New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 228219 = | NA (NA) | 6 (0.060) | 4/166 | NT | NA | noncoding (2461/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
? | NC_000913 | 228248 = | NA (NA) | noncoding (2490/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/228323‑228219 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggtGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTTAG > NC_000913/228248‑228346 TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG < 1:928600/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 2:432652/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 1:1141164/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 2:1503734/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 2:1691684/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 1:125973/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 1:1409966/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 2:452857/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGACGTCGATATGAACTCTTGGG > 2:2842868/1‑100 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGCGCCGACATCGCGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC > 1:1598936/1‑100 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGTACTCTTGGGC > 1:1922241/1‑100 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 2:865342/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:2402071/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 1:544126/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:2524985/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:2098839/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 1:1119460/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:141604/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCCGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 2:239327/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAATCACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:62252/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:2099132/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:918246/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 2:1927209/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 2:2078728/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 1:2414281/1‑100 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT > 2:206250/1‑100 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT > 1:358565/1‑100 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT < 2:542063/100‑1 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT < 1:2361285/100‑1 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 1:777696/1‑99 CGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCTAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGTACTCTTCGGCGGT > 2:429778/1‑97 CAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTT > 1:4951/1‑100 AACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCG > 2:1035537/1‑100 AACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGACTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCG > 2:1363456/1‑100 CACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCTCCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCC > 1:1561360/1‑100 CCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGGTGAAGGAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCAT > 1:2106269/1‑100 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCTGCTCATCACATCCGGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 1:658606/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCCAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG > 2:852662/1‑100 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:1286876/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:882064/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:1594595/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG > 2:790095/1‑100 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:78191/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:387224/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG > 2:683896/1‑100 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:2033391/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:343163/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:2377566/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:579257/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:1246398/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 1:1146903/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:1004035/100‑1 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TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/228323‑228219 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggtGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTTAG > NC_000913/228248‑228346 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |