| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2304816 | 104 (1.000) | 19 (0.200) | 9/164 | NT | 18.2% | noncoding (400/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 2304834 | 75 (0.780) | noncoding (418/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC > NC_000913/2304735‑2304909 | cGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCtt < 2:2123156/100‑1 (MQ=255)cGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGCTGCGACGCTGGCGCGTCtt > 2:1695772/1‑100 (MQ=12)cGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCtt < 1:1762833/100‑1 (MQ=255) gCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTa > 2:2278294‑M2/1‑99 (MQ=255) tgtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatc > 2:1243537‑M2/1‑97 (MQ=255) tgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGGTGCGACGCTGGCGCGTCTTat < 1:924436‑M2/97‑3 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTctcaggc < 2:1742407‑M2/100‑8 (MQ=255) tgtGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcagg > 1:1239272‑M2/2‑92 (MQ=255) aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcagc < 1:2797974‑M2/98‑7 (MQ=255) aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGcc < 2:344063/100‑1 (MQ=255) gTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggc > 1:1633024‑M2/1‑91 (MQ=255) gcgccACCCCGTAGGTTAGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTac < 2:1338635/97‑1 (MQ=255) gCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTac < 2:2845668/100‑1 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTattgtggcgcca < 1:2886891‑M2/100‑13 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTaca > 2:2852022/1‑100 (MQ=255) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTaca > 1:1445363/1‑100 (MQ=255) cccccccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAcc < 2:1339628/97‑1 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAcc > 1:988361/1‑100 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAcc > 2:1159839/1‑100 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAcc > 2:691201/1‑100 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAcc > 2:1135745/1‑100 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAcc > 2:2137319/1‑100 (MQ=255) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCg > 1:2769367/1‑100 (MQ=255) aCCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGc > 2:2153889/1‑100 (MQ=255) ccccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTacac < 1:2663311/96‑1 (MQ=255) cccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtg < 1:2218356/100‑1 (MQ=255) cccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtg < 1:1839909/100‑1 (MQ=255) cccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGCCTTATCAGGCCtccccacctc > 1:436231/1‑91 (MQ=11) cccGTAGGTTGGATAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtg < 1:2244800/100‑1 (MQ=12) gTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAAAGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGa < 2:825739/100‑1 (MQ=255) gTAGGTTGGATAAGGCCGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGa < 2:114894/100‑1 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg < 2:813148/100‑1 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:384453/100‑1 (MQ=255) ggTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCTTAGACCGCTCGGAAg > 1:2280703/1‑99 (MQ=14) ggTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg > 2:2685016/1‑99 (MQ=255) ggTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCGTACGCCGGTGCGACGt > 1:388236/1‑100 (MQ=14) ggTTGGACACGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCCAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGa < 1:2641098/97‑1 (MQ=255) gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTg > 2:633356/1‑100 (MQ=255) gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTg < 1:1777692/100‑1 (MQ=255) gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCCTCGACCGCtgcg > 1:40680/1‑93 (MQ=17) tGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt < 2:507160/100‑1 (MQ=255) tGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt < 2:2479746/100‑1 (MQ=255) tGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGATGGAGCGTCTTATCAGGCGTACACCGCTGTGAAGt > 1:1267367/1‑97 (MQ=255) gATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTcc < 2:2432858/100‑1 (MQ=40) gATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGCGAAGTGCTcc > 1:1521268/1‑100 (MQ=255) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc > 2:1472612/1‑100 (MQ=38) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 2:2385303/100‑1 (MQ=35) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:2153876/100‑1 (MQ=38) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc > 2:633908/1‑100 (MQ=38) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAc < 2:2271616/98‑1 (MQ=35) gCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCg < 2:146543/100‑1 (MQ=35) cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt > 2:2777012/1‑100 (MQ=38) cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt < 2:1451735/100‑1 (MQ=38) cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGACTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc > 1:764779/1‑97 (MQ=25) cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAACAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc > 2:2195599/1‑98 (MQ=25) ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 1:450649/100‑1 (MQ=35) ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa > 2:1589119/1‑100 (MQ=38) ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTACCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 2:1303444/100‑1 (MQ=38) tACGCGGCATCTGAAATCTAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGTGTGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAgg < 1:1663559/99‑1 (MQ=11) cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGACGTGCTCCACCCCGTAGGTCg > 2:1423555/1‑100 (MQ=18) gccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGCTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTCCACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCgg < 1:1753932/100‑1 (MQ=12) ccgatctcGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa < 1:2843647/93‑1 (MQ=255) cgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGAt < 2:1414183/100‑1 (MQ=33) cgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGACATATCAAGCCCACACCGCTGTGAAATACTCCACCCCGTAggagagat > 1:398412/1‑94 (MQ=11) gcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATa < 2:1493591/100‑1 (MQ=33) gcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATa > 2:2572796/1‑100 (MQ=33) ccGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 2:1682564/100‑1 (MQ=32) cGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGaagatcgg > 2:2843666/1‑93 (MQ=255) gACATCCACCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:101925/100‑1 (MQ=17) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 2:752467/100‑1 (MQ=32) acgtcgcaCGTCCGAGCTGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCg < 1:2626249/91‑1 (MQ=11) cATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 2:804831/100‑1 (MQ=32) cATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 2:877288/100‑1 (MQ=33) aTCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 2:2692793/1‑99 (MQ=32) tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTa > 1:1153387/1‑99 (MQ=32) ccAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcggacgttggatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccaac < 2:1399190‑M2/100‑58 (MQ=255) ccAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcg < 2:1800711/100‑1 (MQ=32) cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCTTCCACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTATGTCGGATCAGGCCGTTAcgc > 1:511521/1‑100 (MQ=11) cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:626504/1‑100 (MQ=33) cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:1316006/1‑100 (MQ=33) cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCCTACACCCCTGCGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGTATCAGGCCGTCAc > 1:2416677/1‑98 (MQ=11) aCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccg < 2:2899923/100‑1 (MQ=32) tCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAt > 2:1376638/1‑100 (MQ=11) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtcaccgccttatccgacctacggg < 1:2356417‑M2/95‑65 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggag < 2:2458742‑M2/100‑71 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggag < 2:2384014‑M2/100‑71 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGACTTatcaggcaaccggctcggacgttggatgtcggatgcggcgcaaacgccctatctaacccc < 1:57263‑M2/90‑61 (MQ=255) cGGTTGCATGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggag < 2:1530467‑M2/100‑71 (MQ=255) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagc < 2:2507685‑M2/100‑72 (MQ=255) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgc < 1:1170385‑M2/100‑72 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagca < 2:18375‑M2/100‑73 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggggga < 1:2088908‑M2/97‑70 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcgggcgttagatgttggatgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagca < 2:1059037‑M2/100‑73 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttctccgacctacggg < 1:64673‑M2/92‑65 (MQ=255) ttGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcac < 2:374061‑M2/100‑74 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcactt < 2:236482‑M2/100‑76 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcactt < 1:1815511‑M2/100‑76 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacgggggggagcactt < 1:1507064‑M2/100‑76 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcggacgttggatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggcgcactt < 2:89708‑M2/100‑76 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcact < 1:700942‑M2/97‑75 (MQ=255) | CGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAC > NC_000913/2304735‑2304909 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |