| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,298,809 | A→G | 82.7% | V13A (GTG→GCG) | yraR ← | putative nucleoside‑diphosphate‑sugar epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,298,809 | 0 | A | G | 82.7% | 283.8 / 36.1 | 118 | V13A (GTG→GCG) | yraR | putative nucleoside‑diphosphate‑sugar epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (11/10); new base G (48/49); total (59/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAA > NC_000913/3298715‑3298904 | cacCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGc > 1:1331754/1‑100 (MQ=255) acCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGcc < 1:818289/100‑1 (MQ=255) cccGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCGGGTGACCGCCCACCAGcccc < 1:1784868/100‑1 (MQ=255) ccGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCg < 2:449898/100‑1 (MQ=255) ccGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCg > 2:814322/1‑100 (MQ=255) gggCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGtt > 2:1824626/1‑100 (MQ=255) ggCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTg < 2:1725111/100‑1 (MQ=255) cATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTgcg < 1:1038725/100‑1 (MQ=255) tatCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGcc < 1:1118860/100‑1 (MQ=255) tatCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGcc < 2:770866/100‑1 (MQ=255) tatCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAACAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGcc < 1:1108062/100‑1 (MQ=255) gatctcccAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGcc < 2:2067948/95‑1 (MQ=255) atCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCt > 1:2029483/1‑100 (MQ=255) cGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGt > 1:2807301/1‑100 (MQ=255) cGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAAACAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCCGt > 2:112021/1‑100 (MQ=255) gCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTa > 1:2486345/1‑100 (MQ=255) cccAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGccagatc > 1:2067936/1‑95 (MQ=255) cAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCCGCCCCGTTGCGCCGGTAATc > 1:1603894/1‑100 (MQ=255) cAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATc < 1:1636089/100‑1 (MQ=255) cAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATc < 1:1255240/100‑1 (MQ=255) cAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATc > 2:2475606/1‑100 (MQ=255) cAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCAGTTGAGCCTGTAATc > 1:2602176/1‑100 (MQ=255) aaCGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCa < 2:1041167/100‑1 (MQ=255) aaCGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCa > 2:1195672/1‑100 (MQ=255) aCGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAg > 1:783389/1‑100 (MQ=255) aCGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAg < 2:81265/100‑1 (MQ=255) cGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGt < 1:2739627/100‑1 (MQ=255) gACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTAc > 1:150485/1‑100 (MQ=255) aCGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTAcc < 2:221166/100‑1 (MQ=255) aCGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTAcc < 2:2101616/100‑1 (MQ=255) aCGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTAcc > 2:2040851/1‑100 (MQ=255) gtcgcgtcgGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTg > 1:515664/1‑100 (MQ=255) cttccgatctcagcaATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGAc < 1:260384/90‑1 (MQ=255) gcgtcgGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACt < 2:1490165/100‑1 (MQ=255) cgtcgGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTc < 2:2438099/100‑1 (MQ=255) ggCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCt < 2:1996006/100‑1 (MQ=255) ggCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTCGCGCCTGTAATCAGTACCTGACCCATCt > 1:494510/1‑100 (MQ=255) cgcAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTc > 1:1840708/1‑100 (MQ=255) cgcAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTc > 2:1996958/1‑100 (MQ=255) cgcAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTc < 2:2325613/100‑1 (MQ=255) gcagcaATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCg < 1:604208/100‑1 (MQ=255) gcagcaATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCg > 1:2244336/1‑100 (MQ=255) cagcaATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGAcagatcggaag > 2:260385/1‑90 (MQ=255) cagcaATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGc < 1:2793608/100‑1 (MQ=255) cagcaATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGc < 2:559133/100‑1 (MQ=255) cagcaATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGc < 2:2843700/100‑1 (MQ=255) cagcaATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGc < 1:636763/100‑1 (MQ=255) agcaATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCt > 2:1136692/1‑100 (MQ=255) caATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTcc < 2:2533719/100‑1 (MQ=255) caATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTcc < 2:956419/100‑1 (MQ=255) caATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTcc < 2:2134853/100‑1 (MQ=255) aTGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCtt > 2:1184491/1‑100 (MQ=255) gCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTAc < 2:521182/100‑1 (MQ=255) cGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGCCTCATCTTCGCTCCttt > 1:779738/1‑97 (MQ=255) gTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAg < 2:1670507/100‑1 (MQ=255) gTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAg < 2:2639220/100‑1 (MQ=255) ttAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCCCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAg < 1:2040840/99‑1 (MQ=255) cTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTg > 2:347074/1‑100 (MQ=255) cTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTg > 1:2888815/1‑100 (MQ=255) cGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGTGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCt > 1:500385/1‑99 (MQ=255) cGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTg < 1:1053720/100‑1 (MQ=255) gTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAAAATTGTCTGcc > 2:1345793/1‑100 (MQ=255) tCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCtt < 1:1369635/100‑1 (MQ=255) tCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCCGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCtt < 1:2759855/100‑1 (MQ=255) gTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTgc < 1:1837263/100‑1 (MQ=255) gTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTgc < 1:1820432/100‑1 (MQ=255) gTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTgc > 1:1808332/1‑100 (MQ=255) tAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTgcgc > 1:1333356/1‑100 (MQ=255) tAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTgcgc > 2:1050115/1‑100 (MQ=255) tAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTgcgc > 1:1222924/1‑100 (MQ=255) aaCATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCAc < 1:834959/100‑1 (MQ=255) aaCATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCAc > 1:572172/1‑100 (MQ=255) aaCATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCAc < 1:1391779/100‑1 (MQ=255) aaCATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCAc < 1:1925401/100‑1 (MQ=255) aCATCCGCAGCAGGTGACCGGCCGCCAGCCCCGTTGCGACTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTAGAGAATTGTCTGGCTTGCGCTCGACg > 1:1984546/1‑100 (MQ=255) cATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCTGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACgg > 2:2670112/1‑100 (MQ=255) cATCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACgg > 1:974939/1‑100 (MQ=255) aTCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGc > 1:2282805/1‑100 (MQ=255) aTCCGCAGCAAGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGc > 2:2806318/1‑100 (MQ=255) tCCGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCt < 2:2150380/100‑1 (MQ=255) ccGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTc < 1:805852/100‑1 (MQ=255) ccGCAGCAGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTc < 2:2528398/100‑1 (MQ=255) gcagcaGGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCAt > 1:1460156/1‑100 (MQ=255) agcagGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGc > 1:2251279/1‑100 (MQ=255) agcagGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGc < 1:638074/100‑1 (MQ=255) agcagGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGc < 2:2891996/100‑1 (MQ=255) gcagGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGGCTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGGCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCa < 2:1052731/100‑1 (MQ=255) cagGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCAc < 2:294283/100‑1 (MQ=255) cagGTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCAc < 2:2029494/100‑1 (MQ=255) agGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCAc > 1:2141926/1‑99 (MQ=255) ggTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCa > 2:2908299/1‑100 (MQ=255) ggTGACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCa > 2:170087/1‑100 (MQ=255) ggTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCa > 1:2631814/1‑100 (MQ=255) gACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGc < 1:2394041/100‑1 (MQ=255) gACCGCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGc < 1:170086/100‑1 (MQ=255) ccgcccgcCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCtt > 2:1570005/1‑100 (MQ=255) ccgcccgcCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCtt > 2:1480034/1‑100 (MQ=255) ccgcccgcCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCtt > 2:137362/1‑100 (MQ=255) cgcccgccAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGCCTCATGTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTa < 1:1861779/100‑1 (MQ=255) gCCCGCCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTaa > 1:705567/1‑100 (MQ=255) | CACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACCAGGCTTAA > NC_000913/3298715‑3298904 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |