MQ=255) cTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgc < 2:2371963‑M2/100‑59 (MQ=255) tGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgg < 2:1142480‑M2/100‑60 (MQ=255) tGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgg < 2:2259833‑M2/100‑60 (MQ=255) gccgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgga < 1:1026259‑M2/100‑61 (MQ=255) gccgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgga < 2:1478310‑M2/100‑61 (MQ=255) gccgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgga < 2:624085‑M2/100‑61 (MQ=255) cgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatg < 2:2739161‑M2/100‑63 (MQ=255) cgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatg < 1:13648‑M2/100‑63 (MQ=255) gcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgacaggcacacggcagacagacgggtgc < 1:925269‑M2/100‑64 (MQ=255) gccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccg < 2:2762097‑M2/100‑66 (MQ=255) ccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgt > 1:2849096‑M2/1‑34 (MQ=255) gACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggaggccgttgtcccggccatattcggtg > 2:13649‑M2/1‑14 (MQ=255) ngcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggagatcggaa < 1:2431803‑M2/99‑94 (MQ=255) ncggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccgg < 1:400478‑M2/99‑95 (MQ=255) gcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacatggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccgg < 2:480915‑M2/100‑95 (MQ=255) gcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccgg < 2:1926148‑M2/100‑95 (MQ=255) gcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccgg > 2:573623‑M2/1‑6 (MQ=255) cggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggc > 1:1724027‑M2/1‑5 (MQ=255) cggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggc > 2:112556‑M2/1‑5 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggca < 2:1833779‑M2/100‑97 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggca < 2:819050‑M2/100‑97 (MQ=255) gcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaccccggcag > 1:1324214‑M2/1‑3 (MQ=255) gcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcag > 1:2049549‑M2/1‑3 (MQ=255) gcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcag > 2:2459779‑M2/1‑3 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC > 2:1433620‑M2/1‑100 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC < 2:462854‑M2/100‑1 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC > 1:1989112‑M2/1‑100 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC > 2:2794445‑M2/1‑100 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC < 1:213293‑M2/100‑1 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC < 1:2337546‑M2/100‑1 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC < 2:2308665‑M2/100‑1 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC < 1:2795898‑M2/100‑1 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC < 2:1198376‑M2/100‑1 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACAGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC < 2:1535069‑M2/100‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg < 1:2340559‑M2/100‑100 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 2:2505741‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 2:2611656‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 2:2230296‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 2:391942‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 1:759543‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 1:1729436‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 1:1440662‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaatcctccgggtattccgggtcgtccgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 1:1531836‑M2/1‑1 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATGAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > 1:2141731‑M2/1‑100 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC < 1:523502‑M2/100‑1 (MQ=255) | GGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > NC_000913/3620053‑3620251 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |