| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1396316 = | NA (NA) | 19 (0.200) | 9/164 | NT | 20.5% | noncoding (273/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1428549 | 80 (0.770) | noncoding (246/1196 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
CGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCG > NC_000913/1428452‑1428648 | cGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATgg > 2:1942375/1‑100 (MQ=255)cGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATgg < 1:2400568/100‑1 (MQ=255) gggCAAACAGGAGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGt > 2:532710/1‑100 (MQ=255) ggCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGtc < 1:535131/100‑1 (MQ=255) aaaCAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGGCGCTGAGGGGGTAGCAATGCTGCATGCAGTGAAGACGCAGCATGGTCTcc > 2:1586558/1‑100 (MQ=18) aGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCg < 2:915832/100‑1 (MQ=255) aTGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAgg < 1:210586/100‑1 (MQ=255) ggAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGc > 1:853678/1‑100 (MQ=255) gAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGcc > 1:49264/1‑100 (MQ=255) gAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGcc < 2:14647/100‑1 (MQ=255) aGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGCCTCCAGCGGATAGGGcc > 1:2227495/1‑99 (MQ=255) cGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCg > 1:1625828/1‑100 (MQ=255) ttgcGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGGATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGc < 1:1339535/96‑1 (MQ=255) gTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTg > 2:600594/1‑100 (MQ=255) aCAGGGCCTCTTCCATGGCACCGTCGCTGACGTTGTACCAAGGTTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGcc < 1:1436766/100‑1 (MQ=21) gggCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCg > 2:1209257/1‑99 (MQ=255) gggCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGc > 2:2630175/1‑100 (MQ=255) ggCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGcc > 2:2767357/1‑100 (MQ=255) ggCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGcc < 2:687645/100‑1 (MQ=255) tCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTgg < 1:977323/100‑1 (MQ=255) tCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTgg > 1:1270122/1‑100 (MQ=255) cTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTggg < 1:1226316/100‑1 (MQ=255) ttCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGa > 1:1000189/1‑100 (MQ=255) tCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGAt > 2:808891/1‑100 (MQ=255) aTGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATaaa > 2:1054849/1‑100 (MQ=255) gCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATg < 1:151567/100‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGa > 2:664304/1‑100 (MQ=255) cTCAGGTTGTACCAATGCTACACTCAATCAATATGCAGCATGGCCATCAGAGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCGTTGGGCTAAAAGGCCTCGATGa > 1:29475/1‑100 (MQ=16) tCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGAc < 2:1484689/100‑1 (MQ=255) gTTGTACCAATGCTGAATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGc > 1:2125714/1‑99 (MQ=255) gTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTc > 1:260441/1‑100 (MQ=255) aCCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgacatcgcctccatgcgtctgtttgc < 2:2554432‑M2/99‑69 (MQ=255) aCCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcc < 2:450474‑M2/100‑70 (MQ=255) ccAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATtggtacaacctgagcgacggtgccatggaagatgccctgtacgaaatcgcctccatgcgcctgtttgccc < 1:2264113‑M2/100‑71 (MQ=255) ccAATGCTGCATGCAGTGAAT‑‑GCAGCATtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccgg < 2:1875855‑M2/100‑73 (MQ=255) cAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATtggtacaacctgagcgacggtgccatggaagatgccctgtacgaaatcgcctccatgcgcctgtttgcccg < 1:1953656‑M2/100‑72 (MQ=255) aaTGCTGCATGCAGTGAAT‑‑GCAGCATtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggtt < 1:1671765‑M2/100‑75 (MQ=255) tgctgcATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCt > 1:471343/1‑100 (MQ=255) tgctgcATGCAGTGAATACGAAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCt > 1:1778667/1‑100 (MQ=255) gctgcATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATAACAGCGGTCATATTCTg < 2:2818337/100‑1 (MQ=255) tgcatgcaGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGcc < 2:2157807/100‑1 (MQ=255) gcatgcaGTGAAT‑‑GCAGCATtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccct < 1:2519911‑M2/100‑81 (MQ=255) tgcaGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATgg < 2:12481/100‑1 (MQ=255) aGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAg < 1:2799191/100‑1 (MQ=255) gTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCCTGGCAg > 1:1924852/1‑99 (MQ=255) gTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGa < 1:565840/100‑1 (MQ=255) aaTACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAAta < 2:74682/100‑2 (MQ=255) aaTACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAAta < 2:973278/100‑2 (MQ=255) aaTACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATc > 1:518050/1‑100 (MQ=255) aaTACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATc < 1:2765976/100‑1 (MQ=255) aaTACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATc < 1:2347219/100‑1 (MQ=255) aTACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAAtat < 2:434608/100‑3 (MQ=255) atctagcattggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgcct > 1:2178233‑M2/5‑9 (MQ=255) aCGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATATg < 1:447632/99‑1 (MQ=255) cGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCt > 2:1308262/1‑100 (MQ=255) gcagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttg > 2:636273‑M2/1‑7 (MQ=255) gcagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttg < 2:2813990‑M2/100‑94 (MQ=255) gcagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttg < 2:1603694‑M2/100‑94 (MQ=255) gcagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttg > 1:1126062‑M2/1‑7 (MQ=255) gcagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttg < 1:1602716‑M2/100‑94 (MQ=255) gcagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttg > 1:349954‑M2/1‑7 (MQ=255) gcagcaTGGTCTCCATCGCATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTACATGACAGCGGTCAGTTTCTGTCCTGGCAGAATATgtcc < 1:2881973/100‑4 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 2:1727003‑M2/100‑95 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc > 1:1719946‑M2/1‑6 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 2:645796‑M2/100‑95 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 2:1348184‑M2/100‑95 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 1:2155101‑M2/100‑95 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 1:395004‑M2/100‑95 (MQ=255) cagcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc < 1:91480‑M2/100‑95 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc > 1:2093081‑M2/1‑5 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc > 1:787869‑M2/1‑5 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc > 2:2901832‑M2/1‑5 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc > 2:2312445‑M2/1‑5 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgcctagat < 1:1034634‑M2/100‑96 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgcctagat < 2:2178246‑M2/100‑96 (MQ=255) agcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccaggcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgc > 1:1795282‑M2/1‑5 (MQ=255) agcaTtgggacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgcc > 1:1209350‑M2/1‑5 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg < 1:2028990‑M2/100‑97 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg < 2:2424076‑M2/100‑97 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg < 2:2526924‑M2/100‑97 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg > 2:1388618‑M2/1‑4 (MQ=255) gcaTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccg < 2:1290853‑M2/100‑97 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg < 1:2548877‑M2/100‑98 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg < 1:2329945‑M2/100‑98 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg < 1:221838‑M2/100‑98 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg > 2:1026287‑M2/1‑3 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg < 2:1033388‑M2/100‑98 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg > 2:23217‑M2/1‑3 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg > 2:2033739‑M2/1‑3 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg < 2:2277600‑M2/100‑98 (MQ=255) caTtggtacaacctgagcgatgacgcgatgggagatggtctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg > 1:1963915‑M2/1‑3 (MQ=255) caTGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCAGATTCTGCCATGGCAGAAtatgaccgctg < 2:225365/100‑11 (MQ=37) aTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgga < 2:42599‑M2/100‑99 (MQ=255) aTtggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgga < 2:1082537‑M2/100‑99 (MQ=255) ttggtacaaccttagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgctggac > 1:639837‑M2/1‑1 (MQ=255) ttggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccggac > 1:2679474‑M2/1‑1 (MQ=255) ttggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccggac > 1:622591‑M2/1‑1 (MQ=255) ttggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccggac < 1:734802‑M2/100‑100 (MQ=255) ttggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccggac > 1:1175111‑M2/1‑1 (MQ=255) ttggtacaacctgagcgatggcgcgatggaagatgctctgtacgaaatcgcctccatgcgtctgtttgcccggttatccctggatagcgccttgccgg < 1:2554161‑M2/98‑98 (MQ=255) | CGGGCAAACAGGCGCATGGAGGCGATTTCGTACAGGGCATCTTCCATGGCACCGTCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATACGCAGCATGGTCTCCAGCGGATAGGGCCGTCGGCCATTGCCCGCCTTGGGATAAAACGGCTCGATGACAGCGGTCATATTCTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCG > NC_000913/1428452‑1428648 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |