Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,214,649 | A→T | 81.5% | I124F (ATC→TTC) | metA → | homoserine O‑transsuccinylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,214,649 | 0 | A | T | 81.5% | 264.7 / 47.1 | 112 | I124F (ATC→TTC) | metA | homoserine O‑transsuccinylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (12/9); new base T (48/43); total (60/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.10e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
AACTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCATT > NC_000913/4214550‑4214744 | aaCTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGa > 1:1972192/1‑100 (MQ=255) cTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTc < 2:878312/100‑1 (MQ=255) cTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTc > 1:1967168/1‑100 (MQ=255) ttGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTc > 1:141278/1‑98 (MQ=255) tGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCCGTTCaaa < 2:1524638/100‑1 (MQ=255) tGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCaaa > 2:1131818/1‑100 (MQ=255) tGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCaaa > 1:2870624/1‑100 (MQ=255) gAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCaaan < 1:388333/100‑2 (MQ=255) aaGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACa < 2:1462015/100‑1 (MQ=255) aGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAAc < 2:1071332/98‑1 (MQ=255) aGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAg > 2:2328142/1‑100 (MQ=255) gATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAgg < 1:230409/100‑1 (MQ=255) gATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAgg < 2:649383/100‑1 (MQ=255) gATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAgg < 1:1699852/100‑1 (MQ=255) atTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGc > 1:1670326/1‑100 (MQ=255) ttCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCt > 2:2593860/1‑100 (MQ=255) ttCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCt > 1:2014915/1‑100 (MQ=255) ttCAGGATCAGAACTTTGACGGGTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGCGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGc > 1:2791741/1‑99 (MQ=255) tCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTg > 1:272391/1‑100 (MQ=255) tCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTg > 1:1461528/1‑100 (MQ=255) tCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCATGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTCCTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTg > 1:121767/1‑100 (MQ=255) cAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTgg > 2:2276350/1‑100 (MQ=255) ngtCAGAACTTTGCCGGTTTGATTGTAACTGATGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGt > 2:1968911/3‑100 (MQ=255) gATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGt > 1:559535/1‑100 (MQ=255) gATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGACCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAg > 2:2629221/1‑99 (MQ=255) aTCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTg > 2:1054757/1‑100 (MQ=255) tCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTgg < 1:985086/100‑1 (MQ=255) cAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTTGCCGCAGTTCAAACAGGTTCTGGAGTGGt > 1:638475/1‑100 (MQ=255) aGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTc > 2:1407369/1‑100 (MQ=255) aGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTc > 2:2523958/1‑100 (MQ=255) aGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTc < 2:2041349/100‑1 (MQ=255) cTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGaaa > 2:398838/1‑100 (MQ=255) cTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGaaa > 2:2702512/1‑100 (MQ=255) cTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCACTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGaaa < 1:2402037/100‑1 (MQ=255) tttGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAg < 2:1748730/100‑1 (MQ=255) gACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATc < 1:772044/100‑1 (MQ=255) gACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATc < 2:263080/100‑1 (MQ=255) aCGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCa < 2:553020/100‑1 (MQ=255) ggTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCa < 1:2837604/98‑1 (MQ=255) ggTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACg < 1:2276335/100‑1 (MQ=255) tttGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTc < 1:1730408/100‑1 (MQ=255) gtaTTGGAACTGGGGCGCCGCTGGGCCTGGTGGGGTTTAATCATGTCGCTTACTGTCCGCAGTTCAGACAGGTGCTCGAGGGGTCGCAAGATCCCGTCa > 1:2769439/3‑99 (MQ=255) gATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCagc < 2:1967179/100‑3 (MQ=255) gATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCAcc < 2:1902670/100‑1 (MQ=255) ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCAcccc < 2:1958175/100‑3 (MQ=255) ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTc > 2:565396/1‑100 (MQ=255) ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTc > 2:712317/1‑100 (MQ=255) ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTc > 1:2537200/1‑100 (MQ=255) ttGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTc < 2:2404045/100‑1 (MQ=255) tAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCCGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGAc > 1:200768/1‑100 (MQ=255) tAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGAc > 1:2867654/1‑100 (MQ=255) tAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGAc < 2:434096/100‑1 (MQ=255) aaCTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACg > 1:985740/1‑100 (MQ=255) aaCTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTAGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACg > 1:1297635/1‑100 (MQ=255) aCTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGc < 2:1705903/100‑1 (MQ=255) gTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTGGCTTACTGGCCGCAGTTGAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGCAAGATCACGTCACCTCGACGCTGt > 1:1319574/1‑99 (MQ=255) gTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGtt < 2:2816140/100‑1 (MQ=255) tGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACCGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGCCACCTCGACGCTGttt > 1:622952/1‑100 (MQ=255) gcgcCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTg < 1:2499458/100‑1 (MQ=255) gcgcCGCTGGGCCTGGTGGAGATTAATGATGTCGCTTGCTGGCCGCAGTTCACACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGCCGCTGTTTg > 1:1855750/1‑100 (MQ=255) ccgcTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTct > 1:1632105/1‑100 (MQ=255) tGGGCCTGATGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTctgctg < 1:121614/100‑1 (MQ=255) gggCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTctgctgn < 1:1669833/100‑2 (MQ=255) gggCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTgg < 2:2881478/100‑1 (MQ=255) ggCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCATGTCACCTCGACGCCGTCTGTCTGCTgg > 1:2198008/1‑99 (MQ=255) ggCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTggg < 1:315982/100‑1 (MQ=255) gCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGc < 2:1567843/100‑1 (MQ=255) gCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGc < 1:2883401/100‑1 (MQ=255) ccTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCg < 2:1172730/100‑1 (MQ=255) ccTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCg < 1:1216993/100‑1 (MQ=255) ccTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCg < 1:155674/100‑1 (MQ=255) cTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCgg < 2:404483/100‑1 (MQ=255) cTGGGGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCGCTTCAAACAGGTGCTGGAGAGGTCGTAAGATCACGTCTCGTCGACGCTGTTTGTctgctg > 1:411952/1‑95 (MQ=255) tggtggAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGt > 1:2123110/1‑100 (MQ=255) tccgatcttAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTAc < 1:1316034/93‑1 (MQ=255) gtggAGTTTAATGATGCCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGCTGCTGGAGTGGACCAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGCGCCGTAc > 1:1295095/1‑100 (MQ=255) gaggAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTAc > 2:1967835/3‑100 (MQ=255) tggAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACa < 1:2421496/100‑1 (MQ=255) ggAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAg > 2:537651/1‑100 (MQ=255) gAGTTTAATGATGTCGTTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAgg < 1:1700515/100‑1 (MQ=255) aGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGATTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAgg < 1:402336/99‑1 (MQ=255) gTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGcc > 1:2541631/1‑100 (MQ=255) ttAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCcgc > 2:1207128/1‑100 (MQ=255) tAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAgatcgga > 2:1316039/1‑94 (MQ=255) tAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCcgcg > 1:509301/1‑100 (MQ=255) aaTGATGTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAGCAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCgcgc < 1:803666/100‑1 (MQ=255) atgatgTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCt < 1:2333555/100‑1 (MQ=255) tgTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAat > 1:53220/1‑100 (MQ=255) gTCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAata > 2:1709636/1‑100 (MQ=255) tCGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACCGGCCGCGCTCAatat > 1:391086/1‑100 (MQ=255) cGCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAatat > 1:234760/1‑99 (MQ=255) gCTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATcc < 1:18361/100‑1 (MQ=255) cTTACTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCct > 1:148348/1‑100 (MQ=255) cTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTAc > 2:1933609/1‑100 (MQ=255) cTGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCCGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTAc > 1:1870030/1‑100 (MQ=255) tGGCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACg > 2:1993537/1‑100 (MQ=255) ggCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACgg > 2:1421059/1‑100 (MQ=255) ggCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCGCAATATCCTCTACgg > 2:2874398/1‑100 (MQ=255) gCCGCAGTTCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGc < 2:2818058/100‑1 (MQ=255) gCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCAtt < 2:509304/100‑1 (MQ=255) | AACTTTGAAGATATTCAGGATCAGAACTTTGACGGTTTGATTGTAACTGGTGCGCCGCTGGGCCTGGTGGAGTTTAATGATGTCGCTTACTGGCCGCAGATCAAACAGGTGCTGGAGTGGTCGAAAGATCACGTCACCTCGACGCTGTTTGTCTGCTGGGCGGTACAGGCCGCGCTCAATATCCTCTACGGCATT > NC_000913/4214550‑4214744 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |