| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3621534 | NA (NA) | 7 (0.070) | 4/162 | NT | 100% | coding (2343/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3621592 | 0 (0.000) | coding (2401/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCA > NC_000913/3621493‑3621691 | cagcaTGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTT > 2:2593298‑M2/1‑100 (MQ=255)cagcaTGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTT < 1:1961120‑M2/100‑1 (MQ=255) gCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatg < 1:358100‑M2/100‑40 (MQ=255) cGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgc < 1:878856‑M2/100‑41 (MQ=255) cGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgc < 2:377119‑M2/100‑41 (MQ=255) cGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgc < 1:1136958‑M2/100‑41 (MQ=255) aaCCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctg < 2:1163354‑M2/100‑43 (MQ=255) aaCCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTAGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGGTcgccagcacccgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctg < 1:1277201‑M2/100‑43 (MQ=255) aCCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgc < 1:891946‑M2/100‑44 (MQ=255) tactgcggtTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcacc > 1:664289‑M2/5‑10 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg < 2:2168775‑M2/100‑93 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg < 2:1184788‑M2/100‑93 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg < 1:2161060‑M2/100‑93 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg < 1:2352897‑M2/100‑93 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg < 1:1047194‑M2/100‑93 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccg < 1:1583022‑M2/99‑92 (MQ=255) cAGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcaatgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccgg < 2:1429031‑M2/100‑93 (MQ=255) aGCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccg < 1:2033838‑M2/98‑92 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgggcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtc > 1:1185806‑M2/1‑6 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtc < 1:2661737‑M2/100‑95 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtc > 2:2394419‑M2/1‑6 (MQ=255) gCGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctcccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtc > 1:1254660‑M2/1‑6 (MQ=255) cGGTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtca < 2:2543203‑M2/100‑96 (MQ=255) ggTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcag < 2:1903887‑M2/100‑97 (MQ=255) ggTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcag < 1:1203444‑M2/100‑97 (MQ=255) ggTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcag > 2:1015933‑M2/1‑4 (MQ=255) ggTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcag < 2:2493815‑M2/100‑97 (MQ=255) ggTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcag < 1:1809619‑M2/100‑97 (MQ=255) gTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagc > 2:1182905‑M2/1‑3 (MQ=255) gTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagc > 2:2352912‑M2/1‑3 (MQ=255) gTTcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcag < 1:2399156‑M2/99‑97 (MQ=255) tcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccg > 2:2385056‑M2/1‑1 (MQ=255) tcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccg < 1:2534248‑M2/100‑100 (MQ=255) tcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccg > 2:2647527‑M2/1‑1 (MQ=255) | CAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCA > NC_000913/3621493‑3621691 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |