| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,314,682 | Δ1 bp | 15.2% | intergenic (+24/+36) | ompW → / ← yciE | outer membrane protein W/putative rubrerythrin/ferritin‑like metal‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,314,681 | 0 | A | . | 15.2% | 253.0 / 43.7 | 92 | intergenic (+23/+37) | ompW/yciE | outer membrane protein W/putative rubrerythrin/ferritin‑like metal‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/34); new base . (8/6); total (50/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.06e-02 | |||||||||||
GGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGG > NC_000913/1314583‑1314780 | gggCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTat < 1:742882/100‑2 (MQ=255)gggCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTaa > 1:997819/1‑100 (MQ=255) ggCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTGTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAat < 2:1791511/100‑1 (MQ=255) cGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAata‑t < 1:1703182/100‑1 (MQ=255) ggagaggaaCGCGATAGCGTACGCCGCGAGCCGTGGGTGGGTATGTTCGCAGCAGGATATCGTTTTTGATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACgg < 2:2239815/93‑1 (MQ=255) cacaGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACggg < 1:784685/100‑1 (MQ=255) acaGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACgggg < 2:2054070/100‑1 (MQ=255) acaGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACggg < 1:389149/99‑1 (MQ=255) caGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGt > 2:523625/1‑100 (MQ=255) caGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGt < 1:1128457/100‑1 (MQ=255) caGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGt > 1:2245037/1‑100 (MQ=255) caGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGT‑ATATTACGGGGt > 1:303687/1‑100 (MQ=255) aGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTc < 1:1039255/100‑1 (MQ=255) gCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACgggg > 2:185143/1‑97 (MQ=255) gCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGT‑ATATTACGGGGTcg < 2:303685/100‑2 (MQ=255) gCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGT‑ATATTACGGGGTcg < 2:1838060/100‑2 (MQ=255) aaCACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGCACCCGTAATA‑TACGGGGTCAAt > 2:460272/1‑100 (MQ=255) aaCACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGT‑ATATTACGGGGTcgtt < 2:1495628/100‑4 (MQ=255) aaCACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGT‑ATATTACGGGGTcgtt < 1:772618/100‑4 (MQ=255) acGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAg < 1:830445/100‑1 (MQ=255) acGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAg > 2:1130107/1‑100 (MQ=255) acGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGATCAATAAg < 1:472348/100‑1 (MQ=255) cGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAgg > 1:1339949/1‑100 (MQ=255) cGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAgg < 2:1874243/100‑1 (MQ=255) cGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGT‑ATATTACGGGGTcgtttttg < 1:885607/100‑8 (MQ=38) cGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGAAGGATATCGTTTTTAATTCAGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGGAAATaa > 1:38381/1‑98 (MQ=255) gttagcccaCGCCTCGATCCCTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGa < 2:1613930/92‑1 (MQ=255) aTAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGT‑ATATTACGGGGTcgtttttgtg < 1:2360256/100‑10 (MQ=37) gCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATg < 2:18921/100‑1 (MQ=255) cGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATgg < 1:44725/100‑1 (MQ=255) gTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGt > 2:93845/1‑100 (MQ=255) tACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGta < 2:18384/100‑1 (MQ=255) gCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGAACAAAAACGACCACGTAATG‑TACGGGGTCAATAAGGAAATGGTATaa > 2:1943015/1‑100 (MQ=255) ccTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATaaa > 1:1668882/1‑100 (MQ=255) ccTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATaaa > 2:950564/1‑100 (MQ=255) ccTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATaaa > 1:2312858/1‑100 (MQ=255) ccTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATaaa > 2:1855218/1‑100 (MQ=255) cTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTAAATACCGCACAAAAACGATCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAg > 2:1294103/1‑100 (MQ=255) cGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGGTATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGtatta > 1:871416/1‑100 (MQ=255) cGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGtatta > 1:471991/1‑100 (MQ=255) cGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGtatta > 1:505923/1‑100 (MQ=255) cGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTACAAAGGGtatta > 1:2267788/1‑100 (MQ=255) gTGGGTGTTTATGTTCTCAGGAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGtat < 2:1954691/97‑1 (MQ=255) gggTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTAttt > 1:1834483/1‑100 (MQ=255) gggTGTGTATATTCTCAACAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCAGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATCGTAGAAAAGCtatt > 2:3667/1‑96 (MQ=255) ggTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATttc > 1:840766/1‑100 (MQ=255) gtTTATGGTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTAAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATttcttc < 1:1339926/100‑1 (MQ=255) tATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCt > 1:376717/1‑100 (MQ=255) tATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCt > 1:1853901/1‑100 (MQ=255) aTGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCtt < 2:1820282/100‑1 (MQ=255) tctcAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTAc < 1:1282892/100‑1 (MQ=255) ctcAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACg > 1:913641/1‑100 (MQ=255) cagcagGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGc > 1:2033714/1‑99 (MQ=255) cagcagGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAAAAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTAcccc > 2:868853/1‑100 (MQ=255) agcagGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCa > 1:1540741/1‑100 (MQ=255) agGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCa < 1:1107894/100‑1 (MQ=255) agGATACCCTTTTTAATGCCGCACACAGACGACCCCGTGACA‑TACGGGGTCCTTCAGGCCATGGTATAACGTGTCATATTTCCTCGCTTCTACGCCAt < 2:1797648/98‑1 (MQ=255) gATATCGTATTTAATGCCGGACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGGCATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCTCTTCTACGCCATCAGt < 2:2252851/100‑1 (MQ=255) atatCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGtt < 1:720826/100‑1 (MQ=255) tatCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGttt < 1:858618/100‑1 (MQ=255) tatCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGttt < 1:813136/100‑1 (MQ=255) atCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACAGGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTc > 1:2216782/1‑100 (MQ=255) tCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCa < 1:201361/100‑1 (MQ=255) cGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCag > 1:1067464/1‑100 (MQ=255) cGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCag > 1:1509314/1‑100 (MQ=255) gTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCaga > 1:1033648/1‑100 (MQ=255) tttttAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCagag < 1:657743/100‑1 (MQ=255) ttttAATTCAGAACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGc < 2:255919/100‑1 (MQ=255) tttAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCg < 2:1239332/100‑1 (MQ=255) tttAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGCGGTCACTAAGGACATGGCATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCg > 2:2120702/1‑100 (MQ=255) taatcacGCACAAAAACGACCCCGTCATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGa < 2:1885442/93‑1 (MQ=255) ccGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACTCCATCAGTTTCAGAGCGAATTaaa > 2:1254118/1‑100 (MQ=255) ccGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTaaa > 2:2148441/1‑100 (MQ=255) cGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTaaaa > 2:493334/1‑100 (MQ=255) cGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACACCATCAGTTTCAGAGCGAATTaaaa > 2:1878578/1‑100 (MQ=255) cacaAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAAt < 1:1278322/100‑1 (MQ=255) acaAAAACGACCCAGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAACAAATTAAAAAtt < 2:1699285/100‑1 (MQ=255) ttccgatctcccGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTtc < 1:746763/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGACCGCGTAATA‑TACGGGATCAATAAGGACAGGGTATAAAGTGTAGTATTTCTTCGCGTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTtc < 2:2310907/100‑1 (MQ=255) aaaaaCGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTtc < 2:826766/100‑1 (MQ=255) tattgACCCCGT‑ATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTtctc > 2:1364238/5‑100 (MQ=255) nattgACCCCGT‑ATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTtctc > 2:1747601/5‑100 (MQ=255) aaaCGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTtctc > 1:622159/1‑100 (MQ=255) aaaCGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTtct > 2:842648/1‑99 (MQ=255) attgACCCCGT‑ATATTACGGGGTCGAT‑AGGACATGGGATAAAGGGTATTATTTTTTCCGTTCTAAGCCATTCATTTCAAGGGGGATTTAAAAttt > 2:1691162/4‑95 (MQ=9) attgACCCCGT‑ATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCa > 2:2150270/4‑100 (MQ=255) gACCCCGT‑ATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAgtt > 2:187472/1‑100 (MQ=255) gACCCCGT‑ATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAgtt > 1:1283388/1‑100 (MQ=255) aCCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTCCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAgttg > 2:964392/1‑100 (MQ=255) aCCCCGT‑ATATTACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAgttg > 1:2296278/1‑100 (MQ=255) ccccGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAgttgt > 1:1695551/1‑100 (MQ=255) cccGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTtcagatcggaa > 2:746761/1‑91 (MQ=255) ccGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGTGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGttt > 2:1269088/1‑100 (MQ=255) tAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCg < 2:997815/100‑1 (MQ=255) aaTA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCgg < 2:1668869/100‑1 (MQ=255) aaTA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCgg > 1:2323279/1‑100 (MQ=255) | GGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAATA‑TACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGG > NC_000913/1314583‑1314780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |