| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1198454 = | 152 (1.340) | 6 (0.080) +CATTTCATCATTTCATCATTTCATCATTTCATCATT |
4/126 | 11.8 | 5.8% | intergenic (‑217/‑241) | ymfE/lit | e14 prophage; putative inner membrane protein/T4 phage exclusion protein; cell death peptidase, e14 prophage |
| ? | NC_000913 | = 1198505 | 158 (1.390) | intergenic (‑268/‑190) | ymfE/lit | e14 prophage; putative inner membrane protein/T4 phage exclusion protein; cell death peptidase, e14 prophage | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
TGACGCTGGGTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTCGATAATTCAT > NC_000913/1198406‑1198604 | tGACGCTGGGTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatga < 2:1270252/100‑1 (MQ=255) gatcttGGGTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAc < 2:1709195/95‑1 (MQ=255) gACGCTGGGTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAc > 1:1367048/1‑100 (MQ=255) aCGCTGGGTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAc < 1:2256954/99‑1 (MQ=255) cGCTGGGTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACag > 1:264499/1‑100 (MQ=255) cGCTGGGTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACag < 2:1970233/100‑1 (MQ=255) cTGGGTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACagag > 1:225009/1‑100 (MQ=255) cTGGGTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACagag > 2:2596565/1‑100 (MQ=255) gggTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAgtg > 2:2149072/1‑100 (MQ=255) gggTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAgtg > 2:1880094/1‑100 (MQ=255) gggTAAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAgtg < 1:1938830/100‑1 (MQ=255) gTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTc < 2:550504/100‑1 (MQ=255) tGAGAATCTGAAGTTGATAGAAATGAAATAATTAGATAATGAAATGATGAAGTGATGAAATGATGAAATGATGGAATGATGAAATGATTATaga > 1:2181111/1‑94 (MQ=21) tGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTcc < 2:1265139/100‑1 (MQ=255) gagaATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAgtg > 1:1748497/1‑96 (MQ=255) gagaATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCa > 1:614734/1‑100 (MQ=255) agaATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAg < 2:2392993/100‑1 (MQ=255) aaaaTCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAgtg < 1:1094026/93‑1 (MQ=255) aTCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTgg > 2:2770608/1‑100 (MQ=255) cTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGc < 2:156831/100‑1 (MQ=255) tGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCa > 1:621906/1‑100 (MQ=255) tGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCAAGTg > 1:2708353/1‑96 (MQ=255) gAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCa > 1:2598891/1‑99 (MQ=255) aaaaTGATAGACATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGc < 1:1967648/97‑1 (MQ=255) aaaTTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACg < 2:766950/100‑1 (MQ=255) aaaTTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACg < 2:2565777/100‑1 (MQ=255) aTTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATAAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGa > 2:2031405/1‑100 (MQ=255) tGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATg > 1:2051494/1‑100 (MQ=255) tAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGgtn < 2:721668/100‑2 (MQ=255) tAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGgtg > 2:1085842/1‑100 (MQ=255) ccgatctgaaataatgaaataatgaaatGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGgtg < 2:1776493/94‑1 (MQ=255) gaaatgaaatAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTc > 1:147402/1‑100 (MQ=255) gaaatgaaatAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTc > 2:2657570/1‑100 (MQ=255) gaaatgaaatAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGAATGGTGTc > 1:565407/1‑100 (MQ=255) aaatgaaatAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCt < 1:2234625/100‑1 (MQ=255) aatgaaataatgaaataatgaaatGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCtt < 1:2779589/100‑1 (MQ=255) atgaaataatgaaataatgaaatGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTa < 2:2845134/100‑1 (MQ=255) atgaaataatgaaataatgaaatGATGAAATGATCAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGCATGCTGTCTTa < 1:1518842/100‑1 (MQ=255) tgaaataatgaaataatgaaatGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTAc > 2:1786699/1‑100 (MQ=255) gaaataatgaaataatgaaatGATGAAATGATGAAATGCTGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGgtgagatcgg > 1:1776481/1‑93 (MQ=255) aaataatgaaataatgaaatGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGa < 2:915271/100‑1 (MQ=255) aataatgaaataatgaaatGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGAc < 2:2043002/100‑1 (MQ=255) ataatgaaataatgaaatGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACa > 2:43935/1‑100 (MQ=255) taatgaaataatgaaatGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACAt > 2:2180642/1‑100 (MQ=255) gaaataatgaaatGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCtt > 1:2153360/1‑100 (MQ=255) aaataatgaaatGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTa < 2:1168321/100‑1 (MQ=255) tccgatctatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTAcc < 2:1336895/92‑1 (MQ=255) taatgaaatGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCt < 2:347725/100‑1 (MQ=255) aatgaaatgaTGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCtt > 2:2530100/1‑100 (MQ=255) atgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGTTGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTa < 2:1757260/100‑1 (MQ=255) tgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgaTGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTaa > 2:171655/1‑100 (MQ=255) tgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgaTGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTATTACGACATGCTTACCTTaa > 1:732117/1‑100 (MQ=255) gaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTatt < 2:1953931/100‑3 (MQ=255) gaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGAATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAAt < 1:352257/100‑1 (MQ=255) gaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatGACAGAGTGTCAAGTGGGCACGGTTGGTGGCTTACGACATGCTTACTTTAAt > 1:1116684/1‑100 (MQ=25) atgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAAGCGt < 2:614736/100‑1 (MQ=255) atgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTGACCTTAATCg > 2:577572/1‑99 (MQ=255) atgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaaggatgaaatgattaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTcc < 2:2047920/100‑1 (MQ=255) tgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTccc > 2:2860751/1‑100 (MQ=255) gaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCa > 1:2815219/1‑100 (MQ=255) gaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCa > 1:199842/1‑100 (MQ=255) aaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAg > 1:2617144/1‑100 (MQ=255) atgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAgtg > 2:299890/1‑100 (MQ=255) atgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAgtg < 1:32340/100‑1 (MQ=255) gatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGtgtg < 1:1078779/100‑1 (MQ=255) gatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGtgtg < 1:856559/100‑1 (MQ=255) gatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGtgtg < 2:1779809/100‑1 (MQ=255) atgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGc > 1:1229766/1‑100 (MQ=255) atgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGACACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGc > 1:1376743/1‑100 (MQ=255) tgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGcc < 1:2306855/100‑1 (MQ=255) aaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCta < 1:1611232/100‑1 (MQ=255) atgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCtata < 1:2149054/100‑1 (MQ=255) atgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCtata < 1:1154222/100‑1 (MQ=255) gatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGc > 2:1529056/1‑100 (MQ=255) aagaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCa < 2:1868799/98‑1 (MQ=255) tgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAg < 1:542496/100‑1 (MQ=255) tgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGAACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAg > 1:2460661/1‑100 (MQ=255) gaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGa > 2:1767688/1‑100 (MQ=255) gaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGa < 2:707928/100‑1 (MQ=255) gatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGAACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTc > 1:2311259/1‑100 (MQ=255) atgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCt > 2:2790898/1‑100 (MQ=255) aaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTaaa > 2:1556999/1‑100 (MQ=255) aaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTaaa < 1:1871433/100‑1 (MQ=255) aaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTaaa > 2:2317511/1‑100 (MQ=255) aaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTaaa > 2:1989120/1‑100 (MQ=255) aaacgatgaaatgatgaCAGAGTGTTCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTaa > 2:1256472/1‑99 (MQ=255) aatgatgaaatgatgaCAGATTGGCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAAc < 1:1256466/100‑1 (MQ=255) atgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTaaaga > 2:1491146/1‑98 (MQ=255) atgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACa < 1:681884/100‑1 (MQ=255) gatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATg > 2:740533/1‑100 (MQ=255) tgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTTGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTc < 2:2708377/100‑1 (MQ=255) tgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTc < 2:225010/100‑1 (MQ=255) gaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTCg > 1:2667506/1‑100 (MQ=255) aaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTCGa > 2:2020448/1‑100 (MQ=255) atgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTCGATa < 2:2815245/100‑1 (MQ=255) tgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCCTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTCGATAATTc < 1:1223562/100‑1 (MQ=255) gaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTCGATAATTCa < 2:667011/100‑1 (MQ=255) gaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTCGATAATTCa > 2:1595528/1‑100 (MQ=255) aCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTCGATAATTCAt > 2:2625713/1‑100 (MQ=255) aCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTCGATAATTCAt < 1:2180624/100‑1 (MQ=255) | TGACGCTGGGTGAGAATCTGAAATTGATAGAAATGAAATAATGAAATAATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAATCGTTCCCAGTGTGCCTATAGCAGATATTCTAAACATGTCGATAATTCAT > NC_000913/1198406‑1198604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |