| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,679,430 | Δ1 bp | 23.7% | intergenic (‑63/+34) | yphF ← / ← yphG | putative sugar ABC transporter periplasmic binding protein/DUF4380 domain‑containing TPR repeat protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,679,430 | 0 | G | . | 23.7% | 319.6 / 105.6 | 118 | intergenic (‑63/+34) | yphF/yphG | putative sugar ABC transporter periplasmic binding protein/DUF4380 domain‑containing TPR repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/39); new base . (15/13); total (66/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.35e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
ATAATAGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCAA > NC_000913/2679331‑2679524 | ataataGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAg > 2:2772315/1‑100 (MQ=255) taataGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATGGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAgc > 2:2053717/1‑100 (MQ=255) ataGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAgcgc > 2:46170/1‑100 (MQ=255) ataTTACTGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTAGTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGcgcg < 1:358615/97‑1 (MQ=255) ttACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGcc < 2:720038/100‑1 (MQ=255) ttACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTCTAGTGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGcc < 1:2288261/100‑1 (MQ=255) aCGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGc < 2:2473238/100‑1 (MQ=255) aCGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGc < 2:2643440/100‑1 (MQ=255) cGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGTGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCt < 1:646837/100‑1 (MQ=255) gggTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTc < 2:456522/100‑1 (MQ=255) gggTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTc < 2:1948360/100‑1 (MQ=255) ttccgatctcATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCa < 1:494635/94‑1 (MQ=255) ttccgatctcATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCa < 1:494645/94‑1 (MQ=255) ggTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCa < 2:2556269/100‑1 (MQ=255) ggTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCa > 2:107158/1‑100 (MQ=255) ggTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCa < 1:2900234/100‑1 (MQ=255) gttgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACATCGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCat < 1:2011903/100‑2 (MQ=255) gttgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCat < 1:2447584/100‑2 (MQ=255) gttgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCat < 2:2222116/100‑2 (MQ=255) ttgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCaaa < 2:1564071/100‑1 (MQ=255) ttgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCatc < 1:516696/100‑3 (MQ=255) ccgatctcATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCatc < 1:257914/96‑3 (MQ=255) tgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CTCGCTGCCGCTCatca < 1:517898/100‑4 (MQ=255) tgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCatca < 2:785316/100‑4 (MQ=39) gttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTACTTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAata > 2:2453761/1‑100 (MQ=255) gttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAata > 2:2125092/1‑100 (MQ=255) tctcATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATAtt < 2:1343239/100‑1 (MQ=255) ctcATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTa > 2:2429287/1‑100 (MQ=255) cATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACa > 2:228457/1‑100 (MQ=255) cATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCatcagatcgg > 2:257915/1‑91 (MQ=38) cATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCaagatcggaa > 2:494638/1‑92 (MQ=255) cATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCaagatcggaa > 2:494648/1‑92 (MQ=255) aTTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCACTCAAATATTACAg < 2:2334897/100‑1 (MQ=255) tttGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTa > 1:2657046/1‑100 (MQ=255) gCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGt < 2:2197801/100‑1 (MQ=255) gCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAAGAggg > 1:2306960/1‑99 (MQ=255) cATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGtt > 2:400268/1‑100 (MQ=255) aTAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGttt < 1:937193/100‑1 (MQ=255) gagCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTTTTTTTTTTTTCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACATTTAATAGGGTTTAg > 1:2332145/1‑99 (MQ=255) gagCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGt < 2:726297/100‑1 (MQ=255) gagCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGt > 2:922911/1‑100 (MQ=255) agCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTg < 1:307305/100‑1 (MQ=255) gCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGa > 1:1085555/1‑100 (MQ=255) ttctGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAAcg < 1:709605/98‑1 (MQ=255) tcctGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAAcg > 1:1326845/1‑100 (MQ=255) cctGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAAcgc < 1:2446036/100‑1 (MQ=255) cctGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAAcgc > 2:1842114/1‑100 (MQ=255) tGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCgg > 1:2556545/1‑100 (MQ=255) gTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGt > 2:750997/1‑100 (MQ=255) tAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGtt > 2:1116287/1‑100 (MQ=255) tAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGtt < 2:2472413/100‑1 (MQ=255) tAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGtt < 1:467902/100‑1 (MQ=255) tAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTAAGTGAAc > 1:938709/1‑94 (MQ=255) ggTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTaaa < 2:873887/100‑1 (MQ=255) gTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTaaaa > 2:1520310/1‑100 (MQ=255) tttttATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTaaaaa < 2:657108/100‑1 (MQ=255) tttttATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTaaaa < 1:1437091/99‑1 (MQ=255) tttATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAGTAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATa > 1:1027500/1‑100 (MQ=255) tttATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATa > 1:2179166/1‑100 (MQ=255) tattaACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATaaa < 2:1365599/100‑1 (MQ=255) tattaACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATaaa > 1:2759672/1‑100 (MQ=255) taACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAgg > 2:193250/1‑100 (MQ=255) aacaacGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGc > 1:623927/1‑100 (MQ=255) caacGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCAt > 1:264209/1‑100 (MQ=255) acGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCa > 1:1811662/1‑100 (MQ=255) gCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACgg > 1:1176657/1‑100 (MQ=255) tATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACggtgg > 1:406750/1‑100 (MQ=255) aTTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACggtggt < 1:2795641/100‑1 (MQ=255) ttCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGgtggtg < 2:2586052/100‑1 (MQ=255) tCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAATTATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGa > 1:1811644/1‑100 (MQ=255) tCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGa > 1:2139447/1‑100 (MQ=255) tCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGa > 2:221207/1‑100 (MQ=255) cTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGaa > 2:1396092/1‑100 (MQ=255) cTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGaa < 2:1013897/100‑1 (MQ=255) attattTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGaataa > 1:612650/1‑100 (MQ=255) tattTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATg < 2:2825465/100‑1 (MQ=255) ctgtaatatttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATg > 2:1699934/11‑100 (MQ=37) attTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGc > 1:2212481/1‑100 (MQ=255) attTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGc < 2:1176662/100‑1 (MQ=255) gtaatatttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGcc > 2:1954240/9‑100 (MQ=37) tttGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCg > 1:2064728/1‑100 (MQ=255) atatttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAACATAAAAGGCATCACGGAGGTGAATAATGCCGc > 2:100038/6‑99 (MQ=37) atatttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGc > 1:618286/6‑99 (MQ=38) tttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTc > 1:319243/3‑100 (MQ=255) ttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCg > 1:2614024/2‑100 (MQ=255) ttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCg > 2:517164/2‑100 (MQ=255) ttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCg > 1:1879586/2‑100 (MQ=255) atgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTc < 2:1274024/99‑1 (MQ=255) atgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCg < 2:1844961/100‑1 (MQ=255) atgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCg > 1:1725084/1‑100 (MQ=255) atgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCg > 1:1648856/1‑100 (MQ=255) atgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCg > 2:1142877/1‑100 (MQ=255) tgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCgg < 2:581975/100‑1 (MQ=255) tgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCgg > 1:1565168/1‑100 (MQ=255) tgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGCACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTCAATAATGCCGCTTTc > 1:196630/1‑98 (MQ=255) tgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCgg > 2:1510980/1‑100 (MQ=255) gaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGAATCACGGAGGTGAATAATGCCGCTTTCGGc > 2:2907704/1‑100 (MQ=255) aGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGcc > 2:2748952/1‑100 (MQ=255) aGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGcc > 2:2493351/1‑100 (MQ=255) cGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACGTTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCaa < 2:673652/100‑1 (MQ=255) | ATAATAGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCAA > NC_000913/2679331‑2679524 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |