| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,652,855:1 | (G)6→7 | 100% | coding (362/846 nt) | sseA → | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,652,849 | 1 | . | G | 94.5% | 385.2 / 13.9 | 110 | coding (356/846 nt) | sseA | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/2); new base G (55/49); total (59/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑GGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAA > NC_000913/2652750‑2652942 | aGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑t > 2:3205889/1‑100 (MQ=255) ggATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g < 2:2108744/100‑1 (MQ=255) ggATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g > 1:187016/1‑100 (MQ=255) gATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gg < 2:774481/100‑1 (MQ=255) gATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gg < 1:55373/100‑1 (MQ=255) aTAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑ggg < 2:618144/100‑1 (MQ=255) aTAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑ggg > 1:557697/1‑100 (MQ=255) tAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg > 2:2351597/1‑100 (MQ=255) aaGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑g < 1:3051392/100‑1 (MQ=255) gCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑ggg > 2:3164267/1‑99 (MQ=255) gCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑ggg < 2:2068090/100‑2 (MQ=255) gCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑ggg > 1:1613616/1‑99 (MQ=255) ccccTTATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTAAGAAACAAGAACATGGTGGATGTCGCGCAACTTTGGTGAAGAGAAATAGTCGATTC‑T‑gg > 2:1480648/3‑94 (MQ=255) aCCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑gggtg > 2:1145986/1‑97 (MQ=255) aCCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑gggtg > 1:339321/1‑97 (MQ=255) ccTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑gggtgg < 2:1928002/100‑5 (MQ=255) ccTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑gggtgg < 1:2528826/100‑5 (MQ=255) ccTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑gggtgg < 1:2100877/100‑5 (MQ=255) tGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑gggtgga > 1:48025/1‑94 (MQ=255) tGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑gggtgga > 2:2022385/1‑94 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑gggg‑gtgggg > 1:1878607/1‑92 (MQ=255) ttGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTg > 1:29015/1‑100 (MQ=255) atctCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTg < 1:1254227/97‑1 (MQ=255) tGTCGATGAGGAAGGTAATCTTTTCTCAGTGCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTGTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTg < 2:711479/99‑1 (MQ=255) gTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCa < 2:557695/100‑1 (MQ=255) gTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCATTTGTGTAGGGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCa > 2:2280674/1‑100 (MQ=255) cTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAgg > 2:419158/1‑100 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTg < 2:335895/100‑1 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTg > 1:1561424/1‑100 (MQ=255) ngACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTg > 2:382684/2‑100 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTgg > 1:736540/1‑100 (MQ=255) aCGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGc > 2:778555/1‑100 (MQ=255) aaGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAgc > 2:3113592/1‑100 (MQ=255) ggTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAgcgc > 2:655662/1‑100 (MQ=255) ggTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑GGGGCGGTGGACTTGCAGGCTGGCAgcg > 1:863634/1‑99 (MQ=255) gTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCAGCGCACCTTTGGAGTAGAGAAACTGTGAAATG‑T‑GGGGAGATGGACTTGAAGGCTAGCCgc > 2:2950891/1‑97 (MQ=255) aaTCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgat > 1:11237/1‑100 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatg > 1:2013598/1‑100 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatg > 2:1287489/1‑100 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatg < 1:914806/100‑1 (MQ=255) tttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATct > 2:2101418/1‑100 (MQ=255) ttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctg < 1:1267813/100‑1 (MQ=255) tctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgc > 2:583267/1‑100 (MQ=255) tctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgc < 1:1993373/100‑1 (MQ=255) ctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgct < 1:1529652/100‑1 (MQ=255) aGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGtt < 1:917808/100‑1 (MQ=255) aGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑GGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 1:3111610/100‑1 (MQ=255) cccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTaga > 2:304530/1‑100 (MQ=255) cccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTaga > 1:1354381/1‑100 (MQ=255) cccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTaga > 1:2470476/1‑100 (MQ=255) cACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaag > 2:2643305/1‑100 (MQ=255) cGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAgaagaa < 1:2073728/100‑1 (MQ=255) gAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGaagaag < 1:1552218/100‑1 (MQ=255) gCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGt > 1:1075107/1‑100 (MQ=255) cATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTg < 2:3248572/100‑1 (MQ=255) aTGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGt > 2:1292821/1‑98 (MQ=255) aTGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGc < 2:1684299/100‑1 (MQ=255) aTGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGc < 1:2171251/100‑1 (MQ=255) aTGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGc < 1:2643326/100‑1 (MQ=255) aTGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGATGTTAGAAGAAGGTg > 2:2225616/1‑99 (MQ=255) tggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCa > 1:290251/1‑100 (MQ=255) ggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAg < 1:1574150/100‑1 (MQ=255) ggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAg < 1:1145991/100‑1 (MQ=255) gtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGt < 1:3164295/100‑1 (MQ=255) tggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGATGCAGTa > 1:1064054/1‑100 (MQ=255) gATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTaga < 2:474891/100‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTagag > 1:313130/1‑100 (MQ=255) aTGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTagag > 2:683764/1‑100 (MQ=255) aTGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTA‑TGGGGG‑GGGGGAATTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTaga > 2:757944/1‑99 (MQ=255) gctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCt < 1:3166036/100‑1 (MQ=255) ctgcGCACCTTTGGTGTAGGGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTg > 2:2868222/1‑100 (MQ=255) tgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGc > 1:1823378/1‑100 (MQ=255) tgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGc < 2:2767709/100‑1 (MQ=255) gcgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGTTGCAGTAGAGCTGcc > 1:621749/1‑100 (MQ=255) gcgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGcc < 1:1044581/100‑1 (MQ=255) cgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCg < 1:2365011/100‑1 (MQ=255) cgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCg < 2:1683373/100‑1 (MQ=255) ccTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAg < 1:1287497/100‑1 (MQ=255) ccTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAg > 2:2901718/1‑100 (MQ=255) cTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAgg > 1:2504850/1‑100 (MQ=255) tttGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAgg < 2:398132/99‑1 (MQ=255) tttGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGga > 1:1992177/1‑100 (MQ=255) tGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGgaga < 1:1449142/100‑1 (MQ=255) ggTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGgaga > 1:2610456/1‑99 (MQ=255) ggTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGagag < 1:3051276/100‑1 (MQ=255) gtAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGttt < 1:2101433/100‑1 (MQ=255) agagAAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTaa < 2:1866934/100‑1 (MQ=255) gaAAGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTAGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgc > 2:1249211/1‑100 (MQ=255) aaaGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgcc < 1:655662/100‑1 (MQ=255) aGTGTCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgccgc < 2:339319/100‑1 (MQ=255) aGTGTAGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAAAGTTTAAcgcc > 2:901101/1‑98 (MQ=255) tgtCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGt > 2:569157/1‑100 (MQ=255) gtCGATTCTT‑GGGG‑GGTGGACTTACAGACTGGCAGCGCGATGATCTGCCGTTAGAAGAAGGTCCAGTGGGGATGCCGCAAGGAGAGGTTaaagatgtgt > 2:2576761/1‑91 (MQ=255) gtCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGtt > 1:1487682/1‑100 (MQ=255) tCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGttt > 1:2749874/1‑100 (MQ=255) tCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGttt < 1:1492045/100‑1 (MQ=255) tCGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGttt < 1:1180460/100‑1 (MQ=255) cGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTa > 1:1657573/1‑100 (MQ=255) cGATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTa > 2:883552/1‑100 (MQ=255) gATTC‑TGGGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGCAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTaa > 1:422431/1‑100 (MQ=255) | AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑GGGG‑GGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAA > NC_000913/2652750‑2652942 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |