Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,549,792 | (C)6→5 | 100% | coding (279/2085 nt) | malQ ← | 4‑alpha‑glucanotransferase (amylomaltase) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,549,787 | 0 | C | . | 89.0% | 371.3 / 41.1 | 100 | coding (284/2085 nt) | malQ | 4‑alpha‑glucanotransferase (amylomaltase) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/9); new base . (52/37); total (54/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.12e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.53e-01 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTG > NC_000913/3549688‑3549882 | ggggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGc < 1:2269838/100‑1 (MQ=255) ggggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGc > 2:1352579/1‑100 (MQ=255) ggggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGc > 2:1986356/1‑100 (MQ=255) gggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGCTTGAACGCTTTGcc > 1:958672/1‑100 (MQ=255) gggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcc > 1:1414167/1‑100 (MQ=255) gggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCGGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcc < 1:2795200/100‑1 (MQ=255) ggCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGccc > 1:464699/1‑100 (MQ=255) gCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccc < 1:1035861/100‑1 (MQ=255) cGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGccccc > 1:2234635/1‑100 (MQ=255) cAATCACCCGGCAATGTGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccccgtt > 2:251678/1‑97 (MQ=255) cAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccccgtt < 1:2526503/100‑4 (MQ=255) cAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccccgtt > 2:937619/1‑97 (MQ=255) cAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccccgtt > 2:288069/1‑97 (MQ=255) cAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGt < 2:2476176/100‑1 (MQ=255) aaTCACCCGGCAATGCGCTCGCTGGTCGTCCTGTGTGAGTGCCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGcccccgtta < 1:151690/100‑5 (MQ=255) aaTCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGtt < 2:287744/100‑1 (MQ=255) aaTCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGGCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCTGTAGATTGAACGCTTTGcccccgtta < 1:151677/100‑5 (MQ=255) aCCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACAt < 1:2276712/99‑1 (MQ=255) aCCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATg > 1:928579/1‑100 (MQ=255) cccGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACAt > 1:738676/1‑98 (MQ=255) cGGCAATGCGCGCGCTGGTCGGCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGcc < 2:1139925/100‑1 (MQ=255) gCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCtt > 2:2685378/1‑100 (MQ=255) cAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCttt > 2:2747400/1‑100 (MQ=255) cAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCttt > 2:2910144/1‑100 (MQ=255) aTGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGt < 1:2068921/100‑1 (MQ=255) aTGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGt < 1:1802897/100‑1 (MQ=255) tGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTa < 2:2089622/100‑1 (MQ=255) gcgcgcgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTAc < 2:2326142/100‑1 (MQ=255) cgcgcgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACt < 1:1778269/100‑1 (MQ=255) cgcgcgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACt > 2:431057/1‑100 (MQ=255) cgcgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTg < 1:104858/100‑1 (MQ=255) cgcgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGc > 2:1813089/1‑100 (MQ=255) gcgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCg > 1:2223247/1‑100 (MQ=255) gcgcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGCCAGCGTGTGACAACCTTCCCGCAGCTTCGTCGGTAGATAGAACGCTTAG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTg < 1:2323688/98‑1 (MQ=255) gcTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGtt < 1:23935/100‑1 (MQ=255) cTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTc > 1:1565169/1‑100 (MQ=255) tGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTcc > 2:2220334/1‑100 (MQ=255) tGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTcc < 2:1695992/100‑1 (MQ=255) ggTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTTATATCCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGc < 1:633256/94‑1 (MQ=255) ggTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCct > 2:2403775/1‑100 (MQ=255) ggTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCct < 2:2363050/100‑1 (MQ=255) gtcgtcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCctt > 1:1660038/1‑100 (MQ=255) cgtcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCcttc < 2:1679831/100‑1 (MQ=255) gtcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCcttct < 1:491189/100‑1 (MQ=255) gtcCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCcttctt > 2:390007/1‑100 (MQ=255) ccTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCg > 1:1461405/1‑100 (MQ=255) ccTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCCTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCg > 1:1590345/1‑100 (MQ=255) cTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCgg < 1:1658797/100‑1 (MQ=255) cTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCgg > 2:462413/1‑100 (MQ=255) tGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggt > 2:883617/1‑100 (MQ=255) gggTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtg < 1:2632569/100‑1 (MQ=255) gggTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtg > 2:541731/1‑100 (MQ=255) ggTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtgg < 2:2094386/100‑1 (MQ=255) ggTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtgg < 2:1755692/100‑1 (MQ=255) gTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCATCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtgg < 1:1677876/99‑1 (MQ=255) gTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtgg < 2:2243082/100‑1 (MQ=255) gTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCggtggt > 2:2617645/1‑100 (MQ=255) tGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTc > 1:1514659/1‑100 (MQ=255) tGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTc < 2:871804/100‑1 (MQ=255) gcgtgtCAGCGTGTGAGACCCTTCCGGCAGCTTCTTCGCTTGAGTCAGCGCTGT‑CGCCGCGTTGCATGCCCTGTGTACTGCGCTCGTCCTTCggtgg < 1:2814691/95‑1 (MQ=255) gtgtCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTcagc < 2:1606216/100‑1 (MQ=255) gtCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTcagcag < 2:1853019/100‑1 (MQ=255) tCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCagcagc > 2:1802007/1‑100 (MQ=255) ctgggtgtCATGACTTTCCGTCAGCTTGGTCGGTAGTTTGAGCGGTTTG‑CCCGCTTGACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTca < 1:1069235/90‑1 (MQ=255) aGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGcagcca > 2:1943675/1‑100 (MQ=255) aGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGcagcca > 2:1681401/1‑100 (MQ=255) gCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGcagccag > 1:1111263/1‑100 (MQ=255) cGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGcagccagc < 2:1575/100‑1 (MQ=255) tgtgATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCta > 1:2141591/1‑100 (MQ=255) gtgATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCtat > 1:1251277/1‑100 (MQ=255) tgATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCtata < 2:1414172/100‑1 (MQ=255) tAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTc > 2:1041050/1‑100 (MQ=255) tAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTc > 1:1423134/1‑100 (MQ=255) aaCCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcg > 1:2167582/1‑100 (MQ=255) aCCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcgc > 1:357682/1‑100 (MQ=255) ccTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcgcc > 2:2567031/1‑100 (MQ=255) ccTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTcgcc > 2:2805489/1‑100 (MQ=255) ccGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTg < 2:67628/100‑1 (MQ=255) gCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGccc < 2:1991909/100‑1 (MQ=255) gCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGccc < 2:1271292/100‑1 (MQ=255) cAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGccc > 1:796747/1‑100 (MQ=255) gCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTcc > 2:2184650/1‑100 (MQ=255) gCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTcc > 1:2749183/1‑100 (MQ=255) cTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTcc > 1:2664996/1‑100 (MQ=255) ttCGTCGGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTccac > 2:1119505/1‑100 (MQ=255) cgtcgGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTccacca < 1:1329530/100‑1 (MQ=255) cgGTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTccaccacca > 2:2902815/1‑100 (MQ=255) gTAGATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATc < 2:2066523/100‑1 (MQ=255) aGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCg < 2:707639/100‑1 (MQ=255) aGATGGAGCGCTTTG‑TCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACTACCATCg < 1:1624309/99‑1 (MQ=255) gATTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGc < 2:419758/100‑1 (MQ=255) aTTGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCa > 2:867361/1‑100 (MQ=255) ttGAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCAt > 2:857246/1‑100 (MQ=255) gAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCAttt > 2:534845/1‑100 (MQ=255) gAACGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCAttt > 2:761788/1‑100 (MQ=255) cGCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCAtttttt < 2:1783010/100‑1 (MQ=255) gCTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCAttttttt < 2:1097526/100‑1 (MQ=255) cTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTg > 2:2000181/1‑100 (MQ=255) cTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTg > 2:797501/1‑100 (MQ=255) cTTTG‑CCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTg > 1:2258841/1‑100 (MQ=255) | GGGGCGACAATCACCCGGCAATGCGCGCGCTGGTCGTCCTGGGTGAGTGTCAGCGTGTGATAACCTTCCGGCAGCTTCGTCGGTAGATTGAACGCTTTGCCCCCCGTTACATGGCCTTTGTACTGCGTTCCTTCTTCGGTGGTCAGCAGCCAGCTATATTCGCCGCTGCCCTCCACCACCATCGGCATTTTTTTG > NC_000913/3549688‑3549882 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |