| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 730041 = | 0 (0.000) | 10 (0.100) | 7/168 | NT | 50.0% | coding (459/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | 730073 = | 20 (0.200) | coding (491/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
GGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGA > NC_000913/729972‑730172 | cgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttCCGGC‑‑‑‑CGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGgaag > 1:998255‑M1/70‑100 (MQ=255) agcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttCCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGga > 1:1345511‑M1/68‑100 (MQ=255) gcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttCCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGgaa > 2:1775780‑M1/67‑100 (MQ=255) cagccaccacggcccctgcggactggttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttCCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGgaag > 1:1755086‑M1/66‑100 (MQ=255) cacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttCCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCg > 2:774586‑M1/59‑100 (MQ=255) ggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCg > 1:2199641‑M2/79‑98 (MQ=255) cggacttaagcggagttcttCCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTcc > 1:2199641‑M1/21‑98 (MQ=255) cggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCgtg > 2:774586‑M2/43‑100 (MQ=255) ttccgatctCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgc > 1:1830805‑M1/10‑100 (MQ=255) cttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAACCAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgctg > 1:1755086‑M2/36‑100 (MQ=255) ttccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgctgc > 2:1775780‑M2/35‑100 (MQ=255) tccggcagcgcctgccagagtgcggccagccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgctgct > 1:1345511‑M2/34‑100 (MQ=255) CCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTc < 1:357476‑M1/100‑1 (MQ=255) CCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTc > 2:2701510‑M1/1‑100 (MQ=255) CCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTc > 2:472978‑M1/1‑100 (MQ=255) CCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTc < 2:738672‑M1/100‑1 (MQ=255) CCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTc > 1:118391‑M1/1‑100 (MQ=255) cttccggcagcgcctgccagagtgcggccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCg > 1:998255‑M2/32‑100 (MQ=255) ctGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCg > 1:1170226‑M1/3‑100 (MQ=255) cggcagcgcctgtcagagtgcggccagccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCg > 1:475459‑M2/32‑100 (MQ=255) CGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCg < 2:1055555‑M1/100‑1 (MQ=255) CGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCg < 1:872195‑M1/100‑1 (MQ=255) GGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCgg < 1:1823719‑M1/100‑1 (MQ=255) GGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCgg < 2:1224104‑M1/100‑1 (MQ=255) GGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCgg > 1:2145728‑M1/1‑100 (MQ=255) GGCTCGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGACCTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCgg > 1:1668688‑M1/1‑100 (MQ=255) gcagcgcctgccagagtgcggccagccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGc > 2:461889‑M2/30‑100 (MQ=255) GCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGc > 2:2068208‑M1/1‑100 (MQ=255) GCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGc > 2:1439968‑M1/1‑100 (MQ=255) GCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCAGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAACCAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgc < 1:1560496‑M1/92‑1 (MQ=255) CTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGgccgtggtggcagatcggaa < 2:1830812‑M1/100‑10 (MQ=255) CTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCt > 2:666798‑M1/1‑100 (MQ=255) tGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTg < 2:1888063/100‑1 (MQ=32) tGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTACTCGGCTg < 1:375221/100‑1 (MQ=17) cggcagcgcctgccagagtgcggccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTg > 2:1686759‑M2/28‑100 (MQ=255) cggcagcgcctgccagagtgcggccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTAGGTTg > 1:1368055‑M2/28‑100 (MQ=255) ggctgacctctGGCAGGCGCGGGCGGAGGAACACCGCTTGAGTCCGGACGGATAGCTGGCGCCACACCGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTgg < 1:1294970/93‑1 (MQ=2) ggCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTgg < 1:2503800/100‑1 (MQ=32) gCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgt > 2:2361420/1‑100 (MQ=33) ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg < 1:293558/100‑1 (MQ=32) ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg > 1:2734911/1‑100 (MQ=33) ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCCTAAGGCCGCATCGTTATCTGGCGACAACCAGTCCGCAGGGGACGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg < 2:1564759/100‑1 (MQ=11) cGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtgt > 1:1320892/1‑100 (MQ=32) cGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtgt > 2:624270/1‑100 (MQ=33) cGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtgt > 1:1657067/1‑100 (MQ=33) gCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGtgtg < 2:2372247/100‑1 (MQ=33) ctctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGc > 2:467448/1‑100 (MQ=33) ctctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGc > 2:1549069/1‑100 (MQ=33) ctctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGAAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGCGAGc > 1:645872/1‑100 (MQ=16) tctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCg < 1:1321617/100‑1 (MQ=33) ctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCgg < 1:2691677/100‑1 (MQ=33) tGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCggg < 1:824299/100‑1 (MQ=33) gCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTg > 2:243791/1‑100 (MQ=33) ggCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCg < 2:2348021/100‑1 (MQ=32) gcgcTTCCTGAAGCCCCCCGCTGAAGTCCGCCTCTTTATCGGGCGGGTAACAGGCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCGGTTGTGAGCGGGTGcc < 1:311052/98‑1 (MQ=2) cgcTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGa > 2:1119587/1‑100 (MQ=33) cgcTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGGGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCgg > 1:1456965/1‑99 (MQ=17) gcTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGaa > 1:1726246/1‑100 (MQ=32) cTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAg < 2:1533226/100‑1 (MQ=33) tGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGc < 1:1269177/100‑1 (MQ=33) gccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCg < 2:1443936‑M2/95‑1 (MQ=255) gccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCg > 2:402672‑M2/6‑100 (MQ=255) ccggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCgg < 1:2005824‑M2/96‑1 (MQ=255) cggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGa > 2:2108559‑M2/4‑100 (MQ=255) cggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGa > 1:1637328‑M2/4‑100 (MQ=255) cggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGa < 2:1716479‑M2/97‑1 (MQ=255) ggAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGAt < 1:744090‑M2/98‑1 (MQ=255) ggAAGAACTCCGCATAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGATAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGGTGGTGTGAGCGGGTGCCGGGAGCgg > 1:1791278‑M2/3‑98 (MQ=255) aagaaCTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGa > 2:2030957/1‑100 (MQ=32) | GGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGA > NC_000913/729972‑730172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |