| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,666,470 | C→A | 23.2% | L386I (CTA→ATA) | clcB → | H(+)/Cl(‑) exchange transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,666,470 | 0 | C | A | 23.2% | 247.8 / 69.9 | 116 | L386I (CTA→ATA) | clcB | H(+)/Cl(‑) exchange transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (49/40); new base A (14/13); total (63/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TTACTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGC > NC_000913/1666371‑1666568 | ttACTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGc < 2:1618519/100‑1 (MQ=255) tACTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCt < 2:343610/100‑1 (MQ=255) cTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCCCGCGCCGATTATGTCGACGTTGAGGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTAc > 1:1405158/1‑100 (MQ=255) cTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTAc > 2:1022743/1‑100 (MQ=255) cTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGGTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTa > 1:642086/1‑99 (MQ=255) cGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTc > 1:824546/1‑100 (MQ=255) aTTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTcccc < 2:2380880/100‑1 (MQ=255) aTTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTAGCTGATACTcccc < 2:2608374/100‑1 (MQ=255) tGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGAGGTTGATGATATGTGAAATGACCGAGGAGTAGCTGATACTCCCTgg < 1:367655/100‑1 (MQ=255) tGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCgg < 2:2119664/100‑1 (MQ=255) tGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCgg < 2:451756/100‑1 (MQ=255) tGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTAGCTGATGCTCCCCgg < 1:593049/100‑1 (MQ=255) tGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTAGCTGATACTCCCCgg < 2:2436342/100‑1 (MQ=39) tGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTAGCTGATACTCCCCgg < 2:1792048/100‑1 (MQ=39) tGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTAGCTGATACTCCCCgg < 1:1263877/100‑1 (MQ=39) tGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACACACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCgg < 2:2637407/100‑1 (MQ=255) gACCTGGATTGCGACACTGTTGGCCGCAACCACTCACGCTCCGATTATGTCGACGTTGCTTATATTTGCAATGACCGGGGGGTAGCTGATACTCCCCgg < 1:1914377/99‑1 (MQ=255) gACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGt > 2:515344/1‑100 (MQ=255) gACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGt > 2:1644683/1‑100 (MQ=255) gACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTAGCTGATACTCCCCGGt < 2:2723823/100‑1 (MQ=39) gACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGAGGACATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCgg > 1:938444/1‑99 (MQ=255) cGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTa > 2:1245168/1‑100 (MQ=255) gggATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTat > 2:465134/1‑100 (MQ=255) ggCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTattgatt > 2:2720506/1‑100 (MQ=255) ggCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTattgatt < 2:1640739/100‑1 (MQ=255) gCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTAGCTGATACTCCCCGGtcatttcacat < 2:1847746/100‑11 (MQ=25) ccgatcttGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTattgattg < 2:902675/93‑1 (MQ=255) cGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGc > 1:2857409/1‑100 (MQ=255) gACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGcc < 2:2568576/100‑1 (MQ=255) gACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTCGCTGATATGCGAAATGACCGGGGAGCAGCCGCTACTCCCCGGTTTATGGATTGc > 1:2486350/1‑99 (MQ=255) cTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCg < 2:854934/100‑1 (MQ=255) cTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCg > 1:1045253/1‑100 (MQ=255) tGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTattgattgagatcgg > 1:902672/1‑93 (MQ=255) tGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGt < 1:225793/100‑1 (MQ=255) tGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGt < 2:1125541/100‑1 (MQ=255) gTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTa < 2:2588607/100‑1 (MQ=255) tGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAAt < 1:2214614/100‑1 (MQ=255) tGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAAt > 2:398685/1‑100 (MQ=255) gcggcgACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTg < 2:231423/100‑1 (MQ=255) gcggcgACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTg < 1:1293521/100‑1 (MQ=255) gcggcgACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTCGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTg < 1:1220388/100‑1 (MQ=255) ggcgACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATTACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCGGCGTAATTGCg < 1:488555/100‑1 (MQ=255) cgACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTc < 1:1677622/100‑1 (MQ=255) aCCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCgg < 1:2216573/100‑1 (MQ=255) acgcacgcGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTaa > 1:2332169/1‑100 (MQ=255) cgcacgcGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAAt > 2:303631/1‑100 (MQ=255) cgcacgcGCCGATTATGTCAAAGTTGATGATGGGTGAAATGGCGGGGGAGTATCAGCTACTCCCAGTTTTATTGATTGCCTGCGTAAGTGCGACGGTAAt > 1:1763492/1‑100 (MQ=255) cacgcGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAAttt > 2:1992651/1‑100 (MQ=255) cgcgCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTcg < 2:2180270/100‑1 (MQ=255) gcgcCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTcgc > 2:2039407/1‑100 (MQ=255) cgcCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTGATTTcgcg > 1:2057842/1‑100 (MQ=255) gcCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCgg < 2:2450346/100‑1 (MQ=255) cGATTCTGTCGCCATTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGa > 1:1804261/1‑99 (MQ=255) cGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATTACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTcgcg < 2:2321063/97‑1 (MQ=255) gATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACg > 2:1647395/1‑100 (MQ=255) aTTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGCGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCAGACGt < 1:1967595/100‑1 (MQ=255) ttATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGtt > 1:933433/1‑100 (MQ=255) gTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACTGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTTATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTACTTTCGCGGACGTTac > 1:1897579/1‑98 (MQ=255) gTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTacac < 1:2610226/100‑1 (MQ=255) gTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTacac > 2:322591/1‑100 (MQ=255) cGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGa < 2:1342172/100‑1 (MQ=255) gatgatATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGActct > 2:1901643/1‑100 (MQ=255) atgatATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACtcta < 2:2733641/100‑1 (MQ=255) gatATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACtctatc < 2:2158169/100‑1 (MQ=255) gatATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACtctatc < 1:1881310/100‑1 (MQ=255) gatATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACtctatc < 2:635951/100‑1 (MQ=255) agatGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACtctatct > 2:1978384/3‑100 (MQ=255) atGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTAc > 1:1691415/1‑100 (MQ=255) tgtgAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTAcc > 1:1163698/1‑100 (MQ=255) tgtgAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTAcc > 2:2896746/1‑100 (MQ=255) gtgAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCg > 2:2172795/1‑100 (MQ=255) atcaataaaCCGGGGAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCg > 1:49703/9‑100 (MQ=37) ccgatctccGGGGAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGcn < 1:1278323/93‑2 (MQ=38) caataaaCCGGGGAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGcc > 2:1657193/7‑100 (MQ=37) aaaTGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGcn < 1:2379296/99‑2 (MQ=255) aaaTGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCa < 2:2204829/100‑1 (MQ=255) aaaCCGGGGAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGca > 2:1340662/3‑100 (MQ=38) aCCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGcaca > 1:134825/1‑100 (MQ=255) ccGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCacac > 1:1446807/1‑100 (MQ=255) ccGGGGAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAgatcgg > 2:1278328/1‑95 (MQ=38) ccGGGGAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCacac > 1:2362865/1‑100 (MQ=39) ccGGGGAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTAGTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCacac > 1:175025/1‑100 (MQ=39) cGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACt > 2:408122/1‑100 (MQ=255) cGGGGAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACt > 2:442896/1‑100 (MQ=255) ggggAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACt > 1:1741733/1‑99 (MQ=255) ggggAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTg > 1:2840953/1‑100 (MQ=255) ggggAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTg > 1:1100350/1‑100 (MQ=255) ggggAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTg > 1:1437485/1‑100 (MQ=255) ggggAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTg > 2:1182521/1‑100 (MQ=255) ggggAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTg > 2:161778/1‑100 (MQ=255) gggAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTgc < 2:2320324/100‑1 (MQ=255) ggAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTTCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTCCACCGTGACTCTGTCTACCGCCAGCacacgg > 1:548195/1‑96 (MQ=255) aGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCgca < 2:834340/100‑1 (MQ=255) gTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCgcag < 1:1933108/100‑1 (MQ=255) gTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCgcag > 2:866105/1‑100 (MQ=255) tATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCgcagc < 2:824549/100‑1 (MQ=255) aTCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCgcagca < 2:2226272/100‑1 (MQ=255) aGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAg > 1:2114792/1‑100 (MQ=255) aGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAg > 1:2730020/1‑100 (MQ=255) aGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAg < 1:1170727/100‑1 (MQ=255) | TTACTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGC > NC_000913/1666371‑1666568 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |