| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4240156 | NA (NA) | 5 (0.050) | 4/164 | NT | NA | intergenic (‑101/‑169) | yjbT/psiE | putative periplasmic protein/phosphate starvation inducible protein |
| ? | NC_000913 | = 4240189 | NA (NA) | noncoding (33/37 nt) | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
TGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTT > NC_000913/4240091‑4240288 | tGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGcc > 1:2478088/1‑100 (MQ=255) gCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACAGGATTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATTCGGCCt > 2:1807136/1‑100 (MQ=255) tggtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGccaga > 2:2428343/1‑97 (MQ=255) tggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACggg > 1:699276/1‑100 (MQ=255) ggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggt > 1:1873992/1‑100 (MQ=255) ggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggt > 2:3102970/1‑100 (MQ=255) cTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtag > 1:2996146/1‑100 (MQ=255) tGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtagg < 2:474378/100‑1 (MQ=255) tGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtagg < 2:415959/100‑1 (MQ=255) tGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtag > 2:25341/1‑99 (MQ=255) ggAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtaggta < 2:2546045/100‑1 (MQ=255) ggAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtaggta < 2:1590531/100‑1 (MQ=255) aaTCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGtata < 1:2387827/100‑1 (MQ=255) cACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATcc > 2:1203906/1‑100 (MQ=255) aCCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCg > 1:382350/1‑100 (MQ=255) aCCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCg > 1:1323368/1‑100 (MQ=255) gAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCtt > 1:97245/1‑100 (MQ=255) aTGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtg > 1:1731990/1‑100 (MQ=255) tGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtgg < 1:1817385/100‑1 (MQ=255) ggTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg > 2:729633/1‑100 (MQ=255) ggTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg > 1:2495095/1‑100 (MQ=255) gTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtgg > 2:2648388/1‑100 (MQ=255) gTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtgg < 1:1909437/100‑1 (MQ=255) aTTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAgg < 1:512499/100‑1 (MQ=255) aTTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAgg < 1:2299928/100‑1 (MQ=255) tttttGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgc > 1:2607684/1‑100 (MQ=255) tttttGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgc > 1:1421922/1‑100 (MQ=255) ttttGAATCACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgcg < 2:49698/100‑1 (MQ=255) tttGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGGTGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTAGAGgcgc > 2:1745183/1‑100 (MQ=255) gAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGGCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCt < 1:729111/100‑1 (MQ=255) aaTTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTc > 1:3042140/1‑100 (MQ=255) tttccGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCTCCAGGCGCGTCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCtn < 2:1533774/95‑2 (MQ=255) ccGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt < 1:1087853/100‑1 (MQ=255) ccGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt < 2:373983/100‑1 (MQ=255) cTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAg < 2:2504019/100‑1 (MQ=255) cTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAg < 2:2845273/100‑1 (MQ=255) tttGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAgg < 2:1300946/100‑1 (MQ=255) tttGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAgg < 2:1040468/100‑1 (MQ=255) ttgtggCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGTCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAg < 2:1936577/93‑1 (MQ=255) ttGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGt > 1:1013722/1‑100 (MQ=255) tGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGtt < 1:2525387/100‑1 (MQ=255) tGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGtt < 2:1401346/100‑1 (MQ=255) ggTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTg < 2:2905089/100‑1 (MQ=255) gTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGa > 1:3087979/1‑100 (MQ=255) cGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACa > 2:2509952/1‑100 (MQ=255) gTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTTGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACaaa > 1:149115/1‑100 (MQ=255) tttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACaaaa < 1:2672412/100‑1 (MQ=255) tttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACaaaa < 2:1437754/100‑1 (MQ=255) ttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAAc < 1:718524/100‑1 (MQ=255) tGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACa < 2:869198/100‑1 (MQ=255) gTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACAt < 2:644650/100‑1 (MQ=255) gTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACAt > 1:1958639/1‑100 (MQ=255) tCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATa < 1:919065/100‑1 (MQ=255) tCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATa < 1:2314627/100‑1 (MQ=255) tCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATa < 2:1019540/100‑1 (MQ=255) cTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATac < 1:733886/100‑1 (MQ=255) ttGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagc < 2:267867‑M2/100‑66 (MQ=255) ttGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATaca < 2:1524215/100‑1 (MQ=255) ttGCCGGATGCGCCGCCAGGCGC‑‑‑‑‑ATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgc < 2:1561478‑M2/100‑71 (MQ=255) tGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgactcccagccaccagca < 1:3204653‑M2/100‑67 (MQ=255) tGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATacac > 1:2891924/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaa < 1:2055702‑M2/100‑68 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATAcaca < 1:658730/100‑1 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATAcaca < 1:1192952/100‑1 (MQ=255) ccGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACaa > 1:1588154/1‑100 (MQ=255) ggATGCGCCGCCAGGCGC‑‑‑‑‑ATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaa < 2:2397573‑M2/100‑76 (MQ=255) tGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAat < 1:825528/100‑1 (MQ=255) gcgcCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAata < 2:2034110/100‑1 (MQ=255) cgccgcCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatat > 1:638672/1‑100 (MQ=255) cgccgcCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatat > 2:151263/1‑100 (MQ=255) cgccgcCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatat < 2:395479/100‑1 (MQ=255) gccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAAtata < 2:1117981/100‑1 (MQ=255) gccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAAtata < 2:1873980/100‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAg < 2:591140/100‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAg > 1:182996/1‑100 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAg > 2:2337728/1‑100 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAg < 1:610632/100‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGATCCAAATCCAGGTTGAACATAACATACACAAAAAATATAg < 2:1573333/100‑1 (MQ=255) ccaccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTTGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatat < 2:1421914/95‑1 (MQ=255) cgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGa > 1:2211561/1‑100 (MQ=255) ccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGAtc < 2:607720/100‑1 (MQ=255) cAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGAtct > 1:2541288/1‑100 (MQ=255) ggCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTcc > 1:2902334/1‑100 (MQ=255) cgcgGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCg < 2:2756319/99‑1 (MQ=255) gcgGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTc < 1:2622751/100‑1 (MQ=255) cgGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTca < 1:1745195/100‑1 (MQ=255) ggCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTcac < 1:1670713/100‑1 (MQ=255) aTCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctc > 2:1192946‑M2/1‑7 (MQ=255) tCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctct < 1:3087988‑M2/100‑95 (MQ=255) tCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACAttttt > 1:3162138/1‑100 (MQ=255) tCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACAttttt > 1:2842354/1‑100 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTg < 2:3042113/100‑1 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTg < 2:1390864/100‑1 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTg < 1:77301/100‑1 (MQ=255) cGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctgg < 1:1517261‑M2/100‑97 (MQ=255) ggCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctgga < 1:1313805‑M2/100‑98 (MQ=255) ggCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctgg > 1:2991259‑M2/1‑3 (MQ=255) ggCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAGATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCg < 1:1997285/100‑1 (MQ=255) gCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctgga > 1:403759‑M2/1‑2 (MQ=255) ccTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGtt < 1:276473/100‑1 (MQ=255) | TGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTT > NC_000913/4240091‑4240288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |