| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,017,429 | (C)6→7 | coding (876/1374 nt) | fliI → | flagellum‑specific ATP synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,017,423 | 1 | . | C | 93.9% | 331.8 / 14.0 | 99 | coding (870/1374 nt) | fliI | flagellum‑specific ATP synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/2); new base C (50/43); total (54/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGA > NC_000913/2017325‑2017517 | gAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑c > 1:583142/1‑100 (MQ=255)gAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑c > 1:1092257/1‑100 (MQ=255) ttttCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑cc‑cccc < 1:2335692/100‑1 (MQ=255) ttttCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑cc‑cccc > 1:2938177/1‑100 (MQ=255) tCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑cc‑cccccgc > 2:2732527/1‑97 (MQ=255) tCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑cc‑cccccgc > 2:2629926/1‑97 (MQ=255) cgcgATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑cc‑cccccgcc < 1:1299014/100‑5 (MQ=255) cgATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGccac > 1:2680584/1‑100 (MQ=255) cgATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGccac > 1:898583/1‑100 (MQ=255) cgATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGccac > 2:2253086/1‑100 (MQ=255) gATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGccacc < 1:2235028/100‑1 (MQ=255) tGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAgg < 2:1425975/100‑1 (MQ=255) gTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGtt > 1:2655112/1‑100 (MQ=255) gTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGtt > 1:890501/1‑100 (MQ=255) tCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCTCACGCTACGCGATGCCCCAGCGTGAAATTGCGCTGTCGAGTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTa < 2:2849933/100‑1 (MQ=255) tCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCGACGCGATGGCCCAGCCTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTa < 2:1684713/100‑1 (MQ=255) aGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑ACCCC‑CCCCGCCACCAAAGGTTAt > 2:1764338/1‑100 (MQ=255) gCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATcc > 2:992472/1‑100 (MQ=255) gCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATcc < 2:2526216/100‑1 (MQ=255) gCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCa > 1:2110711/1‑100 (MQ=255) aTGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCAc > 1:1245184/1‑100 (MQ=255) gtgtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCg < 2:2387368/100‑1 (MQ=255) gtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTc > 1:2438251/1‑100 (MQ=255) gtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTc > 2:852810/1‑100 (MQ=255) gtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTc < 1:2253106/100‑1 (MQ=255) gtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTc > 1:1087229/1‑100 (MQ=255) ttGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCg < 2:2227378/100‑1 (MQ=255) tGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCgg < 1:182605/100‑1 (MQ=255) tGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCgg > 1:2028920/1‑100 (MQ=255) tGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCgg < 1:952577/100‑1 (MQ=255) tGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCgg > 1:99789/1‑100 (MQ=255) tGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCgg < 1:3024150/100‑1 (MQ=255) gCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGgt > 1:125117/1‑100 (MQ=255) cTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGgtg < 2:1003239/100‑1 (MQ=255) tGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑ACCCC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGgtg < 1:1764353/100‑1 (MQ=255) tGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGgtgt > 2:1890063/1‑100 (MQ=255) tGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGgtgt > 2:75228/1‑100 (MQ=255) tGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGgtgt > 1:407385/1‑100 (MQ=255) gATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGtt > 2:186779/1‑100 (MQ=255) gATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGtt > 1:2604448/1‑100 (MQ=255) ttATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTg < 1:2991592/100‑1 (MQ=255) tATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGc < 1:1613738/100‑1 (MQ=255) ggACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGCGTTTGCCaa > 1:1318641/1‑100 (MQ=255) ggACTCCCTCACCAGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGcc < 2:2538476/98‑1 (MQ=255) ntCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑CCACCCCGCCAACAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAAt > 1:276228/2‑99 (MQ=255) cccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTAc > 2:2559618/1‑100 (MQ=255) ccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTAcc > 2:128816/1‑100 (MQ=255) ccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTAcc < 1:1090578/100‑1 (MQ=255) ccTCACCCGCTACGCGAGTGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTTGCGCA‑C‑‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGGTTGCCAAATTAcc > 2:595201/1‑100 (MQ=255) cTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCg > 2:3010379/1‑100 (MQ=255) cTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCg > 2:1641641/1‑100 (MQ=255) tCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCgg > 2:772724/1‑100 (MQ=255) tCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCgg > 2:1012530/1‑100 (MQ=255) cACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGATTGCCAAATTCCCGGc > 2:1776417/1‑100 (MQ=255) aCCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCa > 2:1605881/1‑100 (MQ=255) aCCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCa > 1:2229325/1‑100 (MQ=255) cccGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCAc < 2:583135/100‑1 (MQ=255) cccGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCAc > 1:2413557/1‑100 (MQ=255) gcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGCA‑C‑‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTc < 1:1379484/97‑1 (MQ=255) gcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAg > 2:2859061/1‑100 (MQ=255) gATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGGTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACGGGTCGAGCg > 1:1655921/1‑100 (MQ=255) tGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTg < 1:2298548/100‑1 (MQ=255) ggCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑ACCCC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGCCGAGCGTg > 1:2637557/1‑100 (MQ=255) ggCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGc > 1:2095826/1‑100 (MQ=255) gCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGcc > 1:339250/1‑100 (MQ=255) gCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGcc > 2:443182/1‑100 (MQ=255) cccAGCGCGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCg > 1:1591432/1‑100 (MQ=255) ccAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCgg > 1:1188599/1‑100 (MQ=255) ccAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCgg < 1:1398078/100‑1 (MQ=255) gCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGaaa > 1:1760639/1‑100 (MQ=255) gTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATg > 2:1032586/1‑100 (MQ=255) gTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATg < 1:541676/100‑1 (MQ=255) gTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATg < 1:229780/100‑1 (MQ=255) tGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑AGC‑‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATgg < 2:643819/100‑1 (MQ=255) tGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATgg < 2:2637816/100‑1 (MQ=255) tGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATgg < 2:890493/100‑1 (MQ=255) tGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATgg < 2:2032095/100‑1 (MQ=255) tGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATgg > 2:968693/1‑100 (MQ=255) gAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCACAGGTTATCCACCGTCGGTGCTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGc < 2:1655907/100‑1 (MQ=255) gAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGc < 1:1012540/100‑1 (MQ=255) gAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGc < 1:1520201/100‑1 (MQ=255) gAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGc < 1:1960097/100‑1 (MQ=255) gAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGc < 1:1890080/100‑1 (MQ=255) aaaTTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCTCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATgg < 1:2074377/98‑1 (MQ=255) aaTTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCAt > 2:1109007/1‑100 (MQ=255) aTTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCAtt < 1:2896874/100‑1 (MQ=255) aTTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCAtt > 1:2562425/1‑99 (MQ=255) tGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAg < 2:1714500/100‑1 (MQ=255) gcTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcg > 2:1322818/1‑99 (MQ=255) cTGGCGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggc < 1:128817/100‑1 (MQ=255) cGATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcggcg > 1:2578688/1‑100 (MQ=255) gATTGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGcggcggcgg < 1:2352238/100‑1 (MQ=255) tGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTc < 2:1092247/100‑1 (MQ=255) tGGCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTc > 2:2055286/1‑100 (MQ=255) ggCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCg > 1:1877869/1‑100 (MQ=255) ggCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCg < 1:2325033/100‑1 (MQ=255) ggCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCg < 2:643721/100‑1 (MQ=255) ggCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCg > 1:557200/1‑100 (MQ=255) gCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGa < 1:195427/100‑1 (MQ=255) gCG‑A‑AC‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGa > 1:1426727/1‑100 (MQ=255) | GAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCG‑A‑A‑‑CC‑CCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGA > NC_000913/2017325‑2017517 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |