| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,130,008 | T→C | 15.0% | I58I (ATT→ATC) | metL → | Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,130,008 | 0 | T | C | 15.0% | 272.7 / 40.7 | 121 | I58I (ATT→ATC) | metL | Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (52/49); new base C (10/8); total (63/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.11e-01 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GAAGTGTTATTTGCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTCTGCTACCC > NC_000913/4129909‑4130107 | gtTATTTGCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTg > 1:1941900/1‑100 (MQ=255) ttATTTGCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTgg < 2:2291121/100‑1 (MQ=255) ttATTTGCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTgg < 1:1180579/100‑1 (MQ=255) ttATTTGCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTgg < 2:2452536/100‑1 (MQ=255) aTTTGCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGtt < 1:642856/100‑1 (MQ=255) aTTTGCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTAATCAACTGGtt < 2:1639963/100‑1 (MQ=255) tttGCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTA‑‑CTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTAATCAACTGGttagt < 1:1219948/100‑4 (MQ=255) tgtGCGGGGCGCGGGCATTATGGCGGAGTGCTCTCAGCCTGACGATATGAGGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTg < 1:2296817/98‑1 (MQ=255) ttGCGTGTCGCGGGCAGTATGGCGTAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTAATCAACTGGttag < 1:2560776/100‑3 (MQ=255) tGCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTAATCAACTGGttagt < 1:2075802/100‑4 (MQ=255) tGCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTAATCAACTGGttagt < 1:1047065/100‑4 (MQ=255) gCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTCACCAGTTGATTACCTGGTTGaaa > 2:2728486/1‑100 (MQ=255) cGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAAc < 1:1431625/100‑1 (MQ=255) cGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAAc > 2:345389/1‑100 (MQ=255) cGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTAATCAACTGGttagtgg < 1:1883893/100‑6 (MQ=255) cGTGCCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATTATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTgg < 1:697038/93‑1 (MQ=255) gtgtCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACt < 1:518765/100‑1 (MQ=255) tgtCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTa > 2:1660973/1‑100 (MQ=255) gtCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTaa > 1:1180068/1‑100 (MQ=255) cgcgGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGc > 2:1730672/1‑100 (MQ=255) gcgGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACTAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGcc > 2:769979/1‑100 (MQ=255) cgGGCATTATGGCGGAGTACTCGTAGCCTGACGATATGAGGGTGGTTTCCGCC‑TCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGcc < 2:2079993/99‑1 (MQ=255) cATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGAcc > 2:1331355/1‑100 (MQ=255) tttGGCGGGGTACTTTTCGGCTGTCGGTATGATGGTGGTTTTCGGCGGCCGTTAG‑ACCCCTAACCAGTTGATTTAATGGTTGAAACTAAGGCCAACC‑GAt > 1:2489336/3‑100 (MQ=255) aTGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATc > 2:268449/1‑100 (MQ=255) gCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGtc > 1:1056505/1‑100 (MQ=255) cGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGtct > 2:943141/1‑100 (MQ=255) cGGAGTACTCTCAGCCTCACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGtct > 1:1097265/1‑100 (MQ=255) aGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGtctctc < 2:1205743/100‑1 (MQ=255) tACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTg < 2:1414794/100‑1 (MQ=255) ctctCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACCAGATCggaagagcac > 2:867910/1‑91 (MQ=255) ctcAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGCCC‑GATCGTCTCTCTGCGCa > 1:2476346/1‑100 (MQ=255) ctcAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCa < 1:2807761/100‑1 (MQ=255) cAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATc < 1:1984400/100‑1 (MQ=255) cAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATc > 2:48998/1‑100 (MQ=255) aGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCa < 2:1596924/100‑1 (MQ=255) aGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCa < 1:91409/100‑1 (MQ=255) gCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTCACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTCCGCACCAg > 1:2196905/1‑100 (MQ=255) gCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAATCTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAg < 1:1015051/100‑1 (MQ=255) cTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGt < 1:302630/100‑1 (MQ=255) cTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGt < 1:83995/100‑1 (MQ=255) cTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGt > 2:1190707/1‑100 (MQ=255) aCGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTca < 1:1581691/100‑1 (MQ=255) gATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTcaac > 2:2268918/1‑100 (MQ=255) tgatgGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAAc < 2:2451/100‑1 (MQ=255) atgGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGc < 1:2316757/100‑1 (MQ=255) ggtggtTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTg < 2:462539/100‑1 (MQ=255) ggtggtTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTg > 2:2391320/1‑100 (MQ=255) gtggtTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACACACGCTGc > 1:2645273/1‑100 (MQ=255) gtggtTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGc < 2:2628058/100‑1 (MQ=255) gtggtTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGc > 2:107281/1‑100 (MQ=255) gtTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTc > 1:649381/1‑100 (MQ=255) gtTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTc > 2:1945973/1‑100 (MQ=255) tttCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCg < 2:829260/100‑1 (MQ=255) ttCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGc < 1:2407401/100‑1 (MQ=255) ttCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGCCGATTAACTGGTTGAAACTACGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGAGTc > 1:2783744/1‑98 (MQ=255) tCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGc < 2:858785/99‑1 (MQ=255) ccgcc‑gccgGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTa > 2:1460990/1‑100 (MQ=255) ccgcc‑gccgGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTa > 1:1349280/1‑100 (MQ=255) ccgcc‑gccgGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTa > 2:782046/1‑100 (MQ=255) ccgcc‑gccgGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTa > 2:2721689/1‑100 (MQ=255) cgcc‑gccgGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTAt > 2:1693720/1‑100 (MQ=255) cgcc‑gccgGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTAt > 1:933411/1‑100 (MQ=255) 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cgGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGc > 2:1031392/1‑100 (MQ=255) ggTAGCACCACTAACCAGTTGGTTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGATTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCg > 1:2877187/1‑100 (MQ=255) ggTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCg > 2:2094575/1‑100 (MQ=255) ggTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGGCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCg > 2:860130/1‑100 (MQ=255) tAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGAt > 2:467804/1‑100 (MQ=255) accacTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGa > 1:104561/1‑100 (MQ=255) ccacTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGAt > 1:2167963/1‑100 (MQ=255) tttcaaCCAGTTAATCAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGAtt > 2:2748294/5‑100 (MQ=255) tttcaaCCAGTTAATCAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTCCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGAtt > 1:1723711/5‑100 (MQ=255) ttcaaCCAGTTAATCAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTa > 2:2103472/4‑100 (MQ=255) ttcaaCCAGTTAATCAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTa > 2:1363201/4‑100 (MQ=255) tAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGc < 2:2211135/100‑1 (MQ=255) tAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGc < 2:2772095/100‑1 (MQ=255) caaCCAGTTAATCAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGTTCTGATTAGc > 1:1919834/2‑100 (MQ=255) caaCCAGTTAATCAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGc > 1:1457016/2‑100 (MQ=255) aaCCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCg > 2:1609263/1‑100 (MQ=255) aaCCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCg < 2:1774052/100‑1 (MQ=255) aaCCAGTTAATCAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACACACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCg > 1:2196735/1‑100 (MQ=255) ncAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGt > 2:1777175/2‑100 (MQ=255) ccAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTTTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGc < 1:2383002/97‑1 (MQ=255) cAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTc < 2:2373929/100‑1 (MQ=255) cAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTc > 2:673326/1‑100 (MQ=255) cAGTTGATTAACTGGTGGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAGCGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTc > 1:335144/1‑100 (MQ=255) aGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTCt > 2:2760840/1‑100 (MQ=255) aGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTCt > 2:2603708/1‑100 (MQ=255) ttGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTCTGc < 2:1983497/100‑1 (MQ=255) tGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTCTGCt < 2:1825782/100‑1 (MQ=255) gATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTCTGCTa < 1:1445934/100‑1 (MQ=255) aTTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTCTGCTAc < 1:1607458/100‑1 (MQ=255) ttAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTCTGCTAcc > 2:1906308/1‑100 (MQ=255) | GAAGTGTTATTTGCGTGTCGCGGGCATTATGGCGGAGTACTCTCAGCCTGACGATATGATGGTGGTTTCCGCC‑GCCGGTAGCACCACTAACCAGTTGATTAACTGGTTGAAACTAAGCCAGACC‑GATCGTCTCTCTGCGCATCAGGTTCAACAAACGCTGCGTCGCTATCAGTGCGATCTGATTAGCGGTCTGCTACCC > NC_000913/4129909‑4130107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |