| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,128,359 | C→T | 74.2% | A13T (GCT→ACT) | metJ ← | transcriptional repressor, S‑adenosylmethionine‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,128,359 | 0 | C | T | 74.2% | 192.5 / 74.9 | 123 | A13T (GCT→ACT) | metJ | transcriptional repressor, S‑adenosylmethionine‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (16/16); new base T (39/52); total (55/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTAC > NC_000913/4128261‑4128455 | cTGACTACCCGTTCTTTCAGCTGTTATTATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCCTCTTGCCGTGCTCAGCg < 2:1694147/100‑1 (MQ=255) tGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAgtgt > 1:1260273/1‑100 (MQ=255) cgacgCTCGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATg < 2:1736086/100‑1 (MQ=255) acgCTTGCGTTCATCGGTGATGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATgg < 1:377250/99‑1 (MQ=255) gcgtgcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCt > 2:2206668/1‑100 (MQ=255) tgcgtTCATCGGTGAGGATTATTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGat > 1:2579346/1‑100 (MQ=255) gctttCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGata < 1:538609/97‑1 (MQ=255) gcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGata < 2:1174003/100‑1 (MQ=255) gcgtTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGata < 1:1348785/100‑1 (MQ=255) cgtTCATCGGCGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGatat > 2:1446716/1‑100 (MQ=255) gtTCAGCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGatata < 1:951287/100‑1 (MQ=255) tCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGatatat < 1:1682363/99‑1 (MQ=255) aTCGGTGAGGATTTTTAACACTTTAAGCGGAATAGAAACCGTAATCTTTTTGCCTTGTGCACTCTTCTTGCCTTGCTCAGTTTATGGGCTTATATATTcg > 1:767651/1‑100 (MQ=255) aTCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTcg > 2:2570122/1‑100 (MQ=255) cGGTGAGGATTTTTAACACCATAAAAGTAATGCAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTCCACTTTTCTTTCTGAGCTCATCGTATTGGCTGttatat > 1:2161256/1‑95 (MQ=255) ggTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTcgccg > 2:1153818/1‑100 (MQ=255) gTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTcgccgc < 2:2796391/100‑1 (MQ=255) tGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCt > 2:1046951/1‑100 (MQ=255) tGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCt < 1:550160/100‑1 (MQ=255) tGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCt > 2:2087566/1‑100 (MQ=255) cgAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCt < 2:177240/99‑1 (MQ=255) gAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCt > 1:155423/1‑99 (MQ=255) aGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTcc < 2:1854360/100‑1 (MQ=255) ggATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTTTCTTTTTTATTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGTATGATCTATTCGCCGATcta > 1:200899/1‑98 (MQ=255) ggATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTGACTCTTGTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTcc > 1:356868/1‑99 (MQ=255) ggATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCa > 2:2659160/1‑100 (MQ=255) ggATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCa > 2:2598085/1‑100 (MQ=255) gATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAt < 1:1153816/100‑1 (MQ=255) gATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAt > 1:1620231/1‑100 (MQ=255) aTTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAtt > 1:749773/1‑100 (MQ=255) aTTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCAtt > 1:408580/1‑100 (MQ=255) ttttAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCa < 2:46824/100‑1 (MQ=255) tttCACCCCTTAAGAGGTATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTGTGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAg < 2:2611058/100‑1 (MQ=255) tttAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAg > 2:1315116/1‑100 (MQ=255) tttAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAg < 2:2172471/100‑1 (MQ=255) tttAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCCTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAg > 1:1865788/1‑100 (MQ=255) tAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGcc < 2:708623/100‑1 (MQ=255) aaCACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTTTTTTTTTTACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGc > 1:50251/1‑98 (MQ=255) cacCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATg < 1:1111686/100‑1 (MQ=255) acCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTcctcttaag > 2:2737360/1‑92 (MQ=255) acCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATga < 1:1478023/100‑1 (MQ=255) ccTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATgag < 2:1596890/100‑1 (MQ=255) ccTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATgag < 1:1345536/100‑1 (MQ=255) ccTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATgag < 2:1208226/100‑1 (MQ=255) ttAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCCTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGAt > 2:2148590/1‑100 (MQ=255) tAAGAGGAATGTAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCCTCTTGCCTTTCTCAGCGTATGGGCTGTTATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGAt < 1:1000313/99‑1 (MQ=255) gagGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACtt < 2:1120500/100‑1 (MQ=255) ggAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTaa > 2:547224/1‑100 (MQ=255) ggAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCCTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTaa > 2:375841/1‑100 (MQ=255) aTGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCTCTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATcc < 1:1356862/100‑1 (MQ=255) aTGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATcc < 2:783459/100‑1 (MQ=255) aTGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATcc < 1:1765964/100‑1 (MQ=255) aTGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATcc < 1:2440961/100‑1 (MQ=255) aTGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGACATGAGATACTTAATcc < 1:398622/100‑1 (MQ=255) ggAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCGGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATTct > 1:2511278/1‑99 (MQ=255) ggAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCctc > 2:322655/1‑100 (MQ=255) gAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCctct > 1:529183/1‑100 (MQ=255) aCCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATACTCTTCg > 1:1291508/1‑100 (MQ=255) gTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCa > 1:1605873/1‑100 (MQ=255) gTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTATTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCa > 2:1767456/1‑100 (MQ=255) gTAAGCTTTTTGACTTGTGCACTGTTCTGGCCGCGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTc < 1:2323469/99‑1 (MQ=255) aaTCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGAGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGCGATACTTAATCCTCTTCGTCAAt > 2:2898439/1‑100 (MQ=255) aTCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAAt < 2:2533460/99‑1 (MQ=255) aTCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATa < 1:1185769/100‑1 (MQ=255) tCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATaa < 2:681710/100‑1 (MQ=255) ttttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAAtt < 2:2807953/100‑1 (MQ=255) ttttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAAtt < 1:2838162/100‑1 (MQ=255) ttttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAAtt < 1:2838486/100‑1 (MQ=255) tttGACTTGTTCACTCTTCTTGTCGTGCTCACTGTATTGGCTGATATTTTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTg < 1:1961407/100‑1 (MQ=255) tttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTg < 2:772510/100‑1 (MQ=255) tttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTg < 2:2701276/100‑1 (MQ=255) tttGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTg < 1:510487/100‑1 (MQ=255) tGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATNAANTgag < 1:369358/100‑1 (MQ=255) tGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgag < 1:108032/100‑1 (MQ=255) tGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgag > 1:2519555/1‑100 (MQ=255) gACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgaga > 2:2456255/1‑100 (MQ=255) gACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgaga < 1:429686/100‑1 (MQ=255) gACTTGTTCACTCCTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgaga > 2:1471917/1‑100 (MQ=255) aCTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTgaga < 1:1841910/99‑1 (MQ=255) cTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagacc < 2:377252/100‑1 (MQ=255) gTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccaga > 2:1738725/1‑100 (MQ=255) gTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccaga < 2:2729196/100‑1 (MQ=255) tCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccagacc < 2:603308/100‑1 (MQ=255) tCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccagacc < 2:603576/100‑1 (MQ=255) tCACTCCTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGagaccagacc < 1:171476/100‑1 (MQ=255) cACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAgaccagacca > 2:1875535/1‑100 (MQ=255) cACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAgaccagacca > 2:2148251/1‑100 (MQ=255) cACTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAgaccagacca > 2:1554197/1‑100 (MQ=255) cACTCCTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAgaccagacca > 2:2476646/1‑100 (MQ=255) aCTCTTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACcac < 2:2656812/100‑1 (MQ=255) ctctTCTTGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACcaca > 1:313272/1‑100 (MQ=255) cttGCCGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGtt < 2:2089205/100‑1 (MQ=255) cttGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGtt > 2:1036303/1‑100 (MQ=255) ccGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGAtg < 2:1604599/100‑1 (MQ=255) cGTGCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGAtgt < 1:654733/100‑1 (MQ=255) gCTCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTggg > 1:1077401/1‑100 (MQ=255) tCAGTGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTa < 1:2570111/100‑1 (MQ=255) tCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTa < 1:2886962/100‑1 (MQ=255) tCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTa < 1:2205541/100‑1 (MQ=255) cAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTAc < 1:129049/100‑1 (MQ=255) | CTGACGACGCGTGCGTTCATCGGTGAGGATTTTTAACACCTTAAGAGGAATGGAAACCGTAATCTTTTTGACTTGTTCACTCTTCTTGCCGTGCTCAGCGTATGGGCTGATATATTCGCCGCTCCATTCAGCCATGAGATACTTAATCCTCTTCGTCAATAAATTGAGACCAGACCACACAGTTGATGTGGGTAC > NC_000913/4128261‑4128455 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |