| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 460,991 | G→A | 67.9% | A702T (GCA→ACA) | lon → | DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 460,991 | 0 | G | A | 67.9% | 109.9 / 85.1 | 100 | A702T (GCA→ACA) | lon | DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (15/17); new base A (43/25); total (58/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAACAGTGC > NC_000913/460892‑461090 | ccGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTgg > 1:359631/1‑100 (MQ=255) gAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACaa < 1:1886031/100‑1 (MQ=255) tcttGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATg < 2:1100103/97‑1 (MQ=255) gTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGAc > 1:648107/1‑100 (MQ=255) tGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGaga > 1:1100101/1‑98 (MQ=255) tGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGAcc > 1:2245015/1‑100 (MQ=255) gCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCg > 2:448202/1‑100 (MQ=255) cGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCgg > 1:2399475/1‑100 (MQ=255) cGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCg > 1:2269013/1‑99 (MQ=255) aCGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTg < 2:2863395/100‑1 (MQ=255) aCGCCGAAAGAGGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTg < 1:2638482/100‑1 (MQ=255) cGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTga < 2:2732299/100‑1 (MQ=255) ccGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTgaga > 2:1605914/1‑100 (MQ=255) cGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGAt < 2:2205829/100‑1 (MQ=255) cGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGAt > 2:2466570/1‑100 (MQ=255) cGAAAGATGGTCCCAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCTCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGAt > 1:1798133/1‑100 (MQ=255) gAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATc < 1:1434738/100‑1 (MQ=255) gATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCActc > 2:879483/1‑100 (MQ=255) aTGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCActct > 2:619733/1‑100 (MQ=255) gTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCg < 2:1988820/100‑1 (MQ=255) tCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGt < 1:1731796/100‑1 (MQ=255) ccGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTg < 2:326939/100‑1 (MQ=255) ccGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTg < 1:360385/100‑1 (MQ=255) ccGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTg > 1:2347354/1‑100 (MQ=255) cGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTgg < 2:2435082/100‑1 (MQ=255) gAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGt < 2:418612/100‑1 (MQ=255) gTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCa > 2:197971/1‑100 (MQ=255) tGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTgg < 1:1210918/96‑1 (MQ=255) ccGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGt > 1:1096742/1‑100 (MQ=255) ggTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTAc < 2:692700/100‑1 (MQ=255) aTTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCATGTACTGc < 2:1527251/100‑1 (MQ=255) aTTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGc > 1:2403165/1‑100 (MQ=255) ttGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGcc < 2:2107127/100‑1 (MQ=255) ttGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGcc < 1:1866455/100‑1 (MQ=255) tGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCg > 1:1443629/1‑100 (MQ=255) tGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCg > 1:970126/1‑100 (MQ=255) gCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGccag > 2:2462629/1‑98 (MQ=255) gCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGCGATGACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCg > 1:2408970/1‑99 (MQ=255) gCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGa > 2:2714339/1‑100 (MQ=255) tgtgCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCgg > 1:353445/1‑100 (MQ=255) agtgCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATc > 1:552769/2‑98 (MQ=255) gtgCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCggt > 1:2195837/1‑100 (MQ=255) gtgCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCggt < 1:2791083/100‑1 (MQ=255) tgCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCCCTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCggtg < 2:2765150/100‑1 (MQ=255) tgCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCggtg > 1:1985976/1‑100 (MQ=255) gCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCggtgg > 1:2787715/1‑100 (MQ=255) aCCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGtt < 2:773537/100‑1 (MQ=255) aCCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGtt > 1:2192256/1‑100 (MQ=255) aCCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTACGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGtt > 2:1627323/1‑100 (MQ=255) ccGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGttt < 1:1951394/100‑1 (MQ=255) gcgcTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTga > 2:456603/1‑100 (MQ=255) gcTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTgaaa < 2:341155/100‑1 (MQ=255) gcTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTgaaa < 1:581452/100‑1 (MQ=255) gcTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTgaaa < 1:448200/100‑1 (MQ=255) cTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTgaaag < 1:2006860/100‑1 (MQ=255) cTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTACGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTgaaag < 1:1627319/100‑1 (MQ=255) gTTTCTTACCTAACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTgaaagaaa > 1:1521017/1‑100 (MQ=255) tttCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGaaaa > 2:59075/1‑100 (MQ=255) cTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACt > 2:2665330/1‑100 (MQ=255) ttGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTTAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTc > 2:2625065/1‑100 (MQ=255) gCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCt < 2:2095802/100‑1 (MQ=255) gCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCt > 1:824991/1‑100 (MQ=255) gCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCt > 2:696944/1‑100 (MQ=255) ccTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTg < 1:1954234/100‑1 (MQ=255) cTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGTTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTg > 1:2697255/1‑99 (MQ=255) cTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTgg > 2:1620823/1‑100 (MQ=255) tGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAGCTCCTGGc < 2:1764307/100‑1 (MQ=255) tGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGc > 2:1721700/1‑100 (MQ=255) gACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCa > 2:190084/1‑100 (MQ=255) aCCGGTAACCCGGTTCGTGCCGCTGTGACAATGACCGGAGACATCACTCTTCGTGGTCAGGAACTGCCGCTCCGTGGTTTGAAAGGAAAACTCCTGGCAg > 1:2764372/1‑100 (MQ=255) ccGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAgc > 1:2060646/1‑100 (MQ=255) cGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGATCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAgcg > 2:731952/1‑100 (MQ=255) ggTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAgcgc > 1:2083663/1‑100 (MQ=255) gTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCa > 2:1691530/1‑100 (MQ=255) gTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGTAgcg > 1:1435862/1‑98 (MQ=255) aCCCGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATcg > 1:261553/1‑100 (MQ=255) cccGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATcgc < 2:674366/100‑1 (MQ=255) cccGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATcgc > 2:2270049/1‑100 (MQ=255) cccGGTTCGTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATcgc > 2:1356130/1‑100 (MQ=255) tCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCggg < 1:10715/100‑1 (MQ=255) tCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACACTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCggg < 1:2751719/100‑1 (MQ=255) gTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGAt > 1:383769/1‑100 (MQ=255) gTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGAt > 2:1875307/1‑100 (MQ=255) gTGCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGAt > 1:204874/1‑100 (MQ=255) gTGCCGAGGTGGCAATGACCGGTGAGATCAATCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGACAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGAt > 1:1525636/1‑100 (MQ=255) gCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTa < 2:2195845/100‑1 (MQ=255) gCCGATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTa > 2:1783770/1‑100 (MQ=255) gATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTaaaa < 2:175654/100‑1 (MQ=255) gATGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTaaaa > 1:2312548/1‑100 (MQ=255) aTGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTaaa < 1:1766459/98‑1 (MQ=255) aTGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAAc < 2:2136462/100‑1 (MQ=255) aTGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAAc < 2:2275280/100‑1 (MQ=255) aTGTGACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTCGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAAc < 1:1135574/100‑1 (MQ=255) tgtgACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAACa > 2:568556/1‑100 (MQ=255) gtgGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAACAg < 2:1443632/100‑1 (MQ=255) gtgACAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAACAg < 1:164521/100‑1 (MQ=255) tgGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAACAg > 1:1188894/1‑99 (MQ=255) tgGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAACAGt > 2:2834432/1‑100 (MQ=255) gCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAACAGTGc > 2:2151198/1‑100 (MQ=255) gCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAACAGTGc < 2:78919/100‑1 (MQ=255) | CCGGAAGGTGCGACGCCGAAAGATGGTCCGAGTGCCGGTATTGCTATGTGCACCGCGCTGGTTTCTTGCCTGACCGGTAACCCGGTTCGTGCCGATGTGGCAATGACCGGTGAGATCACTCTGCGTGGTCAGGTACTGCCGATCGGTGGTTTGAAAGAAAAACTCCTGGCAGCGCATCGCGGCGGGATTAAAACAGTGC > NC_000913/460892‑461090 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |