| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,156,112 | T→C | 100% | A117A (GCT→GCC) | holB → | DNA polymerase III, delta prime subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,156,112 | 0 | T | C | 86.2% | 290.1 / 30.8 | 116 | A117A (GCT→GCC) | holB | DNA polymerase III, delta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/8); new base C (57/43); total (65/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.59e-01 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
AAAATACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTG > NC_000913/1156015‑1156206 | aaaaTACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGAtgccgc > 1:1944106/1‑100 (MQ=255) aaaTACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGcc < 2:136806/100‑1 (MQ=255) aTACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCtt < 1:703421/100‑1 (MQ=255) aTACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCtt < 2:2101778/100‑1 (MQ=255) aCGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTAc < 1:647980/100‑1 (MQ=255) aCGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTAc < 2:1218508/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTTAGGTCCCCGAAAGGCTGGATCAGCTCGAACGCGTAGGCGGTGCGCGAGTCGATGGGGTAACCGATGCCGCCTTAc > 1:1369086/1‑99 (MQ=255) gggCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAGTGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAAcc < 1:236571/100‑1 (MQ=255) gggCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAAcc < 1:224164/100‑1 (MQ=255) cGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAc > 1:2398135/1‑100 (MQ=255) cGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAc > 2:17244/1‑100 (MQ=255) gTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGAcg > 2:902879/1‑100 (MQ=255) gTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAcg > 2:2849803/1‑100 (MQ=255) ttGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAcgc > 2:1484858/1‑100 (MQ=255) tGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGTTGCTGCCTTACTAACCGAcgcc > 1:985180/1‑100 (MQ=255) aTGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAcgccgc < 1:1475018/100‑1 (MQ=255) gCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCgg > 2:940653/1‑100 (MQ=255) cGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGc < 1:940650/100‑1 (MQ=255) aCGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAAc > 1:2592864/1‑100 (MQ=255) cGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACg < 2:1152349/100‑1 (MQ=255) tGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCa > 1:2461614/1‑100 (MQ=255) aGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCAtt > 2:2476073/1‑100 (MQ=255) ggTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTg > 1:2641254/1‑100 (MQ=255) ggTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTg > 1:1993071/1‑100 (MQ=255) gTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGc < 2:902578/100‑1 (MQ=255) gTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGc < 2:2044221/100‑1 (MQ=255) gTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCATTACTAACCGACGCCGCCGCTAACGCATTGc < 2:1960863/100‑1 (MQ=255) cACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTg < 1:797130/100‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGa > 2:2415713/1‑100 (MQ=255) aCCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTg < 1:2617222/96‑1 (MQ=255) aCCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTg < 2:2154771/99‑1 (MQ=255) ccGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTTCTg > 1:1031228/1‑98 (MQ=255) ccGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTg > 1:1031206/1‑98 (MQ=255) ccGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGaa > 2:1710353/1‑100 (MQ=255) ccGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGaa > 1:1505055/1‑100 (MQ=255) ccGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCATAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCCTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGaa > 2:1770453/1‑100 (MQ=255) cGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGaaa < 1:1814705/100‑1 (MQ=255) aaaaGCTGAATGAGCAGGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAAc < 1:1705418/100‑1 (MQ=255) aaGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGc > 2:1272292/1‑100 (MQ=255) gAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGaa > 1:910539/1‑100 (MQ=255) gAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTCGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGaa < 1:1959658/100‑1 (MQ=255) aaTGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAag < 2:2151311/100‑1 (MQ=255) aaTGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAag > 1:1239829/1‑100 (MQ=255) aTGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAaga < 2:94962/100‑1 (MQ=255) aTGAGCACGCACGCGTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAaga < 1:1064801/100‑1 (MQ=255) gAGCACGCGCGCGTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAagag < 1:2356986/99‑1 (MQ=255) gAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGc < 2:1765702/100‑1 (MQ=255) aGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGcc < 2:227722/100‑1 (MQ=255) aGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGcc > 2:1941919/1‑100 (MQ=255) aGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGcc > 2:109260/1‑100 (MQ=255) cacgcacgCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGCCGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccac > 2:1118464/1‑100 (MQ=255) cacgcacgCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccac > 2:2816169/1‑100 (MQ=255) acgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacc < 1:1484852/100‑1 (MQ=255) acgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacc < 2:223080/100‑1 (MQ=255) cgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacca > 1:340176/1‑100 (MQ=255) gcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAATGCATTGCTGAAAACGCGTGAAGAGCCACcag < 1:187821/100‑1 (MQ=255) gcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACcag < 2:1280495/100‑1 (MQ=255) cTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGaa < 2:411886/100‑1 (MQ=255) cTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGaa > 1:269055/1‑100 (MQ=255) cTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGaa > 1:1597712/1‑100 (MQ=255) cTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGaa < 2:1431669/100‑1 (MQ=255) tAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAAc < 1:2550093/100‑1 (MQ=255) tAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCAATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAAc > 2:706155/1‑100 (MQ=255) ggtggtGCGAAAGTCGTTTGTGGAACCGCGTCCGCCTTAATAACCAACGCCGCCCCTAACGCATTGCCGAAACCCCTTGCCGAGCCCTCAGTAGaa < 1:1279627/96‑1 (MQ=255) ggtggtGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAACAGCCACCAGCAGAAACt > 1:2830432/1‑99 (MQ=255) ggtggtGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATCGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAAcgt > 1:728035/1‑98 (MQ=255) gtggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTg > 1:474087/1‑100 (MQ=255) gtggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTg > 2:2231043/1‑100 (MQ=255) tggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTgg > 2:1473553/1‑100 (MQ=255) tggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTgg < 1:1790382/100‑1 (MQ=255) tggtgCGAAAGTCGTTCGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTgg < 1:1705792/100‑1 (MQ=255) tgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGttt > 2:2867348/1‑100 (MQ=255) tgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGttt > 1:2483147/1‑100 (MQ=255) tgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGttt > 2:2601323/1‑100 (MQ=255) gAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTc > 1:456209/1‑100 (MQ=255) gAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTc > 1:262891/1‑100 (MQ=255) aaaGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTcc < 1:194447/100‑1 (MQ=255) aGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTg > 1:2027818/1‑100 (MQ=255) aGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTg < 2:262892/100‑1 (MQ=255) gTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTgg > 2:1554578/1‑100 (MQ=255) tCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGc < 1:207271/100‑1 (MQ=255) cGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCt > 2:1709647/1‑100 (MQ=255) cGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCt > 1:1283787/1‑100 (MQ=255) gTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTa > 2:210547/1‑100 (MQ=255) gTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTa > 1:2253355/1‑100 (MQ=255) ttGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTAcc < 1:267560/100‑1 (MQ=255) tGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTAccc > 2:504325/1‑100 (MQ=255) tGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTAccc > 1:2867159/1‑100 (MQ=255) tGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTAccc < 2:1730812/100‑1 (MQ=255) gggTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCcg > 2:1054425/1‑100 (MQ=255) ggTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCcgc < 2:2268752/100‑1 (MQ=255) ggTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCcgc > 2:1056561/1‑100 (MQ=255) gTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCAACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCcgcg > 1:2562452/1‑100 (MQ=255) aCCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCTGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAg < 1:2469809/99‑1 (MQ=255) aCCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAg > 1:381573/1‑99 (MQ=255) aCCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGc > 1:1624300/1‑100 (MQ=255) ccGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGcc < 2:2611182/100‑1 (MQ=255) ccGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGcc < 2:2699955/100‑1 (MQ=255) ccGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGcc < 1:67293/100‑1 (MQ=255) gATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTg < 2:1514101/100‑1 (MQ=255) | AAAATACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTG > NC_000913/1156015‑1156206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |