| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,903,571 | A→G | 36.1% | T164A (ACC→GCC) | manY → | mannose‑specific enzyme IIC component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,903,571 | 0 | A | G | 36.1% | 113.2 / 121.3 | 119 | T164A (ACC→GCC) | manY | mannose‑specific enzyme IIC component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/44); new base G (22/21); total (54/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GGCAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGG > NC_000913/1903472‑1903670 | ggCAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTa < 2:1637628/100‑1 (MQ=255) cAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGcc < 1:1694451/100‑1 (MQ=255) cAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTAcc > 2:2192252/1‑100 (MQ=255) cAACCTGACAGCGATCTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTAcc < 1:2807669/100‑1 (MQ=255) aaCCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCa < 1:2651980/100‑1 (MQ=255) aCCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAg < 1:2141243/100‑1 (MQ=255) aCCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAg < 1:1907175/100‑1 (MQ=255) ccTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGc < 1:2518725/100‑1 (MQ=255) ccTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGc < 2:2291931/100‑1 (MQ=255) tGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGa < 1:2579204/100‑1 (MQ=255) aCAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAg < 1:1537692/100‑1 (MQ=255) aCAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAg < 2:727500/100‑1 (MQ=255) gCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTAc > 2:783224/1‑100 (MQ=255) cGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTAc > 2:2904509/1‑99 (MQ=255) cGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACa < 1:2782966/100‑1 (MQ=255) cGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACa < 2:2817351/100‑1 (MQ=255) aTTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGa < 2:3302453/100‑1 (MQ=255) aTTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGa < 1:2043269/100‑1 (MQ=255) ttCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAAc < 1:3050799/100‑1 (MQ=255) ttCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAAc < 1:2443190/100‑1 (MQ=255) ttCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAAc < 2:2363344/100‑1 (MQ=255) ccTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACAt < 2:2489856/100‑1 (MQ=255) ccTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACAt > 1:3363058/1‑100 (MQ=255) cTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATg > 1:3412581/1‑100 (MQ=255) tGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGc < 1:2228322/100‑1 (MQ=255) gATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTg < 2:2699223/100‑1 (MQ=255) gATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTg < 1:710193/100‑1 (MQ=255) gATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTg > 1:2195744/1‑100 (MQ=255) gATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTg < 1:1499305/100‑1 (MQ=255) aCGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGc > 2:2219355/1‑100 (MQ=255) aCGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGc > 2:1332452/1‑100 (MQ=255) aCGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGc < 2:1857386/100‑1 (MQ=255) aCGTTTCGTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGc < 1:1860015/100‑1 (MQ=255) tttCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGAt < 1:785393/100‑1 (MQ=255) ttctCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCg < 2:1893605/100‑1 (MQ=255) tctcTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCgg > 1:171905/1‑100 (MQ=255) tctcTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCgg > 2:377617/1‑100 (MQ=255) ctctGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGa < 2:1744065/100‑1 (MQ=255) gTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAggg > 2:3436617/1‑98 (MQ=255) gTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAg > 2:3037594/1‑98 (MQ=255) ccTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAgtggtg > 1:214177/1‑100 (MQ=255) cTGCAAGCAATGCGTGTGGCTCTTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGa > 1:2191402/1‑100 (MQ=255) cTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGa > 1:1250640/1‑100 (MQ=255) cTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGa > 2:1153935/1‑100 (MQ=255) tGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAc > 2:2721578/1‑100 (MQ=255) tGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAc > 1:2634092/1‑100 (MQ=255) tGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGCATGCGATTCCGGAAGTGGTGAc < 1:2007045/100‑1 (MQ=255) tGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAc > 1:2069054/1‑100 (MQ=255) tGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAc < 1:248334/100‑1 (MQ=255) gcaagcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAcc > 2:3156723/1‑100 (MQ=255) gcaagcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGAcc > 1:1559378/1‑100 (MQ=255) aagcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCaa > 2:1448204/1‑100 (MQ=255) agcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAAt > 1:1487866/1‑100 (MQ=255) gcaaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATg > 2:1228876/1‑100 (MQ=255) caaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATgg < 1:798207/100‑1 (MQ=255) caaTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATgg < 1:438208/100‑1 (MQ=255) aTGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTc < 1:672898/100‑1 (MQ=255) gCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTg < 2:356936/100‑1 (MQ=255) cGTGTGTCTATTGCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGa < 2:3232828/100‑1 (MQ=255) tgtgGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAat > 2:50110/1‑100 (MQ=255) tgtgGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAat > 1:435019/1‑100 (MQ=255) ggCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATc > 2:1194014/1‑100 (MQ=255) ggCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATc < 1:2561889/100‑1 (MQ=255) ggCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATc > 2:121824/1‑100 (MQ=255) gCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCg < 1:1958275/100‑1 (MQ=255) gCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCg < 2:3424898/100‑1 (MQ=255) cTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGc < 2:3008663/100‑1 (MQ=255) tATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGcc < 1:3436589/100‑1 (MQ=255) tATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGcc < 2:1096078/100‑1 (MQ=255) ttCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCgg > 2:340725/1‑100 (MQ=255) ttCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCgg > 1:418109/1‑100 (MQ=255) ccGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTg < 2:2195761/100‑1 (MQ=255) ggCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATTCTTAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTg < 1:177983/98‑1 (MQ=255) ccGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCAt < 1:102478/100‑1 (MQ=255) ccGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCAt < 1:2219337/100‑1 (MQ=255) cggtaTCGTGGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATg < 1:2735136/96‑1 (MQ=255) cGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATg > 2:208308/1‑100 (MQ=255) cGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGAGTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATg > 1:1547948/1‑100 (MQ=255) tCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACGAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGAt > 1:2075555/1‑100 (MQ=255) tCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGAt < 1:166804/100‑1 (MQ=255) cATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATc > 2:2359925/1‑100 (MQ=255) cATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATc > 2:2481541/1‑100 (MQ=255) aTCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCg < 1:2479119/100‑1 (MQ=255) aTCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCg < 1:3156699/100‑1 (MQ=255) gTTGCGCTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtgg < 1:809829/100‑1 (MQ=255) ttGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt < 2:887642/100‑1 (MQ=255) ttGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt < 2:1404948/100‑1 (MQ=255) gcgcTGTCTGTTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGtggtgg > 1:3290564/1‑100 (MQ=255) tcttgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggttggt < 2:3384244/97‑1 (MQ=255) gtctgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggttggt < 2:1345849/100‑1 (MQ=255) tgtTGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGtggttggtaga > 1:3384219/1‑97 (MQ=255) gtTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATg > 1:3407495/1‑100 (MQ=255) gtTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATg > 2:511486/1‑100 (MQ=255) ttGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGc < 1:217665/100‑1 (MQ=255) tGGTGCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCg > 2:824964/1‑100 (MQ=255) gTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGAt > 1:1171155/1‑100 (MQ=255) tACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATg > 1:1077658/1‑100 (MQ=255) tACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAAAGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATg < 2:1373226/100‑1 (MQ=255) aCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATgg > 2:3073501/1‑100 (MQ=255) aCCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATgg < 1:1153924/100‑1 (MQ=255) | GGCAACCTGACAGCGATTTCCTGGATCCACGTTTCTTCTCTGTTCCTGCAAGCAATGCGTGTGGCTATTCCGGCCGTCATCGTTGCGCTGTCTGTTGGTACCAGCGAAGTACAGAACATGCTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGCGATGG > NC_000913/1903472‑1903670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |