| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 561,696 | (G)6→7 | coding (2000/2604 nt) | sfmD → | putative outer membrane export usher protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 561,690 | 1 | . | G | 96.9% | 341.6 / 2.5 | 97 | coding (1994/2604 nt) | sfmD | putative outer membrane export usher protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/2); new base G (51/42); total (53/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
AGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑GGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGAGC > NC_000913/561592‑561784 | aGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑g > 1:1277581/1‑100 (MQ=255) ccACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg < 1:1992890/100‑1 (MQ=255) ccACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg > 1:509049/1‑100 (MQ=255) ccACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑gggg < 1:1934177/100‑1 (MQ=255) cacaACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑ggggg < 2:2671353/100‑1 (MQ=255) caACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑ggggg‑gg > 1:2756720/1‑99 (MQ=255) aaCCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑ggggg‑ggc > 2:239158/1‑98 (MQ=255) tttgaaGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑ggggg‑ggcg > 1:1884072/6‑97 (MQ=255) tttgaaGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑ggggg‑ggcg > 1:464326/6‑97 (MQ=255) ccTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGTTACACGGGCAGCGCAACTGCAAACAGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑ggggg‑ggcgg > 1:1979648/1‑96 (MQ=255) ccTGAGGTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑ggggg‑ggcg < 1:1242378/99‑4 (MQ=255) cTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACTCT‑ggggg‑ggcgag < 2:1899057/100‑6 (MQ=255) cTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑ggggg‑ggcggg < 1:1511528/100‑6 (MQ=255) cTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑ggggg‑ggcggg > 1:2820747/1‑95 (MQ=255) cTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑ggggg‑ggcggg > 2:2518522/1‑95 (MQ=255) gAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGta < 2:515961/100‑1 (MQ=255) aGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGtat > 1:2251897/1‑100 (MQ=255) gTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGtata < 2:2820774/100‑1 (MQ=255) gTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGtata > 2:2584193/1‑100 (MQ=255) gTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGt > 1:1352429/1‑97 (MQ=255) aTCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGtata < 2:293554/97‑1 (MQ=255) aTCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACt > 2:721868/1‑100 (MQ=255) tCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTa > 2:1968709/1‑100 (MQ=255) tCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTa < 1:947647/100‑1 (MQ=255) cACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTAc < 2:2241353/100‑1 (MQ=255) aCGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACg < 2:1167551/100‑1 (MQ=255) aCGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACg < 1:2426222/100‑1 (MQ=255) gTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGAc > 2:1397957/1‑100 (MQ=255) gTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGAc > 2:706085/1‑100 (MQ=255) aaGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACcg < 2:1966663/100‑1 (MQ=255) aGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACcgc > 2:1643267/1‑100 (MQ=255) gCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACcgcg < 1:2217776/100‑1 (MQ=255) ccAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGa > 2:710532/1‑100 (MQ=255) cAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGAt < 1:183007/100‑1 (MQ=255) cAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGAt < 2:1456173/100‑1 (MQ=255) cAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGAt > 2:181069/1‑100 (MQ=255) gggTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCa > 1:2529426/1‑100 (MQ=255) gcgTGATACCTCGAATCAGGGGTACCCGGGCAGCGCCACGGCAACGTCGCAGGCCGCTTCCGGTACGCT‑GGGGGAG‑CGGGTAGAAGTACGACCGCGATCa < 1:2639693/98‑1 (MQ=255) tGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACa < 2:2084985/100‑1 (MQ=255) tGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACa > 2:1712218/1‑100 (MQ=255) aTACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATg < 1:1618251/100‑1 (MQ=255) tACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGa < 1:61054/100‑1 (MQ=255) tACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGa < 1:721862/100‑1 (MQ=255) cTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGt > 1:2690140/1‑100 (MQ=255) cTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGt > 2:111521/1‑100 (MQ=255) cGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTa > 2:472823/1‑100 (MQ=255) cGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTa > 2:472659/1‑100 (MQ=255) gAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTaa > 1:2286299/1‑100 (MQ=255) gAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTaa > 2:1146452/1‑100 (MQ=255) ataatGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACt > 2:1985850/1‑100 (MQ=255) ataatGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACt > 1:1047983/1‑100 (MQ=255) taatGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTg < 1:472654/100‑1 (MQ=255) taatGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTg < 1:472818/100‑1 (MQ=255) aatGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTgg > 1:885409/1‑100 (MQ=255) aatGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTgg < 1:1578645/100‑1 (MQ=255) aatGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTgg < 1:598221/100‑1 (MQ=255) tGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCa < 1:1105335/100‑1 (MQ=255) tGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCa < 1:2472731/100‑1 (MQ=255) gggTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAg > 2:254744/1‑100 (MQ=255) acacGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGt > 1:809049/1‑100 (MQ=255) cacGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTc > 1:771298/1‑100 (MQ=255) cGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTg > 1:814933/1‑100 (MQ=255) cAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCgg < 2:492497/100‑1 (MQ=255) gcgcCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGgtg < 2:1277589/100‑1 (MQ=255) cgcCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGgtgt < 2:1605136/100‑1 (MQ=255) cgcCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGgtgt < 1:1522011/100‑1 (MQ=255) cgcCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGgtgt < 1:111520/100‑1 (MQ=255) ccACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTgg > 2:1434206/1‑100 (MQ=255) ccACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTgg > 2:1216407/1‑100 (MQ=255) ccACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTgg > 2:396426/1‑100 (MQ=255) aCGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTc < 1:1712205/100‑1 (MQ=255) aCGGCAAACTGGCAGACCGCTTACGGTCCGCC‑GGGGG‑GCCGGGTATAACTACGACCACGATCACCATGACTTTAACTGGCAGCTGTCCGGcagggagat > 1:711752/1‑91 (MQ=255) cGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCg > 2:1511468/1‑100 (MQ=255) gCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCggg > 1:87298/1‑100 (MQ=255) gCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCggg > 1:720295/1‑100 (MQ=255) cAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGc > 1:1029175/1‑100 (MQ=255) aaaCTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCa > 2:405388/1‑100 (MQ=255) aaCTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCAt > 2:27160/1‑100 (MQ=255) cTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGa > 2:503238/1‑100 (MQ=255) cAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAAt > 2:1494799/1‑100 (MQ=255) cAGGCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAAt < 1:2204703/100‑1 (MQ=255) ggCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATgg < 2:2378235/100‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTCTAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGc < 2:1979663/100‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATgg < 1:1985835/99‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATg < 1:498045/98‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGc < 2:2286318/100‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGc < 1:2692307/100‑1 (MQ=255) gCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATa < 2:7693/100‑1 (MQ=255) gCTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATa > 1:1826725/1‑100 (MQ=255) cTTACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATaa > 2:1439170/1‑100 (MQ=255) ttACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCa < 1:2518502/96‑1 (MQ=255) tACGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACg > 2:1781445/1‑100 (MQ=255) aCGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGc < 2:1463934/100‑1 (MQ=255) aCGGTACGCTAGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGTAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAAcac > 1:163821/1‑98 (MQ=255) cGGTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCt > 2:1689075/1‑100 (MQ=255) ggTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTg > 1:743153/1‑100 (MQ=255) ggTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTg > 1:2384818/1‑100 (MQ=255) ggTACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTg > 1:1175326/1‑100 (MQ=255) tACGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGag > 2:2233806/1‑100 (MQ=255) aCGCTGGGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGagc < 1:1290416/100‑1 (MQ=255) | AGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGGCCGCTTACGGTACGCT‑GGGGG‑G‑CGGGTATAACTACGACCGCGATCAACATGACGTTAACTGGCAGCTGTCTGGCGGTGTGGTCGGGCATGAAAATGGCATAACGCTGAGC > NC_000913/561592‑561784 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |