| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,767,507 | (C)7→8 | intergenic (+152/‑203) | rnlB → / → yfjP | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein/CP4‑57 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,767,500 | 1 | . | C | 88.9% | 380.0 / 44.0 | 130 | intergenic (+145/‑210) | rnlB/yfjP | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein/CP4‑57 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (7/7); new base C (42/70); total (53/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCT > NC_000913/2767403‑2767594 | gATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑c‑c < 2:1791632/100‑1 (MQ=255) atatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑c‑c‑c < 1:3261994/100‑1 (MQ=255) tatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑ACTCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACATTTATACCACTGCACCCACCACTCAATT‑T‑‑c‑a‑c‑c > 2:2735600/1‑100 (MQ=255) tatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACTCCCTCTCACAACTTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAATTT‑T‑‑c‑c‑c > 2:75492/1‑99 (MQ=255) ttAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAAATCTCCCCCCAC‑ACGTAATTCATAGAGCACACGTTGCTCCCTGTACCCACACAACAAAAAT‑A‑‑c‑c‑c‑c > 1:31926/1‑98 (MQ=255) ttAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACCATCCCTCACAACGTCATGCACAGGGAACAGGATTTCCACTATGCACCCACTACTAAATT‑c‑‑c‑cac > 2:877879/1‑96 (MQ=255) tAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACTCCCCCTCACAACATTCTTCATAGGCAACACGTTTTTCCCTATGCACCCACAAAAAAAAT‑T‑‑c‑c‑a‑cc > 2:2704916/1‑98 (MQ=255) tAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACCACATTTCCCCACGTCCTGCATAAGGAACACGTTTTCTCCTCTGCACCCACCACTCAATT‑T‑‑c‑c‑a‑ccc‑c > 2:649313/1‑100 (MQ=255) aCTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑c‑c‑c‑ccc‑cct < 2:26999/100‑3 (MQ=255) cTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACCCTCCCTAACAACGACCAGCATAGGGAACACGTTCTCCCCTGTGCACCCCCGACTAAATT‑T‑‑c‑c‑c‑c > 2:1016149/1‑94 (MQ=255) cTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACCAACCCTCACAACGTCAATCCTACGCGAAACATGCTCACCCGTGCACTCACGACTAAATT‑T‑‑c‑g‑a‑ccc‑cc > 1:559193/1‑97 (MQ=255) ttGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CCC‑Ccttt < 1:808547/100‑2 (MQ=255) tGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CCC‑Ccttta < 1:1839833/100‑3 (MQ=255) tCCAATATGATCAAATAGCATT‑ATCCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTaaa < 2:1729994/100‑1 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATT‑AACAGCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGCAACAAGTTTTCACCTGTGAACACACGACTAAATC‑T‑‑c‑c‑c‑ccc‑cccttcaa > 1:2458467/1‑92 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATT‑AA‑CCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACt < 1:2390261/100‑1 (MQ=255) cAATATGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACt < 2:2770729/100‑1 (MQ=255) atatGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCGCACAACAACTTGCATAGGGAAGACGCTCTCCCCTGGGCATCCACTCCTGAATT‑TA‑C‑C‑A‑AAC‑CTTTAAAc > 2:2726712/1‑97 (MQ=255) atGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTtctc < 1:2698210/100‑1 (MQ=255) atGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTtctc < 2:1196139/100‑1 (MQ=255) atGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTtctc < 2:3136000/100‑1 (MQ=255) atGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTtctc < 1:1752913/100‑1 (MQ=255) tGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTtctc < 2:1898612/99‑1 (MQ=255) tGATCAAATAGCATT‑AACCCCCAATCACAAGGTCCTGAATACGAATCACCATTCCGCATGTGCACTCACGACTAAATT‑TA‑C‑C‑C‑ACA‑CTTTAAAAtt > 2:800083/1‑96 (MQ=255) gATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATATGGAAAAAGTTTTCGCCTGTGCACCCACTACTAAATT‑T‑‑CTC‑C‑CCC‑CTTTAATTTtctaca > 2:1707039/1‑97 (MQ=255) gATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑CACCC‑CTTTAAACTTCTCaa > 2:1909005/1‑100 (MQ=255) cAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCaataa < 1:36448/100‑1 (MQ=255) aaTAGCATT‑ATCCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATg < 2:3207765/100‑1 (MQ=255) tAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTc < 2:746813/100‑1 (MQ=255) aGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCa < 2:1189201/100‑1 (MQ=255) gCATT‑AACCCCCCCTCACAACTTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCAc < 2:2642342/100‑1 (MQ=255) gCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCAc < 1:2615631/100‑1 (MQ=255) cATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTCACTT‑T‑‑C‑CAC‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGtaaac > 2:1625969/1‑96 (MQ=255) aTT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACAAGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTATAAAAAATCTCAcaa > 2:2586814/1‑98 (MQ=255) t‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAAtt < 1:2827509/100‑1 (MQ=255) aaCCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAACTT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCaa > 2:2655087/1‑98 (MQ=255) aCCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTCCTCAATAATTTCACCatt > 2:1685568/1‑96 (MQ=255) ccccccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTc < 2:56167/100‑1 (MQ=255) ccccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTAC‑‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg < 1:75494/100‑1 (MQ=255) ccccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg < 1:440327/100‑1 (MQ=255) cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg < 1:545957/100‑1 (MQ=255) cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg > 2:306973/1‑100 (MQ=255) cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTgg < 2:2453063/100‑1 (MQ=255) cccTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg < 2:1321018/99‑1 (MQ=255) cTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGaa > 2:826139/1‑100 (MQ=255) acaACGTCCTTCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATc < 2:494629/100‑1 (MQ=255) acaACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATc > 2:103777/1‑100 (MQ=255) caACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATcc < 1:156353/100‑1 (MQ=255) caACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATcc > 2:378668/1‑100 (MQ=255) aCGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa > 2:1728064/1‑100 (MQ=255) aCGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa < 2:2592455/100‑1 (MQ=255) aCGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa > 2:2593131/1‑100 (MQ=255) aCGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa < 2:3246859/100‑1 (MQ=255) gTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTAACCAATTTTCTGGAAATCCTat > 1:933541/1‑99 (MQ=255) tCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatga > 2:1225206/1‑100 (MQ=255) ccTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgat < 1:2985544/100‑1 (MQ=255) ccTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgat < 1:2219638/100‑1 (MQ=255) ccTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgat < 1:2427956/100‑1 (MQ=255) gCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGcc < 2:796253/100‑1 (MQ=255) gCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGcc < 2:2914995/100‑1 (MQ=255) gCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGcc > 1:2287451/1‑100 (MQ=255) aTAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCtt < 1:2589783/100‑1 (MQ=255) aTAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCCCAATAATGTCCCCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCAtt > 2:2534270/1‑100 (MQ=255) tAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCttt > 1:1383281/1‑100 (MQ=255) tAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCttt > 2:2269864/1‑100 (MQ=255) tAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCttt < 2:3012626/100‑1 (MQ=255) gggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTcc < 2:2336524/100‑1 (MQ=255) gggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑G‑‑C‑C‑C‑CCCGCTTTAAACTTCCCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTcc > 2:2723336/1‑100 (MQ=255) ggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTccc < 2:2337130/100‑1 (MQ=255) gAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAACCTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCg > 2:1921469/1‑100 (MQ=255) gAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGTAAATCCTATGATGCCTTTCCCg < 2:63339/100‑1 (MQ=255) acacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TCCC‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCgg < 2:559185/100‑1 (MQ=255) acacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGt < 1:844706/100‑1 (MQ=255) cacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTa > 1:1255094/1‑100 (MQ=255) cacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTa < 1:1003032/100‑1 (MQ=255) cGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTaaa > 1:3081514/1‑100 (MQ=255) tttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATgg < 2:1595380/100‑1 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc > 2:233559/1‑100 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc < 2:2177918/100‑1 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc < 2:1328638/100‑1 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc > 1:1094654/1‑100 (MQ=255) cccTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAACCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCt > 1:2967251/1‑100 (MQ=255) accTGTGCACAAACGACTAAGTT‑TA‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAACAATGTCACCAAATTCCTGGAAATCCTATTATGGCTTTCTCAGTAAATgg > 2:1241161/2‑96 (MQ=255) ccTGTGCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCtg > 2:1217864/1‑100 (MQ=255) tgtgCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCtgtg > 1:607740/1‑100 (MQ=255) tgtgCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCtgtg > 2:1783532/1‑100 (MQ=255) gtgCACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGa > 2:3215617/1‑100 (MQ=255) cACCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGtt > 1:370927/1‑100 (MQ=255) aCCCACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTc < 1:103780/100‑1 (MQ=255) cccACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCa < 2:2968489/100‑1 (MQ=255) ccACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAg < 1:2910817/100‑1 (MQ=255) cACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGa > 2:1653876/1‑100 (MQ=255) cACGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGa < 1:2704950/100‑1 (MQ=255) cGACTAAATT‑TCCC‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAg < 1:1527045/98‑1 (MQ=255) cGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa < 1:2868520/100‑1 (MQ=255) cGACTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa < 1:2748656/100‑1 (MQ=255) cTAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTCTGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGAt > 2:3115920/1‑100 (MQ=255) tAAATT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGAt < 1:2800139/99‑1 (MQ=255) aaaTT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTc > 2:83992/1‑100 (MQ=255) aaTT‑TC‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGCTTCt > 1:1537549/1‑100 (MQ=255) | GATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATT‑AACCCCCCCTCACAACGTCCTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATT‑T‑‑C‑C‑C‑CCC‑CTTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCT > NC_000913/2767403‑2767594 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |