| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,468,389 | T→C | 15.9% | S489G (AGT→GGT) | chiA ← | periplasmic endochitinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,468,389 | 0 | T | C | 15.9% | 297.8 / 51.4 | 139 | S489G (AGT→GGT) | chiA | periplasmic endochitinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (60/57); new base C (12/10); total (72/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.13e-01 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GCTCTTCGTTGCTATAGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGCCGGTTCGTA > NC_000913/3468290‑3468488 | gCTCTTCGTTGCTATAGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACt > 2:2441969/1‑100 (MQ=255) ctTCGTTGCTATAGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCCCGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGCTTCGCCACCAGCGCAGGGTTGTCACttt > 1:1188071/1‑99 (MQ=255) ctTCGTTGCTATAGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTg < 2:604852/100‑1 (MQ=255) ctTCGTTGCTATAGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTg < 2:1841489/100‑1 (MQ=255) tCGTTGCTATAGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCg < 2:1909646/100‑1 (MQ=255) ttGCTATAGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTGCGTcc < 2:2230477/100‑1 (MQ=255) tgggcaggcttatgaagcgctgttctggacgcaaagtgacaacccTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCa > 1:254511‑M1/46‑100 (MQ=255) tGCTATAGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCa < 1:2878113/100‑1 (MQ=255) cTATAGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGa < 2:1032921/100‑1 (MQ=255) tataGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGaa > 1:2825617/1‑100 (MQ=255) ataGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAAc < 2:414146/100‑1 (MQ=255) gCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAgc > 2:1552459/1‑100 (MQ=255) gCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAgc < 1:2484660/100‑1 (MQ=255) gCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAgc > 1:1610608/1‑100 (MQ=255) gCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGCTTCGCCCCCCGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAgc > 2:2514843/1‑100 (MQ=255) tGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTCGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCtt < 2:1215405/100‑1 (MQ=255) aGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCa < 1:1083233/100‑1 (MQ=255) gCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCAt > 2:1664488/1‑100 (MQ=255) ccTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATa < 2:1084114/100‑1 (MQ=255) cTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATaa < 1:1627095/100‑1 (MQ=255) tACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGc > 2:1223831/1‑100 (MQ=255) ccTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCt > 2:2719254/1‑100 (MQ=255) cTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTg > 2:1745484/1‑100 (MQ=255) tAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGc > 2:2462357/1‑100 (MQ=255) aaCGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGcc < 2:1856357/100‑1 (MQ=255) tggacgcaaagtgacaaccctgctctggtggcgaaccaaaacgccaccggtagcaGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCa > 1:254511‑M2/56‑100 (MQ=255) cGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCa < 2:1389531/100‑1 (MQ=255) gCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATc < 2:1342418/100‑1 (MQ=255) gCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATc < 1:1279207/100‑1 (MQ=255) cTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATca < 1:486895/100‑1 (MQ=255) cTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATca < 2:1523754/100‑1 (MQ=255) tCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATcaac < 1:2176966/100‑1 (MQ=255) tCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATcaac < 1:2557741/100‑1 (MQ=255) cACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATcaacaa > 2:1732778/1‑100 (MQ=255) aCGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATcaacaac < 2:2904081/100‑1 (MQ=255) cGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATcaacaaca > 2:1906492/1‑100 (MQ=255) gcggcTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAAcg > 2:2793137/1‑100 (MQ=255) cggcTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAAcgc > 1:855100/1‑100 (MQ=255) gcTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTACGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGa > 1:647632/1‑100 (MQ=255) cTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGAt > 1:1762792/1‑100 (MQ=255) tATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATc > 1:1279329/1‑100 (MQ=255) cctgctctggtggcgaaccaaaacgccaccggtagcaGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCa > 2:539400‑M2/38‑100 (MQ=255) ttGCTACCGGTGTCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCa < 1:179753/99‑1 (MQ=255) ctgctctggtggcgaaccaaaacgccaccggtagcaGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCAc > 2:592208‑M2/37‑100 (MQ=255) tgctctggtggcgaaccaaaacgccaccggagcaGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCt > 1:1333574‑M2/35‑100 (MQ=255) gctctggtggcgaaccaaaacgcaaccggtagcaGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCACATCAACAACAACGCGATCACCt > 1:708701‑M2/35‑100 (MQ=255) CTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCtt < 1:156026‑M1/100‑1 (MQ=255) tctggtggcgaaccaaaacgccaccggtagcaGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCttt > 1:452134‑M2/33‑100 (MQ=255) agcGGTGGCGTTTTGCTTCGCCACCAGTGCAGGGTTGTCGCTTTGCGTCCAGACCAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCtt < 1:2890614/96‑1 (MQ=255) aCCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTc > 1:955840/1‑100 (MQ=255) ctggtggcgaaccaaaacgccaccagagcaGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCttt > 2:2818519‑M2/31‑98 (MQ=255) ctggtggcgaaccaaaacgccaccagagcaGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCa > 2:2890538‑M2/31‑100 (MQ=255) ccGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCa < 1:78376/100‑1 (MQ=255) cGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCAc > 1:196025/1‑100 (MQ=255) ggTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACg < 2:2564378/100‑1 (MQ=255) gtggcgaaccaaaacgccaccagagcaGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACCACAACGCGATCACCTTTCACGt > 1:1165482‑M2/28‑100 (MQ=255) ggCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTac > 2:1010343/1‑100 (MQ=255) ggCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTac < 2:782102/100‑1 (MQ=255) gCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTaca < 2:2900100/100‑1 (MQ=255) cGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTacac > 2:701254/1‑100 (MQ=255) gTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTAcaca > 2:629892/1‑100 (MQ=255) gTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTAcaca < 2:742345/100‑1 (MQ=255) ttttGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAg < 1:2006506/100‑1 (MQ=255) tttGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGt > 2:441304/1‑100 (MQ=255) tttGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCAAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGt > 2:2226209/1‑100 (MQ=255) ttGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTg < 1:1001776/100‑1 (MQ=255) ttGGTCCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTTCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTg < 1:1730425/100‑1 (MQ=255) gTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATACGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGAt > 1:1691143/1‑100 (MQ=255) gTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGAt < 2:2071217/100‑1 (MQ=255) gTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGAt > 2:200036/1‑100 (MQ=255) tCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGc > 2:2563544/1‑100 (MQ=255) tCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGc < 1:1410247/100‑1 (MQ=255) cGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGCACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAAAGCGATCACCTTTCACGTACCCAGTGGATGc > 1:1177506/1‑99 (MQ=255) cGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCg < 1:2004135/100‑1 (MQ=255) nccaccaGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCgg > 2:888092/2‑100 (MQ=255) ccaccaGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCgg < 1:2147366/99‑1 (MQ=255) ccaccaGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGa < 1:563387/100‑1 (MQ=255) ccaccaGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGa < 1:2718015/100‑1 (MQ=255) ccaccaGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGa < 2:1130844/100‑1 (MQ=255) ccaccaGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGa > 2:270536/1‑100 (MQ=255) ccaccaGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGa > 1:2472455/1‑100 (MQ=255) cggtagcaGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCa < 1:592205‑M2/92‑1 (MQ=255) ccaGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCa > 1:1068856/1‑100 (MQ=255) caGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCCGAACAGCGCTTCATAAGCCTGACCATCAACAACACCGCGATCACCTTTGACGTACACAGTGGATGCGGACCAt > 1:1033210/1‑100 (MQ=255) agagCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATg > 2:1046721/1‑100 (MQ=255) agagCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATg > 2:104201/1‑100 (MQ=255) gcaGGGTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCtt > 1:820937‑M2/4‑100 (MQ=255) gggTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCTATCAACCACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCg > 1:40761/1‑100 (MQ=255) gggTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGCATGCGGACCATGCTTTc > 1:1412228/1‑99 (MQ=255) gggTTGTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCg > 2:196245/1‑100 (MQ=255) gTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGcc < 2:1925364/100‑1 (MQ=255) tGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGCCgg > 2:1620957/1‑100 (MQ=255) gTCACCTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGCCGGt < 2:68069/100‑1 (MQ=255) tCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGCCGGtt < 1:801111/100‑1 (MQ=255) tCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGCCGGtt > 1:1487040/1‑100 (MQ=255) cACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGCCGGTTc > 2:1668816/1‑100 (MQ=255) aCTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGCCGGTTCg < 1:1828543/100‑1 (MQ=255) cTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGCCGGTTCGt > 2:1358585/1‑100 (MQ=255) cTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGCCGGTTCGt < 2:1123186/100‑1 (MQ=255) tttGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCTCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGCCGGTTCGTa < 2:196026/100‑1 (MQ=255) | GCTCTTCGTTGCTATAGCTCTGAGCCTTACCTAACGGCTTCCACGGGCGGCTATTGCTACCGGTGGCGTTTTGGTTCGCCACCAGAGCAGGGTTGTCACTTTGCGTCCAGAACAGCGCTTCATAAGCCTGCCCATCAACAACAACGCGATCACCTTTCACGTACACAGTGGATGCGGACCATGCTTTCGCCGGTTCGTA > NC_000913/3468290‑3468488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |