New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2151673 = | NA (NA) | 8 (0.090) | 6/156 | NT | NA | intergenic (+27/+38) | yegJ/yegK | uncharacterized protein/ser/thr phosphatase‑related protein |
? | NC_000913 | 2151703 = | NA (NA) | intergenic (+57/+8) | yegJ/yegK | uncharacterized protein/ser/thr phosphatase‑related protein |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TACCATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGTTTACCGCCG > NC_000913/2151574‑2151772 | tgaattgttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcat < 1:571591‑M1/1‑1 (MQ=255) tgaattgttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcat < 2:512714‑M1/1‑1 (MQ=255) tgaattgttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcat < 1:578461‑M1/1‑1 (MQ=255) tACCATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACT > 1:2093984‑M1/1‑100 (MQ=255) tACCATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACT < 1:1661708‑M1/100‑1 (MQ=255) tACCATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACT < 2:2408626‑M1/100‑1 (MQ=255) gaattgttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTg > 1:2146937‑M1/99‑100 (MQ=255) ccATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTG > 1:1835375‑M1/1‑99 (MQ=255) ccATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATAAGCAGTTATATTTATTGTTTAAACTGG > 1:61576‑M1/1‑100 (MQ=255) cATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGC > 1:1124567‑M1/1‑100 (MQ=255) cATTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGC < 1:1673797‑M1/100‑1 (MQ=255) aTTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCG < 2:1946967‑M1/100‑1 (MQ=255) aTTGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCG < 1:1874278‑M1/100‑1 (MQ=255) ttGATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGG < 2:354782‑M1/100‑1 (MQ=255) tgttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTg > 2:730360‑M1/95‑96 (MQ=255) tgttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCgg < 1:2454815‑M1/6‑1 (MQ=255) ttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGtt < 2:1730759‑M1/8‑1 (MQ=255) ttaaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGtt > 1:1332075‑M1/93‑100 (MQ=255) gATCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGG > 1:291505‑M1/1‑98 (MQ=255) aTCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTG < 1:496499‑M1/100‑1 (MQ=255) tCCTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGA < 2:2601498‑M1/100‑1 (MQ=255) aaagcagtttttgtccagcccggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggagctgtgagcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGa < 1:981022‑M1/10‑1 (MQ=255) ccTTTATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAA < 2:394281‑M1/100‑1 (MQ=255) ccTTTATCGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAA > 2:1387680‑M1/1‑100 (MQ=255) ttATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttg < 1:1658345/100‑1 (MQ=255) ttATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttg > 2:765314/1‑100 (MQ=255) ttATTGGTCACCTAGCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTCTATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttg > 2:529778/1‑100 (MQ=255) tATTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGTTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTAGATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttgt < 1:733256/100‑1 (MQ=255) aTTGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttgtt < 1:29919/100‑1 (MQ=255) ttGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttgttg < 2:1348244/100‑1 (MQ=255) ttGGTCACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAttgttg < 1:1389416/100‑1 (MQ=255) cACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttc > 2:1069473‑M2/1‑97 (MQ=255) cACCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttc < 1:920076‑M2/100‑4 (MQ=255) aCCTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttca > 2:355524‑M2/1‑96 (MQ=255) ccTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaa < 2:45909‑M2/100‑6 (MQ=255) ccTATCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaa < 2:1685853‑M2/100‑6 (MQ=255) aTCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaaccg < 2:883408‑M2/100‑9 (MQ=255) aTCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaaccg > 1:1676133‑M2/1‑92 (MQ=255) tCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAgacaacaattcaaccgc < 2:587641‑M1/100‑18 (MQ=255) tCCAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaaccgc < 1:1579285‑M2/100‑10 (MQ=255) ccAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAgacaacaattcaaccgcc < 1:1327788‑M1/100‑19 (MQ=255) ccAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaaccgcc > 1:2159813‑M2/1‑90 (MQ=255) ccAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTAAATATATAATTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaaccgcc < 1:1502240‑M2/100‑11 (MQ=255) cggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCa > 1:2402671‑M1/71‑100 (MQ=255) cggcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCa > 2:571587‑M1/71‑100 (MQ=255) cAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaaccgcca < 2:1797909‑M2/100‑12 (MQ=255) cAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaaccgcca < 1:397232‑M2/100‑12 (MQ=255) cAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaaccgcca < 1:65788‑M2/100‑12 (MQ=255) cAAAAGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaaccgcca < 2:374024‑M2/100‑12 (MQ=255) aaaaGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCAt > 2:347499/1‑100 (MQ=255) gcggtaaacgagcgtacggatgatgataaaacgttggcactggcgctgtgggcagagtgagtttctcaTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATg > 1:1508178‑M1/69‑100 (MQ=255) aaaGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGTCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATg < 2:46444/100‑1 (MQ=255) aaaGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATg < 1:1938728/100‑1 (MQ=255) aaaGAAGAAGCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTAGTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATg < 1:90587/100‑1 (MQ=255) agaagaagCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATgag < 1:818772/100‑1 (MQ=255) agaagCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTTGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATgaga < 1:823452/98‑1 (MQ=255) aagCCGACGAGCTAAGAGCAAAATTAGTTCGCTAATCAGCCGTTATATTTATTGTTTAAACTGGCGGTTGAAgacaacaattcaaccgccagtttaaac < 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2:2449122/1‑100 (MQ=255) tttattTTTTAGACTCGCGGTTTAATTCGTGTCTTCAACCGCCATAATAAATTCACTCTGCCCACAGCTCCATTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTAc < 1:2216173/99‑1 (MQ=255) ttattGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCttcaaccgccagtttaaacaataaatataacggctgattagcgaactaattttgctcttagctcgtcg < 1:2345920‑M2/100‑69 (MQ=255) attGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTc > 1:114375/1‑100 (MQ=255) tGTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGt < 2:291503/100‑1 (MQ=255) gTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGtt > 2:1728841/1‑100 (MQ=255) gTTTAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGtt > 1:1409115/1‑100 (MQ=255) tttAAACTGGCGGTTGAATTGTTGTCTTCAACCGCCATGAGAAACTCACTCTGCCCACAGCGCCAGTGCCAACGTTTTATCATCATCCGTACGCTCGttt < 1:1258672/100‑1 (MQ=255) 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NC_000913/2151574‑2151772 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |