| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,950,955 | Δ1 bp | 16.8% | coding (124/567 nt) | yecD → | isochorismatase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,950,954 | 0 | G | . | 16.8% | 320.0 / 70.7 | 119 | coding (123/567 nt) | yecD | isochorismatase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/52); new base . (9/11); total (56/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-02 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CACTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCC > NC_000913/1950855‑1951050 | cACTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcg < 2:2102505/100‑1 (MQ=255) aCTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcgg < 2:1668210/100‑1 (MQ=255) cTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcggc < 1:1032237/100‑1 (MQ=255) cTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcggc < 2:312503/100‑1 (MQ=255) cTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGAAGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcggc > 1:993102/1‑100 (MQ=255) cTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCGTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcggc < 2:2613424/100‑1 (MQ=255) ntggtggTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAAt > 1:1318999/2‑100 (MQ=255) cTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGTCGGTGGTCTTAATACTGGAAATGCTGTAGTTAATCGCGCCGGTACGCTGTCGGCGCAAt > 1:1015476/1‑100 (MQ=255) ggtggtGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAAttt < 2:1128149/100‑1 (MQ=255) ggtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTcg‑c < 1:2542324/100‑1 (MQ=255) ggtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTcg‑c < 1:2680209/100‑1 (MQ=255) ggtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTc > 1:141557/1‑98 (MQ=255) gtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTcg‑cg < 2:830779/100‑1 (MQ=255) tCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGGCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTcg‑ccaccag < 1:659618/100‑7 (MQ=255) tCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAATCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAg < 2:2262453/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTTCCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGATGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 1:2441335/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 2:2202324/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 2:1923038/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 2:1227393/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 2:2245190/100‑1 (MQ=255) gagttACAAGAAGGCGTCTTAGCTTTTGCCGGTGGTCCACATACGGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 1:1884472/96‑1 (MQ=37) gATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAAACGCCCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 2:1283063/99‑1 (MQ=38) aTTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCTGCGAAATTTCG‑AGCCAGCgg > 1:1315/1‑100 (MQ=255) aTTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCgg < 2:2547760/100‑1 (MQ=255) aTTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCgg > 2:411353/1‑100 (MQ=255) aTTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCgg < 1:77240/100‑1 (MQ=255) tttACAAGAAGGCATCTTAACTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCgg < 2:1362465/99‑1 (MQ=255) tACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCCGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCa > 1:490888/1‑100 (MQ=255) aCAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAg < 2:1840321/100‑1 (MQ=255) cAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGACCGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGCTCa > 1:314220/1‑98 (MQ=255) aagaagGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGcc < 2:617957/100‑1 (MQ=255) agaagGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGcc > 1:145674/1‑99 (MQ=255) gaagGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTACTCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCg > 1:2339810/1‑100 (MQ=255) gaagGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCg > 2:607611/1‑100 (MQ=255) aagGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGGTGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCgt > 2:2896354/1‑100 (MQ=255) aagGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGTAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCgt < 1:1563211/100‑1 (MQ=255) gCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGtt < 2:2875098/100‑1 (MQ=255) aTCTTGCCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTc < 1:951024/100‑1 (MQ=255) aTCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGtt < 1:2271340/98‑1 (MQ=255) aTCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTc > 2:1882122/1‑100 (MQ=255) tCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCt < 2:2590196/100‑1 (MQ=255) ttACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTgg < 2:2274960/100‑1 (MQ=255) ccTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTgc < 2:495634/100‑1 (MQ=255) ttttGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTgcgc > 1:908792/1‑100 (MQ=255) ttttGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTgcgc > 1:1984573/1‑100 (MQ=255) tGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGtt < 2:629419/100‑1 (MQ=255) gCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTACTCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTg > 1:557675/1‑100 (MQ=255) ccGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTgg < 1:293730/100‑1 (MQ=255) tggtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTgg > 2:2367042/1‑100 (MQ=255) ggtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTgn < 1:2539355/99‑2 (MQ=255) gtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTc > 2:2335679/1‑100 (MQ=255) ggccACATACTGCCGAGGAGGTAGTTAACCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTc < 2:342902/98‑1 (MQ=255) tCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCt > 2:2387978/1‑100 (MQ=255) tCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCt < 2:961272/100‑1 (MQ=255) cTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTa < 2:540563/100‑1 (MQ=255) cTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTa > 1:1322803/1‑100 (MQ=255) gCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACg > 1:2364101/1‑100 (MQ=255) gCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACg > 1:2892614/1‑100 (MQ=255) gCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTGTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACg > 1:250815/1‑100 (MQ=255) gCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGCAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACg > 2:1776416/1‑100 (MQ=255) ccGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGc < 2:469183/100‑1 (MQ=255) cGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGc > 1:202382/1‑99 (MQ=255) gAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCTTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGagg < 2:1971091/100‑3 (MQ=255) gAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAg < 1:1712877/100‑1 (MQ=255) gAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAg < 1:416487/100‑1 (MQ=255) gTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCAt > 1:2245993/1‑100 (MQ=255) tAGTTAATCGCGACGGGAAGCTGGCCGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGTCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCAtt > 2:142868/1‑100 (MQ=255) aGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTa > 1:2702104/1‑100 (MQ=255) aGTTAATAGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTa > 2:1532671/1‑100 (MQ=255) gTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaa > 2:640719/1‑100 (MQ=255) gTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaa < 1:10622/100‑1 (MQ=255) ttAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaaa < 2:2212254/100‑1 (MQ=255) ttAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaaa < 1:2168342/100‑1 (MQ=255) tAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTTGTGCGCTTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTAAAGCATTaaaa > 1:1555615/1‑100 (MQ=255) tAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaaaa < 2:2513288/100‑1 (MQ=255) aaTCGCTCCGGGAATCTGGCGGCTAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaaa < 2:1994995/98‑1 (MQ=255) aaTCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAAc > 1:1744330/1‑100 (MQ=255) aTCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGTCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACa < 1:657099/100‑1 (MQ=255) cgcgTCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTGG‑CGCCAGCGGTCGGCCCGTGTTTCTGGTGCGCTTTGGCTGGTTTGCCGATTTCGCTGAAGCATTAAAACAGc > 1:1154632/1‑100 (MQ=255) cgcgCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGc > 2:2204545/1‑100 (MQ=255) cgcgCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGc > 1:2663533/1‑100 (MQ=255) gcgcCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGcc < 1:896404/100‑1 (MQ=255) cgcCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCg < 2:1327102/100‑1 (MQ=255) ctgaccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGAGGGCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTc > 1:1912898/7‑100 (MQ=37) cGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTc < 1:2355161/100‑1 (MQ=255) cGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTc < 1:484241/100‑1 (MQ=255) gggAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCg < 2:1311798/100‑1 (MQ=255) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg > 2:1070349/3‑100 (MQ=39) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg > 2:2287581/3‑100 (MQ=39) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg > 2:2799747/3‑100 (MQ=39) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg > 2:2584300/3‑100 (MQ=39) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCACGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGCTCTGCCGATTACGCTGAAGAATTAAAACAGCCGGTCGATg > 1:276824/3‑100 (MQ=37) aaGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg < 2:803137/100‑1 (MQ=255) aaGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg < 2:2045277/100‑1 (MQ=255) aGCTGGCGGCGGAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTTGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgc < 1:784937/100‑1 (MQ=255) gCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcg > 2:2854242/1‑100 (MQ=255) cTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcgc < 1:1606966/100‑1 (MQ=255) cTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcgc > 1:2153976/1‑100 (MQ=255) ggcggcGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGccc > 2:1152175/1‑100 (MQ=255) ggcggcGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGccc < 1:1093601/100‑1 (MQ=255) | CACTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCC > NC_000913/1950855‑1951050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |